205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1803 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1803  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 255 aa  523  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000258009 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2784  polysaccharide deacetylase  81.56 
 
 		 293 aa  429  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.863394  hitchhiker  0.00301468 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1438  polysaccharide deacetylase  71.37 
 
 		 278 aa  359  3e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776491 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1628  polysaccharide deacetylase  68.18 
 
 		 270 aa  351  5e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0331931  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3158  polysaccharide deacetylase  66.53 
 
 		 285 aa  344  6e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5006  polysaccharide deacetylase  66.24 
 
 		 272 aa  328  6e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1105  polysaccharide deacetylase  66.81 
 
 		 278 aa  324  9e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1185  polysaccharide deacetylase  66.38 
 
 		 279 aa  322  4e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.471915 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2080  putative polysaccharide deacetylase  64.29 
 
 		 271 aa  315  6e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2067  polysaccharide deacetylase  56.5 
 
 		 291 aa  285  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2063  polysaccharide deacetylase  56.25 
 
 		 283 aa  279  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1081  polysaccharide deacetylase  52.19 
 
 		 277 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1173  polysaccharide deacetylase  51.79 
 
 		 276 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741999  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1253  lipoprotein signal peptide  53.69 
 
 		 273 aa  267  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1259  polysaccharide deacetylase  51.29 
 
 		 259 aa  244  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226981  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  30.4 
 
 		 413 aa  72.8  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01940  predicted xylanase/chitin deacetylase  27.69 
 
 		 571 aa  72.4  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000016994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  27 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  28.45 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25.86 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  27.48 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  25.89 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  25.76 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  26.99 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  28.95 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 		 305 aa  65.5  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2122  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  27.95 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  23.81 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02423  acetylxylan esterase  28.57 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1836  polysaccharide deacetylase (nodulation protein NodB)  27.51 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0269701  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  27.19 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  25.33 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  24.35 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  26.96 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  21.88 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  25.45 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0540  polysaccharide deacetylase, putative  26.61 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 		 247 aa  62  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  26.07 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0404  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25.11 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0411  polysaccharide deacetylase  26.41 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0402  polysaccharide deacetylase  26.41 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0398  polysaccharide deacetylase  26.41 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0424  polysaccharide deacetylase  26.41 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  25.88 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4834  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25.97 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0489  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25.97 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0470  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  26.61 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0540  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25.97 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0217877  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  26.41 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04760  predicted xylanase/chitin deacetylase  26.72 
 
 		 573 aa  60.1  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000622168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  26.7 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  25.32 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  25.11 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  27.31 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  22.65 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0428  hypothetical protein  28.1 
 
 		 287 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249302  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1557  acetylxylan esterase  25.79 
 
 		 275 aa  58.5  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.956674  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2817  polysaccharide deacetylase  27.4 
 
 		 300 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  27.63 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  29.9 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1497  polysaccharide deacetylase  25.79 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.507826  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  26.87 
 
 		 387 aa  57  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  25.74 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  25.74 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  25.74 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  27.43 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  23.81 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  25.74 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  29.33 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  25.74 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  25.74 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  28.67 
 
 		 430 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  29.05 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  25.64 
 
 		 373 aa  55.8  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  23.59 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25.64 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  25.11 
 
 		 320 aa  54.7  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  24.68 
 
 		 368 aa  54.7  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  27.07 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  25.86 
 
 		 481 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  28.19 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6095  polysaccharide deacetylase  26.39 
 
 		 297 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233371  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2215  putative transmembrane protein  26.43 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  24.46 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0951  polysaccharide deacetylase  26.74 
 
 		 409 aa  54.3  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0651013  normal  0.44667 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  25.32 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  24.58 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  27.71 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  24.89 
 
 		 295 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  28.1 
 
 		 287 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  29.39 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  26.64 
 
 		 345 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  25.22 
 
 		 286 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0930  polysaccharide deacetylase  27.14 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0787  polysaccharide deacetylase family protein  25.71 
 
 		 349 aa  53.5  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29381  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07960  polysaccharide deacetylase  23.36 
 
 		 228 aa  52.8  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>