146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2080 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2080  putative polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 271 aa  545  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1438  polysaccharide deacetylase  67.08 
 
 		 278 aa  333  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776491 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1628  polysaccharide deacetylase  66.25 
 
 		 270 aa  331  6e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0331931  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2784  polysaccharide deacetylase  64.9 
 
 		 293 aa  323  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.863394  hitchhiker  0.00301468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5006  polysaccharide deacetylase  63.27 
 
 		 272 aa  318  5e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1803  polysaccharide deacetylase  64.08 
 
 		 255 aa  317  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000258009 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3158  polysaccharide deacetylase  61.07 
 
 		 285 aa  317  1e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1105  polysaccharide deacetylase  63.14 
 
 		 278 aa  315  4e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1185  polysaccharide deacetylase  66.52 
 
 		 279 aa  313  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.471915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1081  polysaccharide deacetylase  56.33 
 
 		 277 aa  289  4e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1173  polysaccharide deacetylase  56.33 
 
 		 276 aa  287  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741999  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1253  lipoprotein signal peptide  56.79 
 
 		 273 aa  285  8e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2063  polysaccharide deacetylase  54.4 
 
 		 283 aa  277  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2067  polysaccharide deacetylase  55.84 
 
 		 291 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1259  polysaccharide deacetylase  53.19 
 
 		 259 aa  262  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226981  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  27.59 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  27.82 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  28.51 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  30.32 
 
 		 413 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  27.78 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  27.04 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0411  polysaccharide deacetylase  26.81 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0402  polysaccharide deacetylase  26.81 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0398  polysaccharide deacetylase  26.81 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0424  polysaccharide deacetylase  26.81 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0404  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  26.38 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0540  polysaccharide deacetylase, putative  26.38 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0470  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  26.38 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0489  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  26.38 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4834  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  26.38 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01940  predicted xylanase/chitin deacetylase  27.16 
 
 		 571 aa  61.2  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000016994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  26.69 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0540  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  26.38 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0217877  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  24.45 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  28.37 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3817  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25.86 
 
 		 344 aa  58.9  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0327337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25.96 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  26.64 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2122  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  23.53 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  25.39 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1074  polysaccharide deacetylase  25.42 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0121745  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1836  polysaccharide deacetylase (nodulation protein NodB)  23.11 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0269701  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  26.03 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  24.89 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1557  acetylxylan esterase  26.98 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.956674  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1579  polysaccharide deacetylase  23.85 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  25.11 
 
 		 213 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  23.77 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  31.85 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1497  polysaccharide deacetylase  26.51 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.507826  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 272 aa  53.5  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  24.68 
 
 		 220 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  22.27 
 
 		 264 aa  52.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 289 aa  52.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  24.24 
 
 		 241 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  25.78 
 
 		 354 aa  52.8  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  24.24 
 
 		 213 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  24.24 
 
 		 213 aa  52.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  24.24 
 
 		 213 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  22.91 
 
 		 247 aa  52.4  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  24.24 
 
 		 241 aa  52  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3369  polysaccharide deacetylase  26.42 
 
 		 259 aa  52  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  24.44 
 
 		 240 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  26.36 
 
 		 520 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  25 
 
 		 241 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  24.09 
 
 		 405 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  24.12 
 
 		 221 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  24.24 
 
 		 241 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  24.09 
 
 		 258 aa  49.7  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6095  polysaccharide deacetylase  29.44 
 
 		 297 aa  49.3  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233371  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  23.38 
 
 		 368 aa  49.3  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  25.81 
 
 		 227 aa  49.3  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  29.53 
 
 		 204 aa  48.9  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0899  hypothetical protein  26.19 
 
 		 431 aa  48.9  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  22.22 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  25.86 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  23.38 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2175  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  24.44 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  22.95 
 
 		 244 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  24.35 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  27.96 
 
 		 267 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  24.35 
 
 		 683 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3850  polysaccharide deacetylase  24.89 
 
 		 255 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0144  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  28.51 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00172673  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01375  polysaccharide deacetylase  24.34 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2151  polysaccharide deacetylase  28.9 
 
 		 294 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342073  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2765  polysaccharide deacetylase  28.9 
 
 		 294 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468013  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  23.66 
 
 		 263 aa  47.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  27.06 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  23.38 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3341  polysaccharide deacetylase  28.08 
 
 		 256 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  23.32 
 
 		 404 aa  46.6  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  26.59 
 
 		 465 aa  47  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  20.26 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  22.87 
 
 		 372 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0564  polysaccharide deacetylase  24.77 
 
 		 424 aa  46.6  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0147  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  28.95 
 
 		 251 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3798  polysaccharide deacetylase  23.9 
 
 		 255 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0428  hypothetical protein  28.1 
 
 		 287 aa  46.2  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249302  normal  0.885456 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>