145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2067 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2067  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 291 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2063  polysaccharide deacetylase  79.2 
 
 		 283 aa  407  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1253  lipoprotein signal peptide  69.69 
 
 		 273 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1081  polysaccharide deacetylase  71.73 
 
 		 277 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1173  polysaccharide deacetylase  71.85 
 
 		 276 aa  359  4e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1803  polysaccharide deacetylase  58.8 
 
 		 255 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000258009 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5006  polysaccharide deacetylase  53.03 
 
 		 272 aa  280  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2784  polysaccharide deacetylase  48.56 
 
 		 293 aa  275  5e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.863394  hitchhiker  0.00301468 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2080  putative polysaccharide deacetylase  55.84 
 
 		 271 aa  275  6e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1438  polysaccharide deacetylase  52.21 
 
 		 278 aa  275  9e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776491 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1259  polysaccharide deacetylase  51.37 
 
 		 259 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226981  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1628  polysaccharide deacetylase  50.84 
 
 		 270 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0331931  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1105  polysaccharide deacetylase  50 
 
 		 278 aa  263  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1185  polysaccharide deacetylase  50 
 
 		 279 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.471915 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3158  polysaccharide deacetylase  52.59 
 
 		 285 aa  252  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  23.9 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  25.79 
 
 		 413 aa  66.2  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  23.85 
 
 		 251 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  24.03 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  25.9 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3817  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  23.91 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0327337  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  22.08 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  22.08 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  22.47 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  22.08 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  25.36 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  25.89 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  22.08 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  24.78 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  23.21 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3369  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  21.21 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  21.21 
 
 		 244 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01940  predicted xylanase/chitin deacetylase  23.95 
 
 		 571 aa  54.7  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000016994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0489  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  24.4 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  21.21 
 
 		 220 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0540  polysaccharide deacetylase, putative  24.31 
 
 		 260 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0411  polysaccharide deacetylase  24.31 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0402  polysaccharide deacetylase  24.31 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0398  polysaccharide deacetylase  24.31 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0424  polysaccharide deacetylase  24.31 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0540  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  24.31 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0217877  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4834  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  24.31 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0470  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  24.31 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2122  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  21.12 
 
 		 265 aa  53.5  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1557  acetylxylan esterase  26.67 
 
 		 275 aa  53.5  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.956674  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3126  polysaccharide deacetylase  22.31 
 
 		 276 aa  53.1  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000165534  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1074  polysaccharide deacetylase  22.08 
 
 		 320 aa  53.1  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0121745  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  26.42 
 
 		 430 aa  53.1  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0538  polysaccharide deacetylase  25.32 
 
 		 323 aa  53.1  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0863369  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1497  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 		 275 aa  53.1  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.507826  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  24.24 
 
 		 292 aa  53.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1836  polysaccharide deacetylase (nodulation protein NodB)  20.69 
 
 		 265 aa  52.4  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0269701  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1411  polysaccharide deacetylase  29.01 
 
 		 375 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1438  polysaccharide deacetylase  29.01 
 
 		 375 aa  52.4  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2943  polysaccharide deacetylase  29.01 
 
 		 375 aa  52.4  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.567771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  23.86 
 
 		 256 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  25.66 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  23.98 
 
 		 906 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  20.7 
 
 		 241 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  23.14 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  20.78 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl558  putative chitin deacetylase  20.87 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  26.09 
 
 		 404 aa  51.2  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0147  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  24.02 
 
 		 251 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  24.68 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  22.58 
 
 		 259 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  24.66 
 
 		 227 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0341  polysaccharide deacetylase  24.9 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1402  polysaccharide deacetylase  28.4 
 
 		 375 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  23.28 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  22.07 
 
 		 243 aa  50.1  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  22.84 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  22.41 
 
 		 372 aa  50.1  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  23.98 
 
 		 324 aa  49.7  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  20.38 
 
 		 241 aa  49.7  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0571  polysaccharide deacetylase  22.94 
 
 		 309 aa  49.7  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  21.65 
 
 		 251 aa  49.7  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01375  polysaccharide deacetylase  21.74 
 
 		 218 aa  49.7  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  22.13 
 
 		 354 aa  49.3  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  24.8 
 
 		 413 aa  49.3  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  26.22 
 
 		 280 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  22.17 
 
 		 382 aa  49.3  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  25.93 
 
 		 345 aa  48.9  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  22.47 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0404  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  23.2 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0930  polysaccharide deacetylase  26.05 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0787  polysaccharide deacetylase family protein  26.07 
 
 		 349 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29381  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  21.4 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  21.83 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  23.89 
 
 		 240 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0810  polysaccharide deacetylase family protein  20.68 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00210366  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07960  polysaccharide deacetylase  19.43 
 
 		 228 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  23.08 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  22.57 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  26.38 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  23.83 
 
 		 417 aa  47  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  22.66 
 
 		 264 aa  46.6  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1963  polysaccharide deacetylase  25.58 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0950  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 331 aa  47  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.942837  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>