131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1081 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1081  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 277 aa  567  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1173  polysaccharide deacetylase  92.42 
 
 		 276 aa  504  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741999  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1253  lipoprotein signal peptide  86.72 
 
 		 273 aa  475  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2067  polysaccharide deacetylase  71.73 
 
 		 291 aa  360  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2063  polysaccharide deacetylase  70.51 
 
 		 283 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1438  polysaccharide deacetylase  53.79 
 
 		 278 aa  290  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776491 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2784  polysaccharide deacetylase  52.38 
 
 		 293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.863394  hitchhiker  0.00301468 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2080  putative polysaccharide deacetylase  57.26 
 
 		 271 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1628  polysaccharide deacetylase  53.56 
 
 		 270 aa  278  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0331931  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1803  polysaccharide deacetylase  52.19 
 
 		 255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000258009 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1259  polysaccharide deacetylase  51.41 
 
 		 259 aa  272  5.000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226981  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5006  polysaccharide deacetylase  52.11 
 
 		 272 aa  269  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1105  polysaccharide deacetylase  50.2 
 
 		 278 aa  263  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1185  polysaccharide deacetylase  49.8 
 
 		 279 aa  258  6e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.471915 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3158  polysaccharide deacetylase  50.84 
 
 		 285 aa  250  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  24.89 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  24.77 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  25.45 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2122  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  23.01 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1836  polysaccharide deacetylase (nodulation protein NodB)  22.57 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0269701  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  27.95 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  22.87 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0540  polysaccharide deacetylase, putative  27.05 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0411  polysaccharide deacetylase  27.12 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0402  polysaccharide deacetylase  27.12 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0398  polysaccharide deacetylase  27.12 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0424  polysaccharide deacetylase  27.12 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3817  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  24.43 
 
 		 344 aa  55.8  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0327337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0540  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  27.05 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0217877  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0489  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  27.12 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0470  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  27.12 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4834  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  27.05 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  25.89 
 
 		 345 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2699  polysaccharide deacetylase  24.49 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000565788  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0404  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  26.69 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0426  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  25.11 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  26.14 
 
 		 404 aa  53.9  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01940  predicted xylanase/chitin deacetylase  25.44 
 
 		 571 aa  53.9  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000016994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  24.56 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  23.68 
 
 		 277 aa  53.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  21.98 
 
 		 213 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  21.98 
 
 		 213 aa  52.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  21.98 
 
 		 213 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  25.83 
 
 		 430 aa  52.4  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  25.45 
 
 		 275 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  21.98 
 
 		 241 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1579  polysaccharide deacetylase  25.1 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1074  polysaccharide deacetylase  25.62 
 
 		 320 aa  51.6  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0121745  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1557  acetylxylan esterase  25.62 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.956674  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1497  polysaccharide deacetylase  25.62 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.507826  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04760  predicted xylanase/chitin deacetylase  25.64 
 
 		 573 aa  52  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000622168  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  21.98 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  24.35 
 
 		 413 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3369  polysaccharide deacetylase  25.4 
 
 		 259 aa  50.8  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  21.55 
 
 		 220 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  20.61 
 
 		 241 aa  50.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  25.23 
 
 		 275 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0538  polysaccharide deacetylase  23.43 
 
 		 323 aa  49.7  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0863369  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0950  polysaccharide deacetylase  28.89 
 
 		 331 aa  49.7  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.942837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1411  polysaccharide deacetylase  31.37 
 
 		 375 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1438  polysaccharide deacetylase  31.37 
 
 		 375 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2943  polysaccharide deacetylase  31.37 
 
 		 375 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.567771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  21.28 
 
 		 241 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  21.83 
 
 		 302 aa  48.9  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  24.41 
 
 		 292 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  24.32 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  23.93 
 
 		 273 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24870  predicted xylanase/chitin deacetylase  30.77 
 
 		 503 aa  47.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  24.77 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  23.18 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0571  polysaccharide deacetylase  23.93 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl558  putative chitin deacetylase  21.59 
 
 		 247 aa  47.4  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  26.34 
 
 		 280 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1402  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 		 375 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0564  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 424 aa  47  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  25.13 
 
 		 240 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0810  polysaccharide deacetylase family protein  21.46 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00210366  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  20.91 
 
 		 321 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6465  polysaccharide deacetylase  23.83 
 
 		 219 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  22.77 
 
 		 320 aa  47  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  19.83 
 
 		 217 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  26.4 
 
 		 219 aa  47  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  19.83 
 
 		 244 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  24.32 
 
 		 275 aa  45.8  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  24.32 
 
 		 276 aa  46.2  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  24.32 
 
 		 275 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  24.32 
 
 		 275 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  24.32 
 
 		 275 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  25.2 
 
 		 465 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  22.88 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  24.34 
 
 		 372 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0930  polysaccharide deacetylase  26.17 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0787  polysaccharide deacetylase family protein  26.17 
 
 		 349 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4727  polysaccharide deacetylase  25.95 
 
 		 357 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000111297  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0147  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  22.32 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  21.83 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0823  polysaccharide deacetylase family protein  21.43 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000472378  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  22.03 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>