102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0597 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0597  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  492  9.999999999999999e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0696516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0596  OmpA/MotB  38.55 
 
 		 218 aa  108  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0593413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0595  OmpA/MotB  34.59 
 
 		 194 aa  99  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.708242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  35.76 
 
 		 394 aa  93.2  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  33.94 
 
 		 392 aa  88.2  9e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1967  OmpA/MotB domain-containing protein  34.39 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  31.9 
 
 		 403 aa  86.7  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0594  OmpA/MotB  31.96 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  31.71 
 
 		 428 aa  72.8  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  32.45 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  34.48 
 
 		 344 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  33.58 
 
 		 344 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  32.12 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  32.12 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  32.12 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  30.71 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  30.71 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  32.14 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  33.06 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  28.76 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  29.78 
 
 		 447 aa  62.4  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  28.1 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  29.71 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  30.22 
 
 		 417 aa  59.3  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  27.62 
 
 		 381 aa  58.5  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  34.48 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  32.81 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  37.29 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  60.53 
 
 		 420 aa  56.2  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  30.22 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  30.33 
 
 		 352 aa  55.1  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  38.81 
 
 		 402 aa  55.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  31.71 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  65.62 
 
 		 440 aa  54.7  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  60.53 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  32.8 
 
 		 337 aa  53.9  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  29.69 
 
 		 367 aa  53.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  33.58 
 
 		 319 aa  53.5  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  30.47 
 
 		 362 aa  53.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  33.33 
 
 		 375 aa  52.8  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 375 aa  53.1  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  29.13 
 
 		 365 aa  52.8  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  29.32 
 
 		 376 aa  52.4  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  31.2 
 
 		 337 aa  52  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  28.92 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  33.06 
 
 		 377 aa  51.2  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003405  outer membrane protein  24.43 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1657  opacity protein/surface antigen  41.54 
 
 		 290 aa  50.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.92077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  26.35 
 
 		 366 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  31.54 
 
 		 366 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  28.83 
 
 		 202 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3103  outer membrane protein MopB  31.25 
 
 		 348 aa  49.7  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.00000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  30.53 
 
 		 373 aa  49.7  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  32.64 
 
 		 372 aa  49.3  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  33.61 
 
 		 367 aa  49.3  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0260064  normal  0.0786224 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02380  hypothetical protein  26.51 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01404  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  28.87 
 
 		 218 aa  48.9  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  28.68 
 
 		 264 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  29.13 
 
 		 365 aa  48.5  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  27.61 
 
 		 202 aa  48.5  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  30.99 
 
 		 333 aa  48.5  0.00009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  60 
 
 		 445 aa  48.5  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  58.06 
 
 		 1707 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  33.85 
 
 		 372 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  26.4 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02373  hypothetical protein  26.39 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  26.4 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  38.75 
 
 		 345 aa  47.4  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  58.06 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  29.01 
 
 		 369 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  29.01 
 
 		 369 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  28.47 
 
 		 369 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  30.95 
 
 		 376 aa  46.6  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  30 
 
 		 370 aa  46.2  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  28.47 
 
 		 363 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  58.06 
 
 		 1918 aa  46.2  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  30.77 
 
 		 373 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4008  OmpA/MotB domain-containing protein  27.61 
 
 		 202 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4102  OmpA/MotB domain-containing protein  27.61 
 
 		 202 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 		 322 aa  45.4  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  29.37 
 
 		 375 aa  45.4  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1344  OmpA/MotB domain-containing protein  31.25 
 
 		 190 aa  45.4  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00124071  hitchhiker  0.0000223206 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  27.33 
 
 		 185 aa  45.4  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  27.61 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  54.84 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003402  outer membrane protein  25.15 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000500846  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  28.93 
 
 		 918 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2804  OmpA/MotB domain-containing protein  26.18 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1139  OmpA/MotB domain-containing protein  41.94 
 
 		 198 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.528624  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  30.3 
 
 		 543 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  53.12 
 
 		 445 aa  43.9  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  39.58 
 
 		 314 aa  43.1  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.3 
 
 		 542 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  29.92 
 
 		 368 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  54.29 
 
 		 457 aa  42.7  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  64.29 
 
 		 335 aa  42.4  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4143  OmpA/MotB domain-containing protein  27.61 
 
 		 201 aa  42.4  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00334816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6462  OmpA/MotB domain protein  26.26 
 
 		 342 aa  42.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  56.67 
 
 		 240 aa  42  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>