More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0594 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0594  OmpA/MotB  100 
 
 
232 aa  486  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  41.67 
 
 
392 aa  126  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0596  OmpA/MotB  36.23 
 
 
218 aa  122  5e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0593413  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  37.11 
 
 
403 aa  122  6e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  40.48 
 
 
394 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1967  OmpA/MotB domain-containing protein  38.24 
 
 
213 aa  112  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  37.43 
 
 
333 aa  100  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  32.28 
 
 
345 aa  99.8  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0595  OmpA/MotB  32 
 
 
194 aa  98.2  9e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.708242  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  37.82 
 
 
337 aa  97.4  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  33.14 
 
 
209 aa  96.3  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  35.44 
 
 
337 aa  94.7  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  34.62 
 
 
335 aa  89.4  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  33.13 
 
 
445 aa  88.2  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  30.48 
 
 
380 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  28.31 
 
 
344 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0597  hypothetical protein  31.96 
 
 
237 aa  81.6  0.000000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0696516  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  30.48 
 
 
420 aa  80.9  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  30.6 
 
 
417 aa  80.1  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  27.91 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  27.71 
 
 
344 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  30.6 
 
 
401 aa  78.6  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  28.48 
 
 
344 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  28.48 
 
 
344 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  28.48 
 
 
344 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  32.26 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  30.05 
 
 
428 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  31.79 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  31.21 
 
 
388 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  25.13 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  27.95 
 
 
344 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  25.13 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  28.4 
 
 
352 aa  75.9  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  29.48 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  28.3 
 
 
427 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  31.51 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0018  outer membrane protein OmpA family  29.02 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  26.02 
 
 
447 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  28.93 
 
 
429 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  26.32 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  27.54 
 
 
544 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6462  OmpA/MotB domain protein  25 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  26.95 
 
 
543 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  29.75 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  32.08 
 
 
510 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  30 
 
 
367 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  26.95 
 
 
542 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  28.82 
 
 
440 aa  65.9  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  29.75 
 
 
375 aa  65.5  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  30.3 
 
 
458 aa  65.1  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003402  outer membrane protein  23.19 
 
 
204 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000500846  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  30.97 
 
 
296 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  27.81 
 
 
365 aa  63.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  29.94 
 
 
367 aa  62.8  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  25.77 
 
 
1264 aa  62.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  28.57 
 
 
478 aa  62.8  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  27.65 
 
 
374 aa  62.4  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  29.2 
 
 
505 aa  62  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  27.59 
 
 
449 aa  62  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  26.29 
 
 
498 aa  62  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  25.47 
 
 
369 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  26.71 
 
 
373 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  25.47 
 
 
369 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  29.56 
 
 
201 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  24.22 
 
 
402 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  30.86 
 
 
386 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0364  OmpA/MotB domain-containing protein  26.34 
 
 
201 aa  60.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  26 
 
 
328 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  26.09 
 
 
372 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  27.04 
 
 
376 aa  60.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  30.86 
 
 
386 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.25 
 
 
412 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  27.43 
 
 
445 aa  60.1  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  28.3 
 
 
377 aa  59.7  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  27.17 
 
 
320 aa  59.7  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  25.47 
 
 
372 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02380  hypothetical protein  25.3 
 
 
204 aa  59.3  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  26.75 
 
 
366 aa  59.3  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2466  OmpA family protein  26.17 
 
 
187 aa  58.5  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.352028  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  26.42 
 
 
623 aa  58.9  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  25.6 
 
 
237 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  26.7 
 
 
306 aa  58.5  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  25.46 
 
 
506 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  26.09 
 
 
370 aa  58.5  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  25.88 
 
 
264 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  28.48 
 
 
367 aa  57.8  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  24.12 
 
 
240 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  30.06 
 
 
1987 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  27.19 
 
 
434 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  26.75 
 
 
363 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  30.09 
 
 
432 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  30.09 
 
 
656 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  24.59 
 
 
537 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1229  putative outer membrane protein  23.6 
 
 
212 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000815007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  29.66 
 
 
658 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  26.01 
 
 
244 aa  57  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  30.25 
 
 
704 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  25.9 
 
 
201 aa  56.6  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  28.81 
 
 
525 aa  56.6  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4008  OmpA/MotB domain-containing protein  26.09 
 
 
202 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>