More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0596 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0596  OmpA/MotB  100 
 
 
218 aa  450  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0593413  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  41.24 
 
 
392 aa  145  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0595  OmpA/MotB  40 
 
 
194 aa  145  6e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.708242  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  43.09 
 
 
394 aa  141  8e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1967  OmpA/MotB domain-containing protein  44.1 
 
 
213 aa  125  7e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  42.42 
 
 
403 aa  122  5e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0594  OmpA/MotB  36.23 
 
 
232 aa  122  5e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0597  hypothetical protein  38.55 
 
 
237 aa  108  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0696516  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  34.48 
 
 
209 aa  86.7  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  37.16 
 
 
319 aa  85.1  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  29.68 
 
 
350 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  29.68 
 
 
350 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  31.01 
 
 
344 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  39.04 
 
 
447 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  30.38 
 
 
344 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  31.18 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  30.23 
 
 
428 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  29.11 
 
 
345 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  35.57 
 
 
429 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  31.93 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  35.37 
 
 
417 aa  79.3  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  30.61 
 
 
201 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  33.92 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0018  outer membrane protein OmpA family  30.77 
 
 
201 aa  77  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  32.69 
 
 
380 aa  77  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  30.61 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4008  OmpA/MotB domain-containing protein  29.59 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  30.61 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4102  OmpA/MotB domain-containing protein  29.59 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  29.15 
 
 
420 aa  75.5  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  31.72 
 
 
427 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  29.66 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  32.89 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  28.86 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
445 aa  73.2  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  29.66 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  34.21 
 
 
375 aa  72.4  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  28.06 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  29.05 
 
 
344 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  28.06 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  30.34 
 
 
352 aa  72  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  26.32 
 
 
351 aa  72  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  32.65 
 
 
401 aa  71.6  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  29.13 
 
 
440 aa  71.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  36.24 
 
 
320 aa  68.6  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  34.21 
 
 
487 aa  68.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  30.26 
 
 
185 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  29.08 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  29.14 
 
 
377 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  28.03 
 
 
237 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  32.65 
 
 
337 aa  65.1  0.0000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  31.13 
 
 
372 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  30.19 
 
 
264 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02373  hypothetical protein  30.61 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  29.56 
 
 
239 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4143  OmpA/MotB domain-containing protein  26.21 
 
 
201 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00334816  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  31.54 
 
 
543 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  37.25 
 
 
694 aa  64.3  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  34.19 
 
 
727 aa  64.3  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  32.1 
 
 
200 aa  64.7  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  31.65 
 
 
458 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  25.95 
 
 
365 aa  63.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  30.46 
 
 
372 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  31.33 
 
 
337 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  28.3 
 
 
240 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  28.57 
 
 
381 aa  63.5  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0380  OmpA/MotB  30.34 
 
 
201 aa  63.2  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  29.14 
 
 
368 aa  63.2  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3400  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.12 
 
 
172 aa  62.8  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.374002 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  31.54 
 
 
544 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  30.77 
 
 
366 aa  62.8  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  29.56 
 
 
239 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  28.95 
 
 
373 aa  62  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  27.63 
 
 
376 aa  62  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003405  outer membrane protein  28.11 
 
 
204 aa  61.6  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  31.15 
 
 
459 aa  61.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.87 
 
 
542 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  29.73 
 
 
449 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0364  OmpA/MotB domain-containing protein  26.92 
 
 
201 aa  60.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  26.67 
 
 
402 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  29.19 
 
 
388 aa  60.1  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  27.78 
 
 
201 aa  60.5  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  27.38 
 
 
368 aa  60.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  31.13 
 
 
456 aa  60.1  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  34.65 
 
 
215 aa  59.7  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  29.14 
 
 
373 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  34.31 
 
 
525 aa  59.7  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  30.46 
 
 
366 aa  59.3  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  27.78 
 
 
244 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  42.05 
 
 
704 aa  59.3  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  36.27 
 
 
333 aa  58.9  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  35.64 
 
 
320 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  30.26 
 
 
369 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  30.26 
 
 
369 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0309  OmpA/MotB domain-containing protein  27.54 
 
 
201 aa  58.9  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.350463  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  35.78 
 
 
222 aa  58.5  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  30.23 
 
 
637 aa  58.5  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  30.33 
 
 
459 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  29.8 
 
 
369 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  40.2 
 
 
517 aa  57.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>