More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0449 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0449  ABC transporter related  100 
 
 		 242 aa  480  1e-135  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1521  ABC transporter related  80.17 
 
 		 242 aa  374  1e-103  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000012745  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0845  ABC transporter related  80.83 
 
 		 241 aa  370  1e-102  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.791281 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0546  ABC transporter related  78.51 
 
 		 242 aa  363  1e-99  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0891266  hitchhiker  0.0003203 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  47.43 
 
 		 264 aa  221  7e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  46.25 
 
 		 265 aa  218  8.999999999999998e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2299  ABC transporter related  45.42 
 
 		 242 aa  208  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1101  ABC transporter related  48.75 
 
 		 255 aa  207  9e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00497633  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2129  ABC transporter related  49.17 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.206631 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1540  ABC transporter related  44.58 
 
 		 242 aa  206  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  44.66 
 
 		 259 aa  205  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1806  ABC transporter related  46.69 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.944964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0144  ABC transporter related  43.98 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3617  ABC transporter related  47.03 
 
 		 244 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.509048  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0511  ABC transporter related  43.1 
 
 		 238 aa  202  5e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0526817  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0315  ABC transporter related  45.04 
 
 		 246 aa  201  6e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1951  ABC transporter related  46.61 
 
 		 244 aa  201  9e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2333  ABC transporter related protein  47.28 
 
 		 243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.552467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1709  ABC transporter related  44.77 
 
 		 245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.995593  normal  0.0343274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2887  ABC transporter ATP-binding protein  45.89 
 
 		 239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  41.43 
 
 		 256 aa  199  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1850  ABC transporter related  45.76 
 
 		 244 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1499  ABC transporter related  46.25 
 
 		 244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.229827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2364  ABC transporter related  43.57 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3648  ABC transporter related  46.03 
 
 		 244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  41.8 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0360  ABC transporter related  49.37 
 
 		 243 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2143  ABC transporter related  44.03 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6134  ABC transporter related  43.7 
 
 		 239 aa  195  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204704  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  45.71 
 
 		 252 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2202  ABC transporter related  44.92 
 
 		 235 aa  194  9e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5639  ABC transporter related  45.42 
 
 		 253 aa  194  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2008  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.51 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.366522  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0800  ABC transporter related  46.22 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1662  ABC transporter related  45.76 
 
 		 243 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1098  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.98 
 
 		 241 aa  192  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.559592  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0598  ABC transporter related  42.57 
 
 		 253 aa  192  4e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1502  ABC transporter related  45.27 
 
 		 247 aa  192  5e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.202973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1598  ABC transporter related protein  44.62 
 
 		 260 aa  191  8e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  40.08 
 
 		 255 aa  189  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  39.68 
 
 		 255 aa  189  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  42.23 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  41.27 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0330  ABC transporter related  43.21 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.813664 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1678  ABC transporter-like protein  45.61 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.939026  normal  0.0800845 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  39.33 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  42.5 
 
 		 245 aa  188  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2586  ABC transporter related  42.68 
 
 		 237 aa  188  5e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.64 
 
 		 248 aa  188  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  40.32 
 
 		 255 aa  188  7e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1907  ABC transporter related  43.64 
 
 		 253 aa  188  8e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 		 256 aa  187  9e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  42.63 
 
 		 256 aa  187  9e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0795  ABC transporter related  44.07 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.213138  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2029  ABC transporter related  44.27 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1975  ABC transporter related  41.15 
 
 		 247 aa  186  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.5 
 
 		 256 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2282  ABC transporter related  42.32 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  44.49 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  41.34 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  41.83 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  40.48 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  40.94 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  45.04 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  42.74 
 
 		 241 aa  185  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  40.64 
 
 		 259 aa  185  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3397  ABC transporter related  41.42 
 
 		 249 aa  185  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0271922 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  39.92 
 
 		 280 aa  184  9e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0898  ABC transporter related  41 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  39.68 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  38.89 
 
 		 270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  40.87 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  42.28 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  39.68 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0824  ABC transporter related  41.8 
 
 		 247 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  41.87 
 
 		 256 aa  181  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  41.87 
 
 		 256 aa  181  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2849  ABC transporter related protein  40.24 
 
 		 247 aa  181  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485647  normal  0.511604 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1196  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 		 244 aa  181  8.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1930  ABC transporter related  44.3 
 
 		 247 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  41.94 
 
 		 268 aa  181  9.000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  39.11 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  37.7 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  37.7 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1697  ABC transporter related  42.21 
 
 		 593 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777579  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  39.44 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0463  ABC transporter related protein  38.1 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  42.63 
 
 		 589 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0677  ABC transporter related  39.92 
 
 		 260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.888321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4552  ABC transporter related  40.32 
 
 		 260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0311  ABC transporter related  40.17 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.382743  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  40.47 
 
 		 261 aa  179  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0519  ABC transporter related  38.1 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  45.06 
 
 		 608 aa  179  4e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  39.53 
 
 		 261 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2427  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  41 
 
 		 239 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  40.49 
 
 		 252 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3338  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  38.89 
 
 		 251 aa  178  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>