More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0144 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0144  ABC transporter related  100 
 
 		 249 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2143  ABC transporter related  51.01 
 
 		 257 aa  244  6.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5639  ABC transporter related  51.6 
 
 		 253 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1540  ABC transporter related  47.52 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2299  ABC transporter related  48.33 
 
 		 242 aa  234  8e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3648  ABC transporter related  49.17 
 
 		 244 aa  228  9e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  48.15 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1098  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 241 aa  221  8e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.559592  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2333  ABC transporter related protein  47.03 
 
 		 243 aa  218  5e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.552467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0850  ATPase  45.8 
 
 		 242 aa  219  5e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0800  ABC transporter related  47.26 
 
 		 253 aa  218  8.999999999999998e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.5 
 
 		 248 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1137  ABC transporter related  48.1 
 
 		 239 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.195731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0795  ABC transporter related  49.6 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.213138  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1196  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1827  ABC transporter related  45.64 
 
 		 242 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.017401  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1599  ABC transporter related  47.26 
 
 		 239 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86219  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1452  ABC transporter related  47.26 
 
 		 239 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2008  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.86 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.366522  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0360  ABC transporter related  49.37 
 
 		 243 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1951  ABC transporter related  44.44 
 
 		 244 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3617  ABC transporter related  44.35 
 
 		 244 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.509048  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  44.77 
 
 		 240 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  43.44 
 
 		 603 aa  209  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1662  ABC transporter related  42.15 
 
 		 243 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0845  ABC transporter related  47.5 
 
 		 241 aa  209  5e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.791281 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1850  ABC transporter related  43.1 
 
 		 244 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  47.58 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1499  ABC transporter related  44.54 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.229827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1930  ABC transporter related  46.06 
 
 		 247 aa  206  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2887  ABC transporter ATP-binding protein  41.6 
 
 		 239 aa  205  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  41.25 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2427  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  45.99 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3397  ABC transporter related  43.09 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0271922 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1521  ABC transporter related  47.92 
 
 		 242 aa  204  1e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000012745  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  45.56 
 
 		 283 aa  202  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  43.62 
 
 		 609 aa  202  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  45.97 
 
 		 293 aa  202  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  43.72 
 
 		 258 aa  202  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1531  ABC transporter related  45.57 
 
 		 239 aa  201  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1436  ABC transporter-related protein  45.57 
 
 		 239 aa  201  8e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  45.16 
 
 		 275 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  42 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  45.16 
 
 		 275 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  42.34 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  45.16 
 
 		 275 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  42.91 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  42.91 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  42.91 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  43.2 
 
 		 265 aa  199  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  42.91 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0311  ABC transporter related  43.04 
 
 		 237 aa  199  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.382743  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0511  ABC transporter related  44.54 
 
 		 238 aa  198  6e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0526817  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.51 
 
 		 258 aa  198  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1907  ABC transporter related  45.34 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  45.16 
 
 		 333 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  42.51 
 
 		 258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  43.2 
 
 		 264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1709  ABC transporter related  39.08 
 
 		 245 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.995593  normal  0.0343274 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  41.53 
 
 		 258 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  40.8 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0985  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.29 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000122559  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1145  leucine/isoleucine/valine transport system ATP-binding protein  42.29 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00253052  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0991  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.29 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0787  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.29 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.29 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.29 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  45.38 
 
 		 608 aa  194  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0265  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.29 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000223083  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1653  ABC transporter related protein  44.76 
 
 		 610 aa  193  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487091  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  41.83 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  43.08 
 
 		 271 aa  193  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0824  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.7 
 
 		 257 aa  192  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  43.15 
 
 		 271 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3142  ABC transporter related  41.3 
 
 		 257 aa  192  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6114  ABC transporter related  41.7 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  44.58 
 
 		 280 aa  192  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0330  ABC transporter related  42.56 
 
 		 245 aa  192  5e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.813664 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2413  ABC transporter related  41.7 
 
 		 258 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0344655 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2542  ABC transporter related  41.7 
 
 		 258 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812662  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.78 
 
 		 254 aa  191  8e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1565  ABC transporter related  41.06 
 
 		 246 aa  191  8e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0546  ABC transporter related  44.58 
 
 		 242 aa  191  1e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0891266  hitchhiker  0.0003203 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  42.34 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  41.6 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2168  ABC transporter related  43.95 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  42.17 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0449  ABC transporter related  43.98 
 
 		 242 aa  189  4e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0262  ABC transporter related  40.71 
 
 		 254 aa  189  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0898  ABC transporter related  40.17 
 
 		 245 aa  189  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  41.53 
 
 		 258 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  41.53 
 
 		 258 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  40 
 
 		 256 aa  188  5.999999999999999e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  39.2 
 
 		 250 aa  188  7e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6134  ABC transporter related  41.35 
 
 		 239 aa  188  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204704  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  38.15 
 
 		 250 aa  188  9e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1727  ABC transporter related  42.17 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  41.37 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0565  ABC transporter related  40.64 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0274891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  40.4 
 
 		 265 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>