More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1137 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1137  ABC transporter related  100 
 
 		 239 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.195731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1599  ABC transporter related  91.21 
 
 		 239 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86219  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  46.67 
 
 		 240 aa  223  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2008  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.28 
 
 		 239 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.366522  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5639  ABC transporter related  48.52 
 
 		 253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0144  ABC transporter related  48.1 
 
 		 249 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1436  ABC transporter-related protein  46.86 
 
 		 239 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1531  ABC transporter related  46.86 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2427  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  46.03 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  46.38 
 
 		 241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0864  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.06 
 
 		 241 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303052  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1452  ABC transporter related  46.03 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0311  ABC transporter related  43.46 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.382743  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1930  ABC transporter related  45.92 
 
 		 247 aa  202  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2143  ABC transporter related  45 
 
 		 257 aa  201  7e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  41.5 
 
 		 271 aa  201  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0795  ABC transporter related  44.44 
 
 		 253 aa  200  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.213138  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0360  ABC transporter related  47.03 
 
 		 243 aa  201  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4421  ABC transporter related  43.55 
 
 		 259 aa  200  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11811  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1565  ABC transporter related  43.35 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1499  ABC transporter related  44.68 
 
 		 244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.229827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3617  ABC transporter related  43.64 
 
 		 244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.509048  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1540  ABC transporter related  46.38 
 
 		 242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1907  ABC transporter related  44.26 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1951  ABC transporter related  44.26 
 
 		 244 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1662  ABC transporter related  43.4 
 
 		 243 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.74 
 
 		 248 aa  198  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0850  ATPase  43.78 
 
 		 242 aa  198  7e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1850  ABC transporter related  43.64 
 
 		 244 aa  197  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1827  ABC transporter related  43.7 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.017401  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2299  ABC transporter related  45.15 
 
 		 242 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1098  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.8 
 
 		 241 aa  195  5.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.559592  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  41.77 
 
 		 256 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0800  ABC transporter related  44.07 
 
 		 253 aa  194  9e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1196  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.8 
 
 		 244 aa  191  6e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2887  ABC transporter ATP-binding protein  41.45 
 
 		 239 aa  191  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  42.91 
 
 		 589 aa  191  8e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  39.37 
 
 		 255 aa  189  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  43.46 
 
 		 616 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2282  ABC transporter related  42.92 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5836  ABC transporter related  42.23 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011865 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2129  ABC transporter related  43.51 
 
 		 244 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.206631 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  41.2 
 
 		 257 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1709  ABC transporter related  40.25 
 
 		 245 aa  188  7e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.995593  normal  0.0343274 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  40.48 
 
 		 264 aa  187  9e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  41.94 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0330  ABC transporter related  43.1 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.813664 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3648  ABC transporter related  41.42 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2333  ABC transporter related protein  43.64 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.552467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0898  ABC transporter related  41.03 
 
 		 245 aa  186  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  39.2 
 
 		 255 aa  186  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0732  ABC transporter related  40.24 
 
 		 256 aa  186  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  40.48 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0222  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.4 
 
 		 262 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19620  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.04 
 
 		 255 aa  185  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00232655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  41.84 
 
 		 603 aa  185  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  41.28 
 
 		 245 aa  185  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  39.2 
 
 		 255 aa  185  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5693  ABC transporter related  41.2 
 
 		 271 aa  184  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  39.6 
 
 		 257 aa  184  9e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1101  ABC transporter related  43.1 
 
 		 255 aa  184  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00497633  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  40.73 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  41.83 
 
 		 271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3235  inner-membrane translocator:ABC transporter related  40.65 
 
 		 597 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0695796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  40.73 
 
 		 275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  40.73 
 
 		 275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3205  ABC transporter related protein  39.13 
 
 		 351 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  40.94 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2364  ABC transporter related  42.02 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2874  ABC transporter related  41.53 
 
 		 604 aa  183  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.20768  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  40.73 
 
 		 275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  42.28 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1674  ABC transporter related  40.56 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  37.01 
 
 		 258 aa  182  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3805  ABC transporter related protein  41.6 
 
 		 261 aa  182  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  38.19 
 
 		 255 aa  183  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  39.44 
 
 		 254 aa  182  3e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  38.98 
 
 		 276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.84 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  40.08 
 
 		 589 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3256  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.84 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  42.28 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  39.68 
 
 		 590 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  41.7 
 
 		 608 aa  182  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  40.71 
 
 		 261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  37.37 
 
 		 302 aa  182  6e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  41.37 
 
 		 252 aa  181  7e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  40.94 
 
 		 333 aa  181  7e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  39.84 
 
 		 589 aa  181  8.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  39.76 
 
 		 259 aa  181  9.000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  39.36 
 
 		 598 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6134  ABC transporter related  40.68 
 
 		 239 aa  180  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204704  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3511  ABC transporter-related protein  39.2 
 
 		 617 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7437  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.41 
 
 		 239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0365  ABC transporter related  39.68 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000174953  unclonable  0.0000000581692 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1873  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  38.4 
 
 		 263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.188258 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2496  ABC transporter related  40.85 
 
 		 243 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0963402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  40.4 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0989  ABC transporter-related protein  40.96 
 
 		 593 aa  179  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0355  ABC transporter related  37.6 
 
 		 258 aa  179  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>