More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2129 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2129  ABC transporter related  100 
 
 		 244 aa  474  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.206631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1101  ABC transporter related  88.89 
 
 		 255 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00497633  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1499  ABC transporter related  70.08 
 
 		 244 aa  338  4e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.229827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1662  ABC transporter related  65.97 
 
 		 243 aa  307  8e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2887  ABC transporter ATP-binding protein  65.53 
 
 		 239 aa  307  8e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3617  ABC transporter related  65.82 
 
 		 244 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.509048  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1951  ABC transporter related  66.39 
 
 		 244 aa  305  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1850  ABC transporter related  65.4 
 
 		 244 aa  304  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0898  ABC transporter related  51.05 
 
 		 245 aa  232  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  49.16 
 
 		 245 aa  228  5e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  49.36 
 
 		 241 aa  227  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1709  ABC transporter related  47.68 
 
 		 245 aa  222  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.995593  normal  0.0343274 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0311  ABC transporter related  47.21 
 
 		 237 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.382743  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2008  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.99 
 
 		 239 aa  218  6e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.366522  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0800  ABC transporter related  50.42 
 
 		 253 aa  217  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.54 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  48.4 
 
 		 283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2427  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  46.58 
 
 		 239 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1452  ABC transporter related  46.38 
 
 		 239 aa  214  7e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2299  ABC transporter related  48.95 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  48.8 
 
 		 293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  44.12 
 
 		 240 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1436  ABC transporter-related protein  46.15 
 
 		 239 aa  211  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  47.39 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  45.56 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1540  ABC transporter related  48.15 
 
 		 242 aa  209  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2282  ABC transporter related  50.63 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1930  ABC transporter related  52.36 
 
 		 247 aa  208  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  48 
 
 		 275 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  48 
 
 		 275 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  48 
 
 		 275 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1531  ABC transporter related  45.73 
 
 		 239 aa  208  8e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  48.59 
 
 		 276 aa  207  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0845  ABC transporter related  51.67 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.791281 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3648  ABC transporter related  46.89 
 
 		 244 aa  207  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  44.98 
 
 		 257 aa  206  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3397  ABC transporter related  46.86 
 
 		 249 aa  206  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0271922 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5836  ABC transporter related  48.24 
 
 		 272 aa  205  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011865 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2333  ABC transporter related protein  48.75 
 
 		 243 aa  205  5e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.552467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0330  ABC transporter related  45 
 
 		 245 aa  204  9e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.813664 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  47.39 
 
 		 280 aa  204  9e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  48 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5639  ABC transporter related  47.33 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  44.58 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  45.56 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  43.48 
 
 		 263 aa  203  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.99 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  44 
 
 		 258 aa  202  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  47.33 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  41.39 
 
 		 284 aa  202  4e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  47.43 
 
 		 261 aa  202  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  46.56 
 
 		 589 aa  202  5e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  46.18 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7437  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.81 
 
 		 239 aa  201  7e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0360  ABC transporter related  50 
 
 		 243 aa  201  9e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1827  ABC transporter related  43.28 
 
 		 242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.017401  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1521  ABC transporter related  50 
 
 		 242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000012745  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  43.65 
 
 		 271 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  47.01 
 
 		 278 aa  198  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1137  ABC transporter related  44.17 
 
 		 239 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.195731 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2202  ABC transporter related  44.96 
 
 		 235 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0850  ATPase  42.86 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  44.8 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  45.82 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1674  ABC transporter related  45.78 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5693  ABC transporter related  47.2 
 
 		 271 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0262  ABC transporter related  43.43 
 
 		 254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1907  ABC transporter related  48.54 
 
 		 253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  45.2 
 
 		 294 aa  195  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  41.73 
 
 		 259 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0449  ABC transporter related  49.38 
 
 		 242 aa  195  6e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0144  ABC transporter related  44.86 
 
 		 249 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  43.87 
 
 		 256 aa  194  7e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1565  ABC transporter related  46.03 
 
 		 246 aa  194  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  43.37 
 
 		 259 aa  195  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  47.18 
 
 		 608 aa  194  9e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  42.75 
 
 		 259 aa  194  9e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  44.18 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1599  ABC transporter related  42.26 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86219  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1085  ABC transporter related  46.59 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0894019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0546  ABC transporter related  49.38 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0891266  hitchhiker  0.0003203 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  44 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0344  ABC transporter related  46.25 
 
 		 336 aa  193  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.952475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  46.41 
 
 		 616 aa  192  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  45.38 
 
 		 255 aa  192  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  43.37 
 
 		 265 aa  192  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  44.58 
 
 		 255 aa  192  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1098  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.57 
 
 		 241 aa  192  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.559592  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1678  ABC transporter-like protein  50.42 
 
 		 238 aa  192  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.939026  normal  0.0800845 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2496  ABC transporter related  48.13 
 
 		 243 aa  192  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0963402  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.83 
 
 		 256 aa  192  5e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  45.34 
 
 		 590 aa  192  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6134  ABC transporter related  46.93 
 
 		 239 aa  192  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204704  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  45.2 
 
 		 256 aa  191  8e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3338  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.2 
 
 		 251 aa  191  9e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  45.93 
 
 		 951 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.74 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0890  ABC transporter related  44.84 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2168  ABC transporter related  45.56 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3805  ABC transporter related protein  43.8 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>