More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3648 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3648  ABC transporter related  100 
 
 		 244 aa  481  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1098  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  71.19 
 
 		 241 aa  350  1e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.559592  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1196  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  72.02 
 
 		 244 aa  340  1e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  49.37 
 
 		 241 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0144  ABC transporter related  49.17 
 
 		 249 aa  228  9e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2299  ABC transporter related  47.86 
 
 		 242 aa  221  9e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.03 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0360  ABC transporter related  49.37 
 
 		 243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1499  ABC transporter related  47.9 
 
 		 244 aa  211  5.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.229827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0800  ABC transporter related  48.74 
 
 		 253 aa  211  7.999999999999999e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0311  ABC transporter related  45.57 
 
 		 237 aa  209  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.382743  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2008  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.77 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.366522  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  44.86 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1540  ABC transporter related  46.35 
 
 		 242 aa  207  9e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1930  ABC transporter related  48.52 
 
 		 247 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1662  ABC transporter related  44.21 
 
 		 243 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5639  ABC transporter related  47.72 
 
 		 253 aa  206  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0511  ABC transporter related  44.68 
 
 		 238 aa  204  8e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0526817  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3617  ABC transporter related  45.42 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.509048  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1850  ABC transporter related  45.83 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2887  ABC transporter ATP-binding protein  44.54 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0850  ATPase  43.64 
 
 		 242 aa  202  6e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1951  ABC transporter related  45.38 
 
 		 244 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  44.35 
 
 		 240 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  46.25 
 
 		 603 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2143  ABC transporter related  44.81 
 
 		 257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0795  ABC transporter related  47.3 
 
 		 253 aa  198  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.213138  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  43.32 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1521  ABC transporter related  48.95 
 
 		 242 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000012745  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1709  ABC transporter related  42.98 
 
 		 245 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.995593  normal  0.0343274 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.83 
 
 		 609 aa  195  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0898  ABC transporter related  44.07 
 
 		 245 aa  195  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4421  ABC transporter related  43.82 
 
 		 259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11811  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  42.34 
 
 		 268 aa  194  8.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1907  ABC transporter related  46.22 
 
 		 253 aa  194  9e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2129  ABC transporter related  46.89 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.206631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1101  ABC transporter related  46.67 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00497633  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1599  ABC transporter related  42.19 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86219  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1452  ABC transporter related  47.06 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0546  ABC transporter related  48.12 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0891266  hitchhiker  0.0003203 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1827  ABC transporter related  43.22 
 
 		 242 aa  192  4e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.017401  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  42.11 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0845  ABC transporter related  47.7 
 
 		 241 aa  191  7e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.791281 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.58 
 
 		 256 aa  190  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  43.9 
 
 		 589 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  43.72 
 
 		 271 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0315  ABC transporter related  42.8 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.317269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3978  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  43.82 
 
 		 254 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1221  decreased coverage  0.00203887 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2427  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  44.54 
 
 		 239 aa  188  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1394  ABC transporter related protein  46.18 
 
 		 255 aa  188  7e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1531  ABC transporter related  44.96 
 
 		 239 aa  188  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2496  ABC transporter related  42.8 
 
 		 243 aa  187  9e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0963402  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3805  ABC transporter related protein  40.98 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1436  ABC transporter-related protein  44.96 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1137  ABC transporter related  41.42 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.195731 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  40.32 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  43.2 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  42.69 
 
 		 271 aa  186  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0355  ABC transporter related  42.11 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  42.17 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2282  ABC transporter related  43.28 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3658  ABC transporter related  43.43 
 
 		 254 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2333  ABC transporter related protein  43.04 
 
 		 243 aa  186  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.552467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  42.97 
 
 		 264 aa  185  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  42.57 
 
 		 259 aa  185  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  41.3 
 
 		 254 aa  185  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1678  ABC transporter-like protein  44.96 
 
 		 238 aa  184  8e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.939026  normal  0.0800845 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  45 
 
 		 616 aa  184  9e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  42.4 
 
 		 294 aa  184  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  40.8 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4092  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.02 
 
 		 489 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126474 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1565  ABC transporter related  45 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  42.62 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  40.49 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2029  ABC transporter related  46.22 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0449  ABC transporter related  46.03 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  43.37 
 
 		 280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  40.96 
 
 		 259 aa  182  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2268  ABC transporter related  44.62 
 
 		 262 aa  183  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.434627  decreased coverage  0.00162775 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  41.83 
 
 		 255 aa  182  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0330  ABC transporter related  42.98 
 
 		 245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.813664 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4057  ABC transporter related  41.8 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0519536  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3055  ABC transporter related  43.03 
 
 		 270 aa  182  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.739746 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0732  ABC transporter related  45.12 
 
 		 256 aa  182  6e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  42.91 
 
 		 255 aa  181  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4649  ABC transporter related  41.94 
 
 		 260 aa  181  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  41.43 
 
 		 296 aa  181  7e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  41.27 
 
 		 259 aa  181  9.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4657  ABC transporter related  42.97 
 
 		 608 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.161308 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7437  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.6 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4525  ABC transporter related  42.97 
 
 		 608 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0349155  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  39.76 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  40.08 
 
 		 251 aa  179  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  41.43 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0485  ABC transporter related  42.26 
 
 		 490 aa  180  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  41.43 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4488  ABC transporter related  42.39 
 
 		 624 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  39.92 
 
 		 274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  40.16 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  42.04 
 
 		 589 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>