More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1196 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA1196  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 244 aa  490  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1098  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  98.77 
 
 		 241 aa  480  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.559592  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3648  ABC transporter related  72.02 
 
 		 244 aa  358  3e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0800  ABC transporter related  49.79 
 
 		 253 aa  229  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  51.45 
 
 		 241 aa  228  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0144  ABC transporter related  47.95 
 
 		 249 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.95 
 
 		 248 aa  222  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2299  ABC transporter related  47.52 
 
 		 242 aa  221  8e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1540  ABC transporter related  47.88 
 
 		 242 aa  218  8.999999999999998e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0311  ABC transporter related  48.13 
 
 		 237 aa  216  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.382743  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0360  ABC transporter related  49.37 
 
 		 243 aa  214  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2143  ABC transporter related  47.13 
 
 		 257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  46.89 
 
 		 245 aa  211  7.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0511  ABC transporter related  45.19 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0526817  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2887  ABC transporter ATP-binding protein  44.17 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2333  ABC transporter related protein  47.28 
 
 		 243 aa  209  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.552467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1599  ABC transporter related  47.28 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86219  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  47.95 
 
 		 603 aa  208  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  45.42 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1452  ABC transporter related  47.92 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  47.35 
 
 		 609 aa  206  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0795  ABC transporter related  49.38 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.213138  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1499  ABC transporter related  45.19 
 
 		 244 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.229827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  44.88 
 
 		 271 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1951  ABC transporter related  44.4 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1850  ABC transporter related  44.9 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1678  ABC transporter-like protein  47.5 
 
 		 238 aa  206  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.939026  normal  0.0800845 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1930  ABC transporter related  47.9 
 
 		 247 aa  205  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3617  ABC transporter related  44.49 
 
 		 244 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.509048  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2496  ABC transporter related  46.41 
 
 		 243 aa  205  7e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0963402  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1662  ABC transporter related  43.03 
 
 		 243 aa  204  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2427  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  46.67 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1436  ABC transporter-related protein  47.5 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1531  ABC transporter related  47.5 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5639  ABC transporter related  47.72 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0850  ATPase  45.15 
 
 		 242 aa  202  4e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2008  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.64 
 
 		 239 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.366522  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  45.16 
 
 		 254 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1137  ABC transporter related  45.8 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.195731 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  43.65 
 
 		 333 aa  199  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1394  ABC transporter related protein  47.39 
 
 		 255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  46.75 
 
 		 616 aa  198  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  43.25 
 
 		 255 aa  198  7e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1907  ABC transporter related  46.41 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.7 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0898  ABC transporter related  44.08 
 
 		 245 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  42.97 
 
 		 255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  42.75 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  43.78 
 
 		 255 aa  195  6e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4421  ABC transporter related  44.22 
 
 		 259 aa  195  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11811  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  43.43 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1709  ABC transporter related  43.51 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.995593  normal  0.0343274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0330  ABC transporter related  44.58 
 
 		 245 aa  192  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.813664 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  43.55 
 
 		 261 aa  193  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  43.08 
 
 		 255 aa  192  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1827  ABC transporter related  44.3 
 
 		 242 aa  192  4e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.017401  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  42.63 
 
 		 269 aa  192  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  44.27 
 
 		 271 aa  192  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  46.22 
 
 		 589 aa  192  5e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2282  ABC transporter related  42.92 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  42.23 
 
 		 264 aa  191  7e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  43.08 
 
 		 276 aa  191  9e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1521  ABC transporter related  46.67 
 
 		 242 aa  190  1e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000012745  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3658  ABC transporter related  43.95 
 
 		 254 aa  190  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0845  ABC transporter related  45.42 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.791281 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  43.03 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  42.97 
 
 		 255 aa  189  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2586  ABC transporter related  43.57 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1101  ABC transporter related  44.77 
 
 		 255 aa  189  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00497633  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  42.74 
 
 		 293 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  41.94 
 
 		 283 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  43.03 
 
 		 259 aa  189  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3978  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  43.55 
 
 		 254 aa  188  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1221  decreased coverage  0.00203887 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  42.23 
 
 		 274 aa  187  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  43.95 
 
 		 594 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  43.43 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0546  ABC transporter related  45.83 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0891266  hitchhiker  0.0003203 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  43.03 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  44.53 
 
 		 268 aa  186  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  44 
 
 		 261 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  41.94 
 
 		 275 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  41.94 
 
 		 275 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  41.94 
 
 		 275 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3055  ABC transporter related  44.08 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.739746 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  43.55 
 
 		 594 aa  185  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  43.55 
 
 		 594 aa  185  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4092  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.35 
 
 		 489 aa  185  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126474 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  43.55 
 
 		 594 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  42.97 
 
 		 294 aa  185  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  43.55 
 
 		 594 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  40.55 
 
 		 278 aa  185  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1114  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.82 
 
 		 256 aa  185  6e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  43.55 
 
 		 594 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  43.55 
 
 		 594 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  43.55 
 
 		 594 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2129  ABC transporter related  43.57 
 
 		 244 aa  184  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.206631 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  42.13 
 
 		 265 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0365  ABC transporter related  42.17 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000174953  unclonable  0.0000000581692 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0262  ABC transporter related  41.67 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5973  ABC transporter related  42.46 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>