More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1561 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  100 
 
 		 282 aa  573  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  92.91 
 
 		 296 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  96.73 
 
 		 275 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  90.22 
 
 		 276 aa  507  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5714  putative high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  86.89 
 
 		 273 aa  474  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  0.906173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0296  ABC transporter related  83.27 
 
 		 269 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2309  ABC transporter related  80.3 
 
 		 269 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0078002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  78.24 
 
 		 280 aa  429  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3510  ABC transporter component  75.1 
 
 		 274 aa  392  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000404  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  73.31 
 
 		 266 aa  391  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.428911  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1831  ABC transporter related  73.91 
 
 		 269 aa  393  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3137  ABC transporter-related protein  74.52 
 
 		 265 aa  391  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3417  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  73.44 
 
 		 269 aa  389  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2611  ABC transporter-related protein  73.52 
 
 		 265 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  62.06 
 
 		 269 aa  329  3e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  59.29 
 
 		 269 aa  323  3e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1598  ABC transporter related protein  63.18 
 
 		 260 aa  318  6e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  59.68 
 
 		 274 aa  317  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0261  ABC transporter related  58.66 
 
 		 306 aa  317  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  60.08 
 
 		 270 aa  315  6e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  59.27 
 
 		 269 aa  314  9e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2278  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  58.87 
 
 		 279 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0953  ABC transporter related  58.87 
 
 		 274 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.513158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2724  ABC transporter related  58.06 
 
 		 277 aa  312  4.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.407856 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0215  ABC transporter-related protein  58.47 
 
 		 313 aa  311  5.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0375  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livG  59.27 
 
 		 273 aa  310  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3608  ABC transporter related  58.3 
 
 		 261 aa  308  5e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0250  ABC transporter related  59.27 
 
 		 260 aa  308  5.9999999999999995e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0469  ABC transporter related  59.27 
 
 		 261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.304191 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3364  ABC transporter related  57.94 
 
 		 274 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3435  ABC transporter-related protein  58.87 
 
 		 264 aa  305  7e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000808082 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0460  ABC transporter related  58.87 
 
 		 261 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4010  ABC transporter related  58.06 
 
 		 272 aa  303  2.0000000000000002e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0603  ABC transporter related  58 
 
 		 260 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5007  ABC transporter related  58 
 
 		 261 aa  302  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5038  ABC transporter related  59.44 
 
 		 286 aa  302  4.0000000000000003e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1158  ABC transporter related  57.26 
 
 		 261 aa  302  4.0000000000000003e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3541  ABC transporter related  58.06 
 
 		 260 aa  301  9e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0786  ABC transporter-related protein  58.47 
 
 		 263 aa  301  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_809  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  53.03 
 
 		 276 aa  296  3e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0822  ABC transporter related  51.89 
 
 		 276 aa  293  2e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  56.75 
 
 		 289 aa  292  5e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  56.22 
 
 		 277 aa  291  7e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  57.94 
 
 		 294 aa  291  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0938  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.95 
 
 		 270 aa  285  8e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0956002  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0114  ABC transporter related  57.83 
 
 		 272 aa  281  7.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.95101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43540  ABC transporter, ATP binding component  56.05 
 
 		 260 aa  275  8e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0288454  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0569  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  57.21 
 
 		 255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.383942  normal  0.0445823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3842  ABC transporter related  56.4 
 
 		 289 aa  271  8.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000140209  normal  0.918006 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2360  ABC transporter related  56.35 
 
 		 278 aa  270  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.547386 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0549  ABC transporter related  54.03 
 
 		 265 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5286  ABC transporter related  53.23 
 
 		 283 aa  269  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2281  ABC transporter related  56.18 
 
 		 264 aa  269  4e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0135  ABC transporter-like protein  56.45 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2987  ABC transporter related  53.23 
 
 		 277 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.82 
 
 		 277 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0300535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1542  ABC transporter related protein  53.6 
 
 		 255 aa  260  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000371483  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2748  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.73 
 
 		 266 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.916728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3008  ABC transporter-related protein  50.97 
 
 		 275 aa  258  6e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00336682  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3005  ABC transporter related  53.63 
 
 		 256 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  51.18 
 
 		 273 aa  255  7e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4097  ABC transporter related  49.61 
 
 		 292 aa  254  8e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3163  ABC transporter related protein  48.8 
 
 		 292 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2990  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.81 
 
 		 264 aa  251  6e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00578117  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0759  ABC transporter related protein  50 
 
 		 268 aa  251  7e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4938  ABC transporter related  48.06 
 
 		 275 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.584937  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3501  ABC transporter related  49.81 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.111605  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43780  ABC transporter, LivG family  50.97 
 
 		 262 aa  250  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.430374  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5146  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  51.79 
 
 		 296 aa  249  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3030  ABC transporter related protein  48.41 
 
 		 274 aa  248  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3832  ABC transporter related protein  46.99 
 
 		 285 aa  248  6e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1465  ABC transporter-like protein  48.79 
 
 		 291 aa  246  4e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7076  high-affinity branched-chain amino acid transport protein  47.62 
 
 		 265 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  44.79 
 
 		 262 aa  239  4e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2376  ABC transporter-like protein  47.39 
 
 		 251 aa  239  5e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2544  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.61 
 
 		 256 aa  238  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.234113 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  45.6 
 
 		 268 aa  237  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  46.59 
 
 		 264 aa  236  4e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6107  ABC transporter related  46.06 
 
 		 261 aa  236  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.319085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  44.19 
 
 		 284 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4240  ABC transporter related  46.43 
 
 		 266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  46.59 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2442  ABC transporter related protein  45.88 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  47.49 
 
 		 271 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  42.58 
 
 		 261 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  48.61 
 
 		 261 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  43.45 
 
 		 284 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4818  ABC transporter related  46.07 
 
 		 274 aa  231  7.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  47.58 
 
 		 255 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3799  ABC transporter related  47.22 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.718599 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  45.24 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  48 
 
 		 258 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  45.24 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0356  ABC transporter related  44.91 
 
 		 290 aa  230  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  48.79 
 
 		 276 aa  230  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  45.2 
 
 		 259 aa  229  3e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  43.75 
 
 		 261 aa  229  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3491  ABC transporter related  46.18 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.411905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1425  ABC transporter related  45.16 
 
 		 253 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715565  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5999  ABC transporter related protein  46 
 
 		 255 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.0205889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>