More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1521 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1521  ABC transporter related  100 
 
 
242 aa  479  1e-134  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000012745  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0546  ABC transporter related  88.84 
 
 
242 aa  412  1e-114  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0891266  hitchhiker  0.0003203 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0845  ABC transporter related  81.67 
 
 
241 aa  378  1e-104  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.791281 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0449  ABC transporter related  80.17 
 
 
242 aa  374  1e-103  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0144  ABC transporter related  47.92 
 
 
249 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2299  ABC transporter related  46.25 
 
 
242 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  45.45 
 
 
259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2364  ABC transporter related  46.47 
 
 
245 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106174  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2008  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.64 
 
 
239 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.366522  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2333  ABC transporter related protein  50 
 
 
243 aa  211  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.552467  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3648  ABC transporter related  48.95 
 
 
244 aa  210  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1101  ABC transporter related  48.75 
 
 
255 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00497633  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2129  ABC transporter related  50 
 
 
244 aa  209  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.206631 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2143  ABC transporter related  45.68 
 
 
257 aa  209  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2202  ABC transporter related  47.03 
 
 
235 aa  209  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  44.66 
 
 
265 aa  208  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0800  ABC transporter related  48.1 
 
 
253 aa  208  7e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1540  ABC transporter related  43.33 
 
 
242 aa  207  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  44.27 
 
 
264 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0511  ABC transporter related  44.77 
 
 
238 aa  205  5e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0526817  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1499  ABC transporter related  47.5 
 
 
244 aa  205  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.229827  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5639  ABC transporter related  48.33 
 
 
253 aa  204  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1806  ABC transporter related  46.69 
 
 
246 aa  204  1e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.944964  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  44.88 
 
 
257 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  44.09 
 
 
257 aa  204  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1098  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.08 
 
 
241 aa  203  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.559592  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3617  ABC transporter related  46.61 
 
 
244 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.509048  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.99 
 
 
248 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0360  ABC transporter related  49.16 
 
 
243 aa  202  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  44.62 
 
 
255 aa  202  5e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  41.6 
 
 
240 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1907  ABC transporter related  45.34 
 
 
253 aa  200  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1951  ABC transporter related  46.84 
 
 
244 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1850  ABC transporter related  46.19 
 
 
244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1196  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 
244 aa  199  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2849  ABC transporter related protein  43.67 
 
 
247 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485647  normal  0.511604 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4552  ABC transporter related  42.69 
 
 
260 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1709  ABC transporter related  42.26 
 
 
245 aa  198  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.995593  normal  0.0343274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2887  ABC transporter ATP-binding protein  44.68 
 
 
239 aa  197  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1975  ABC transporter related  44.44 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1662  ABC transporter related  46.19 
 
 
243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  41.83 
 
 
256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  44.35 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 
256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  41.02 
 
 
259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0898  ABC transporter related  43.1 
 
 
245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0598  ABC transporter related  44.4 
 
 
253 aa  196  3e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1678  ABC transporter-like protein  48.32 
 
 
238 aa  196  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.939026  normal  0.0800845 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0315  ABC transporter related  45.04 
 
 
246 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0824  ABC transporter related  45.49 
 
 
247 aa  195  5.000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  40.4 
 
 
254 aa  195  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  44.22 
 
 
271 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2282  ABC transporter related  43.33 
 
 
239 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0795  ABC transporter related  47.06 
 
 
253 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.213138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  43.2 
 
 
259 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  46.25 
 
 
273 aa  193  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1502  ABC transporter related  45.68 
 
 
247 aa  193  2e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.202973  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0864  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.6 
 
 
241 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303052  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  43.43 
 
 
256 aa  193  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  44.54 
 
 
241 aa  192  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  42.23 
 
 
250 aa  193  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  40.87 
 
 
255 aa  192  5e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0330  ABC transporter related  44.03 
 
 
245 aa  192  6e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.813664 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  43.43 
 
 
256 aa  191  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6134  ABC transporter related  42.86 
 
 
239 aa  191  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204704  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  40.8 
 
 
269 aa  191  7e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2586  ABC transporter related  44.35 
 
 
237 aa  191  8e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  45.83 
 
 
272 aa  190  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  40.87 
 
 
255 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  42.46 
 
 
255 aa  190  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  41.83 
 
 
250 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1598  ABC transporter related protein  45.2 
 
 
260 aa  189  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5244  ABC transporter ATP-binding protein  43.64 
 
 
243 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.104577 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0677  ABC transporter related  39.92 
 
 
260 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.888321  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7437  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.34 
 
 
239 aa  189  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.9 
 
 
256 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  42.04 
 
 
256 aa  189  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1452  ABC transporter related  43.28 
 
 
239 aa  188  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  43.2 
 
 
268 aa  188  5.999999999999999e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  41.63 
 
 
256 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2427  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  43.28 
 
 
239 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  41.63 
 
 
256 aa  187  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0222  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.86 
 
 
262 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169611  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1394  ABC transporter related protein  46.56 
 
 
255 aa  187  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  39.6 
 
 
258 aa  186  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2029  ABC transporter related  44 
 
 
261 aa  186  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0890  ABC transporter related  40.87 
 
 
262 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  41.6 
 
 
599 aa  186  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  42.45 
 
 
252 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1565  ABC transporter related  41.35 
 
 
246 aa  185  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
254 aa  186  4e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  39.44 
 
 
270 aa  185  5e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  41.6 
 
 
269 aa  185  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  43.2 
 
 
252 aa  185  6e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 
256 aa  185  7e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1930  ABC transporter related  44.3 
 
 
247 aa  184  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211937  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  45.31 
 
 
250 aa  184  9e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1436  ABC transporter-related protein  42.44 
 
 
239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1426  ABC transporter related protein  40.57 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.259365  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  45.45 
 
 
608 aa  184  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>