More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2299 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2299  ABC transporter related  100 
 
 		 242 aa  478  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1540  ABC transporter related  87.08 
 
 		 242 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  48.33 
 
 		 241 aa  241  5e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0144  ABC transporter related  48.33 
 
 		 249 aa  234  8e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.58 
 
 		 248 aa  229  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5639  ABC transporter related  53.56 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3617  ABC transporter related  48.76 
 
 		 244 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.509048  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2887  ABC transporter ATP-binding protein  49.37 
 
 		 239 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1850  ABC transporter related  48.36 
 
 		 244 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  46.06 
 
 		 265 aa  228  7e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2143  ABC transporter related  48.97 
 
 		 257 aa  227  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  45.28 
 
 		 264 aa  226  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1662  ABC transporter related  48.36 
 
 		 243 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1951  ABC transporter related  47.95 
 
 		 244 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2282  ABC transporter related  47.26 
 
 		 239 aa  226  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  46.86 
 
 		 240 aa  226  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1930  ABC transporter related  52.08 
 
 		 247 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3648  ABC transporter related  47.86 
 
 		 244 aa  221  9e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2008  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 		 239 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.366522  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0311  ABC transporter related  44.73 
 
 		 237 aa  219  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.382743  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1499  ABC transporter related  47.28 
 
 		 244 aa  218  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.229827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  43.43 
 
 		 255 aa  218  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  49.6 
 
 		 271 aa  218  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2333  ABC transporter related protein  47.06 
 
 		 243 aa  216  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.552467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1098  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.52 
 
 		 241 aa  216  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.559592  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0898  ABC transporter related  47.23 
 
 		 245 aa  216  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2014  ABC transporter related  46.03 
 
 		 263 aa  216  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  45.38 
 
 		 252 aa  214  7e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3397  ABC transporter related  47.23 
 
 		 249 aa  215  7e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0271922 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0511  ABC transporter related  44.4 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0526817  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0800  ABC transporter related  46.61 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2496  ABC transporter related  49.37 
 
 		 243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0963402  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  47.13 
 
 		 271 aa  212  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1907  ABC transporter related  48.97 
 
 		 253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1452  ABC transporter related  45.26 
 
 		 239 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  44.09 
 
 		 259 aa  211  5.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0795  ABC transporter related  49.36 
 
 		 253 aa  211  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.213138  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  49.58 
 
 		 609 aa  211  5.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  43.2 
 
 		 255 aa  211  7e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1196  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.52 
 
 		 244 aa  211  9e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2427  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  46.98 
 
 		 239 aa  210  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1827  ABC transporter related  43.62 
 
 		 242 aa  210  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.017401  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  42.8 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  44.58 
 
 		 283 aa  209  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0519  ABC transporter related  42.57 
 
 		 255 aa  208  5e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0330  ABC transporter related  44.81 
 
 		 245 aa  208  6e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.813664 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  43.82 
 
 		 251 aa  208  8e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  43.2 
 
 		 265 aa  208  8e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  46.03 
 
 		 276 aa  207  9e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  44.18 
 
 		 275 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0850  ATPase  42.74 
 
 		 242 aa  207  1e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  44.18 
 
 		 275 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  44.4 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  44.18 
 
 		 275 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1436  ABC transporter-related protein  46.55 
 
 		 239 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  46.99 
 
 		 261 aa  206  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1709  ABC transporter related  43.46 
 
 		 245 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.995593  normal  0.0343274 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1531  ABC transporter related  46.55 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  44.77 
 
 		 245 aa  206  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2129  ABC transporter related  48.54 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.206631 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  44.72 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  44.18 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  43.85 
 
 		 258 aa  205  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  44.4 
 
 		 250 aa  205  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1678  ABC transporter-like protein  48.74 
 
 		 238 aa  204  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.939026  normal  0.0800845 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  44.67 
 
 		 280 aa  204  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0222  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.87 
 
 		 262 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  45.71 
 
 		 294 aa  203  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0360  ABC transporter related  48.95 
 
 		 243 aa  202  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.78 
 
 		 258 aa  202  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  47.48 
 
 		 603 aa  202  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3102  ABC transporter related  42.45 
 
 		 258 aa  201  6e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  42.28 
 
 		 255 aa  201  7e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  41.73 
 
 		 288 aa  201  8e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  44.03 
 
 		 268 aa  201  9e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  42 
 
 		 259 aa  201  9e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  40.89 
 
 		 255 aa  201  9e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  45.9 
 
 		 334 aa  201  9e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  42.62 
 
 		 255 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1163  ABC transporter related  41.6 
 
 		 255 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  41.04 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  44.49 
 
 		 273 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  42.75 
 
 		 259 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  45.02 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3834  ABC transporter related  47.54 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.185359 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  43.03 
 
 		 255 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  44.18 
 
 		 260 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  43.67 
 
 		 296 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1085  ABC transporter related  44.87 
 
 		 277 aa  199  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0894019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  39.86 
 
 		 307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1101  ABC transporter related  47.86 
 
 		 255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00497633  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  41.77 
 
 		 254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0565  ABC transporter related  41.3 
 
 		 255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0274891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.04 
 
 		 255 aa  198  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  40.49 
 
 		 269 aa  198  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  43.27 
 
 		 282 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  43.6 
 
 		 255 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1521  ABC transporter related  46.25 
 
 		 242 aa  198  7.999999999999999e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000012745  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.48 
 
 		 256 aa  197  9e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  40 
 
 		 256 aa  197  9e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>