More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0311 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0311  ABC transporter related  100 
 
 		 237 aa  488  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.382743  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  52.14 
 
 		 241 aa  255  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  50.21 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1452  ABC transporter related  50.85 
 
 		 239 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2427  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  50.21 
 
 		 239 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1531  ABC transporter related  50.21 
 
 		 239 aa  245  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1436  ABC transporter-related protein  50.21 
 
 		 239 aa  244  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2008  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.58 
 
 		 239 aa  238  4e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.366522  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  50.44 
 
 		 245 aa  237  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1951  ABC transporter related  48.72 
 
 		 244 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1850  ABC transporter related  48.5 
 
 		 244 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3617  ABC transporter related  48.07 
 
 		 244 aa  235  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.509048  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2887  ABC transporter ATP-binding protein  46.55 
 
 		 239 aa  231  9e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1662  ABC transporter related  47.21 
 
 		 243 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1499  ABC transporter related  46.78 
 
 		 244 aa  228  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.229827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0850  ATPase  47.86 
 
 		 242 aa  228  8e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  44.8 
 
 		 271 aa  226  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1709  ABC transporter related  47.35 
 
 		 245 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.995593  normal  0.0343274 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0898  ABC transporter related  45.06 
 
 		 245 aa  221  9e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  45.87 
 
 		 258 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2299  ABC transporter related  44.73 
 
 		 242 aa  219  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  44.05 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  44.4 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1827  ABC transporter related  46.58 
 
 		 242 aa  216  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.017401  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  44.53 
 
 		 276 aa  216  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  47.58 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  47.08 
 
 		 256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  44.05 
 
 		 255 aa  214  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 		 254 aa  213  9.999999999999999e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.65 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  43.87 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  45.38 
 
 		 261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0864  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.92 
 
 		 241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303052  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  43.65 
 
 		 265 aa  211  5.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  44.58 
 
 		 275 aa  211  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1101  ABC transporter related  50.89 
 
 		 255 aa  211  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00497633  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  44.58 
 
 		 275 aa  211  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  42.06 
 
 		 255 aa  211  7e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  45.42 
 
 		 256 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  44.58 
 
 		 275 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1098  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.13 
 
 		 241 aa  211  7.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.559592  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1196  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.13 
 
 		 244 aa  211  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1540  ABC transporter related  45.02 
 
 		 242 aa  210  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3648  ABC transporter related  45.57 
 
 		 244 aa  209  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  43.65 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  43.08 
 
 		 254 aa  209  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  45.06 
 
 		 270 aa  209  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  44.66 
 
 		 255 aa  209  4e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0694  inner-membrane translocator, ABC transporter related  45.75 
 
 		 583 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2333  ABC transporter related protein  45.99 
 
 		 243 aa  208  6e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.552467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  42.8 
 
 		 256 aa  208  7e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  42.86 
 
 		 255 aa  208  7e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1565  ABC transporter related  46.35 
 
 		 246 aa  207  8e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1599  ABC transporter related  43.46 
 
 		 239 aa  207  8e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86219  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  44.8 
 
 		 261 aa  207  9e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  45.45 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  42.46 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1137  ABC transporter related  43.46 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.195731 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  43.39 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  43.2 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  43.39 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  43.75 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  41.39 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.75 
 
 		 258 aa  205  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  45 
 
 		 258 aa  206  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  42.91 
 
 		 260 aa  205  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  45.08 
 
 		 271 aa  205  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  43.15 
 
 		 283 aa  204  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  43.55 
 
 		 293 aa  204  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  43.6 
 
 		 263 aa  204  8e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  43.65 
 
 		 257 aa  204  9e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  42.86 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  41.67 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  44.63 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  44.63 
 
 		 257 aa  203  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  42.8 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  43.75 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6134  ABC transporter related  42.44 
 
 		 239 aa  202  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204704  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  43.8 
 
 		 250 aa  202  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.49 
 
 		 248 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  44.17 
 
 		 259 aa  202  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  44.08 
 
 		 261 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0360  ABC transporter related  43.04 
 
 		 243 aa  202  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2096  ABC transporter related  43.09 
 
 		 297 aa  202  5e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.0132496 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  44.54 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  43.25 
 
 		 256 aa  201  6e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.33 
 
 		 258 aa  201  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2129  ABC transporter related  47.21 
 
 		 244 aa  201  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.206631 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  42 
 
 		 257 aa  201  7e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  42.97 
 
 		 252 aa  201  8e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2496  ABC transporter related  45.34 
 
 		 243 aa  201  8e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0963402  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  43.33 
 
 		 258 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  41.27 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2999  ABC transporter related  43.75 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156321  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  44.21 
 
 		 259 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.37 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0511  ABC transporter related  45.38 
 
 		 238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0526817  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  42.92 
 
 		 258 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1518  ABC transporter related  42 
 
 		 253 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.121559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  41.9 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>