More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1499 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1499  ABC transporter related  100 
 
 		 244 aa  482  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.229827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1951  ABC transporter related  70.29 
 
 		 244 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3617  ABC transporter related  70.34 
 
 		 244 aa  335  5e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.509048  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1101  ABC transporter related  71.49 
 
 		 255 aa  334  7e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00497633  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1850  ABC transporter related  69.92 
 
 		 244 aa  332  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1662  ABC transporter related  68.64 
 
 		 243 aa  329  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2887  ABC transporter ATP-binding protein  68.94 
 
 		 239 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2129  ABC transporter related  70.08 
 
 		 244 aa  321  8e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.206631 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  50.85 
 
 		 245 aa  239  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0898  ABC transporter related  48.35 
 
 		 245 aa  231  7.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  47.26 
 
 		 241 aa  228  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0311  ABC transporter related  46.78 
 
 		 237 aa  228  6e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.382743  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1709  ABC transporter related  45.76 
 
 		 245 aa  225  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.995593  normal  0.0343274 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2427  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  46.81 
 
 		 239 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  44.96 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.76 
 
 		 248 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2008  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.84 
 
 		 239 aa  221  6e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.366522  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1436  ABC transporter-related protein  47.01 
 
 		 239 aa  221  8e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1452  ABC transporter related  46.81 
 
 		 239 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1531  ABC transporter related  47.01 
 
 		 239 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2299  ABC transporter related  47.28 
 
 		 242 aa  218  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2282  ABC transporter related  49.79 
 
 		 239 aa  215  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0850  ATPase  47.06 
 
 		 242 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0330  ABC transporter related  43.98 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.813664 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1540  ABC transporter related  46.06 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1930  ABC transporter related  50.21 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  46.4 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  47.28 
 
 		 616 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  45.6 
 
 		 250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2333  ABC transporter related protein  46.47 
 
 		 243 aa  212  4.9999999999999996e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.552467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1827  ABC transporter related  48.12 
 
 		 242 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.017401  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3648  ABC transporter related  47.9 
 
 		 244 aa  211  5.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  44.18 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  46 
 
 		 293 aa  209  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  44.8 
 
 		 250 aa  208  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  46.77 
 
 		 334 aa  208  6e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  43.87 
 
 		 257 aa  208  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  43.48 
 
 		 257 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0144  ABC transporter related  44.54 
 
 		 249 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  45.6 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  45.6 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3397  ABC transporter related  45.57 
 
 		 249 aa  206  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0271922 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1674  ABC transporter related  45.38 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  45.6 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  43.36 
 
 		 258 aa  205  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  43.7 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  44.58 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  45.38 
 
 		 589 aa  204  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1098  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.19 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.559592  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  47.98 
 
 		 280 aa  203  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  44.58 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1196  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.19 
 
 		 244 aa  202  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0511  ABC transporter related  42.8 
 
 		 238 aa  202  5e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0526817  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.27 
 
 		 257 aa  201  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0360  ABC transporter related  47.28 
 
 		 243 aa  202  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  46.25 
 
 		 256 aa  201  7e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.71 
 
 		 258 aa  201  8e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0991  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.48 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0265  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.48 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000223083  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1145  leucine/isoleucine/valine transport system ATP-binding protein  43.48 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00253052  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0787  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.48 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.48 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0800  ABC transporter related  44.26 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0985  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.48 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000122559  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2143  ABC transporter related  46.86 
 
 		 257 aa  200  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.48 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  43.03 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0795  ABC transporter related  45.99 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.213138  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1137  ABC transporter related  44.68 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.195731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  43.55 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7437  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.02 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2496  ABC transporter related  45.83 
 
 		 243 aa  199  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0963402  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1599  ABC transporter related  42.98 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86219  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  44.35 
 
 		 333 aa  199  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6114  ABC transporter related  43.08 
 
 		 257 aa  198  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  44.62 
 
 		 258 aa  198  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  44.22 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  44.05 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  44.05 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.82 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0824  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.29 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1565  ABC transporter related  46.03 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  43.82 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  42.86 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1907  ABC transporter related  45.57 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  43.82 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2413  ABC transporter related  43.03 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0344655 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2542  ABC transporter related  43.03 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812662  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  43.82 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3142  ABC transporter related  41.9 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  43.31 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  44.18 
 
 		 258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4649  ABC transporter related  44.09 
 
 		 260 aa  195  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0864  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.73 
 
 		 241 aa  195  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303052  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.8 
 
 		 256 aa  195  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  42.17 
 
 		 250 aa  195  7e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  43.37 
 
 		 263 aa  194  9e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  44.18 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3978  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  42.13 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1221  decreased coverage  0.00203887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>