More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0330 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0330  ABC transporter related  100 
 
 
245 aa  499  1e-140  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.813664 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0800  ABC transporter related  44.4 
 
 
253 aa  216  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1499  ABC transporter related  43.98 
 
 
244 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.229827  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1850  ABC transporter related  44.17 
 
 
244 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2299  ABC transporter related  44.81 
 
 
242 aa  208  6e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3617  ABC transporter related  43.75 
 
 
244 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.509048  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  45.8 
 
 
241 aa  206  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1951  ABC transporter related  43.33 
 
 
244 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1709  ABC transporter related  43.33 
 
 
245 aa  204  9e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.995593  normal  0.0343274 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  44.58 
 
 
245 aa  201  8e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2333  ABC transporter related protein  43.04 
 
 
243 aa  201  9e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.552467  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  43.44 
 
 
240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2887  ABC transporter ATP-binding protein  41.42 
 
 
239 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.28 
 
 
248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1662  ABC transporter related  42.08 
 
 
243 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  44.27 
 
 
261 aa  198  6e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1540  ABC transporter related  42.74 
 
 
242 aa  198  7.999999999999999e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1452  ABC transporter related  45.61 
 
 
239 aa  197  9e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2282  ABC transporter related  44.87 
 
 
239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  43.53 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1101  ABC transporter related  43.98 
 
 
255 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00497633  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2129  ABC transporter related  44.58 
 
 
244 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.206631 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0898  ABC transporter related  42.92 
 
 
245 aa  195  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0511  ABC transporter related  42.26 
 
 
238 aa  195  7e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0526817  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  44.44 
 
 
255 aa  194  7e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  42.97 
 
 
276 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  42 
 
 
264 aa  192  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2008  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.98 
 
 
239 aa  192  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.366522  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0144  ABC transporter related  42.56 
 
 
249 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  44.18 
 
 
608 aa  190  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0360  ABC transporter related  43.98 
 
 
243 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.03 
 
 
256 aa  190  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  41.18 
 
 
265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1137  ABC transporter related  43.1 
 
 
239 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.195731 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  43.31 
 
 
589 aa  187  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1599  ABC transporter related  41.84 
 
 
239 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86219  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  43.2 
 
 
271 aa  187  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1653  ABC transporter related protein  42.57 
 
 
610 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487091  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0795  ABC transporter related  39.92 
 
 
253 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.213138  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1930  ABC transporter related  43.28 
 
 
247 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211937  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  42.29 
 
 
258 aa  186  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1098  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.17 
 
 
241 aa  185  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.559592  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  44.4 
 
 
255 aa  185  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2427  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  42.26 
 
 
239 aa  185  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.32 
 
 
609 aa  184  8e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5639  ABC transporter related  41.25 
 
 
253 aa  184  9e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1678  ABC transporter-like protein  43.88 
 
 
238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.939026  normal  0.0800845 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0850  ATPase  42.04 
 
 
242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  43.48 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1196  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.81 
 
 
244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  41.27 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1531  ABC transporter related  42.26 
 
 
239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  40.24 
 
 
603 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1436  ABC transporter-related protein  42.26 
 
 
239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  42.25 
 
 
265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  38.74 
 
 
256 aa  182  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  41.27 
 
 
258 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  41.27 
 
 
258 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  41.27 
 
 
258 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3648  ABC transporter related  42.98 
 
 
244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 
256 aa  181  6e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1907  ABC transporter related  39.26 
 
 
253 aa  181  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  41.37 
 
 
255 aa  182  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0315  ABC transporter related  41.2 
 
 
260 aa  181  8.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.317269  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  41.83 
 
 
612 aa  181  9.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  40.16 
 
 
263 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0311  ABC transporter related  38.96 
 
 
237 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.382743  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  40.32 
 
 
275 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  41.77 
 
 
283 aa  180  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  40.71 
 
 
255 aa  180  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  40.56 
 
 
255 aa  180  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1827  ABC transporter related  42.32 
 
 
242 aa  180  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.017401  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  40.32 
 
 
275 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3248  branched chain amino acid ABC tranpsorter permease/ATP-binding protein  42.97 
 
 
589 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2143  ABC transporter related  42.98 
 
 
257 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  39.06 
 
 
259 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  40.32 
 
 
275 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1426  ABC transporter related protein  42.45 
 
 
253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.259365  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  41.27 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1565  ABC transporter related  39.92 
 
 
246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0845  ABC transporter related  45.68 
 
 
241 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.791281 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  40.08 
 
 
256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  41.77 
 
 
594 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  41.77 
 
 
594 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  41.77 
 
 
594 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  41.77 
 
 
594 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  41.77 
 
 
594 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5100  ABC transporter related  40.75 
 
 
286 aa  179  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.143244  normal  0.122241 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  41.77 
 
 
594 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  41.77 
 
 
594 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  40.64 
 
 
257 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  41.56 
 
 
616 aa  178  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  42.57 
 
 
258 aa  178  5.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3585  ABC transporter related  40.75 
 
 
285 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14155  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  41.77 
 
 
594 aa  178  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  40.62 
 
 
257 aa  178  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5319  ABC transporter related  40.75 
 
 
285 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.507141  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4649  ABC transporter related  39.68 
 
 
260 aa  178  8e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  39.04 
 
 
256 aa  178  9e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  42.58 
 
 
259 aa  177  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>