More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0360 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0360  ABC transporter related  100 
 
 
243 aa  482  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  55.56 
 
 
241 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1930  ABC transporter related  57.51 
 
 
247 aa  247  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211937  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.79 
 
 
248 aa  246  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2887  ABC transporter ATP-binding protein  51.25 
 
 
239 aa  236  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0795  ABC transporter related  52.79 
 
 
253 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.213138  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1951  ABC transporter related  53.91 
 
 
244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1907  ABC transporter related  51.5 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1662  ABC transporter related  52.7 
 
 
243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1850  ABC transporter related  54.13 
 
 
244 aa  231  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  46.72 
 
 
603 aa  228  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0144  ABC transporter related  49.37 
 
 
249 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3617  ABC transporter related  53.62 
 
 
244 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.509048  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  45.15 
 
 
240 aa  227  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  48.55 
 
 
245 aa  226  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1709  ABC transporter related  48.72 
 
 
245 aa  226  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.995593  normal  0.0343274 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3648  ABC transporter related  49.37 
 
 
244 aa  226  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1098  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.95 
 
 
241 aa  223  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.559592  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  46.31 
 
 
609 aa  220  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1196  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.37 
 
 
244 aa  219  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0898  ABC transporter related  45.23 
 
 
245 aa  219  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2282  ABC transporter related  48.95 
 
 
239 aa  220  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2299  ABC transporter related  48.95 
 
 
242 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1599  ABC transporter related  47.46 
 
 
239 aa  218  7e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86219  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1499  ABC transporter related  47.28 
 
 
244 aa  217  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.229827  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0311  ABC transporter related  43.04 
 
 
237 aa  216  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.382743  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  46.86 
 
 
616 aa  215  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  45 
 
 
261 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2008  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 
239 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.366522  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0850  ATPase  46.44 
 
 
242 aa  213  9.999999999999999e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1452  ABC transporter related  47.88 
 
 
239 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  44.66 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  46.83 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1540  ABC transporter related  48.05 
 
 
242 aa  212  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1394  ABC transporter related protein  49.6 
 
 
255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  46 
 
 
256 aa  211  7e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1137  ABC transporter related  47.03 
 
 
239 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.195731 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 
254 aa  211  9e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  45.82 
 
 
259 aa  211  9e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  45.82 
 
 
258 aa  210  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2427  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  45.99 
 
 
239 aa  209  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  42.03 
 
 
288 aa  209  4e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2168  ABC transporter related  45.06 
 
 
274 aa  209  4e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  43.78 
 
 
271 aa  209  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  45.16 
 
 
333 aa  208  6e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  45.82 
 
 
255 aa  208  7e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4794  ABC transporter related  46.69 
 
 
259 aa  208  7e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.130359  normal  0.133792 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1436  ABC transporter-related protein  45.99 
 
 
239 aa  208  7e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1531  ABC transporter related  45.99 
 
 
239 aa  208  8e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.14 
 
 
256 aa  206  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  45.34 
 
 
258 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  42.86 
 
 
255 aa  206  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  41.67 
 
 
259 aa  206  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  44.35 
 
 
293 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  43.55 
 
 
283 aa  205  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0864  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.08 
 
 
241 aa  205  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303052  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  43.25 
 
 
255 aa  205  6e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  43.65 
 
 
265 aa  205  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3102  ABC transporter related  41.11 
 
 
258 aa  204  8e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2129  ABC transporter related  50 
 
 
244 aa  204  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.206631 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  41.2 
 
 
263 aa  204  8e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1827  ABC transporter related  44.21 
 
 
242 aa  204  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.017401  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  44.44 
 
 
264 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3338  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.02 
 
 
251 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1481  ABC transporter related  45 
 
 
259 aa  203  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  41.2 
 
 
256 aa  203  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  44.18 
 
 
275 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  41.63 
 
 
257 aa  203  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0330  ABC transporter related  43.98 
 
 
245 aa  203  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.813664 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  43.2 
 
 
256 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  41.63 
 
 
257 aa  203  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  44.13 
 
 
268 aa  203  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  44.18 
 
 
275 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  44.18 
 
 
275 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0845  ABC transporter related  50 
 
 
241 aa  202  3e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.791281 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2143  ABC transporter related  45 
 
 
257 aa  202  5e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1521  ABC transporter related  49.16 
 
 
242 aa  202  5e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000012745  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  44.58 
 
 
255 aa  201  6e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1101  ABC transporter related  50 
 
 
255 aa  201  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00497633  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1426  ABC transporter related protein  43.6 
 
 
253 aa  201  8e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.259365  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  42.69 
 
 
254 aa  201  8e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  42.74 
 
 
258 aa  200  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0836  ABC transporter-related protein  44.18 
 
 
253 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  44.53 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  44.76 
 
 
334 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  44.19 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  44.05 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  44.8 
 
 
250 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3868  ABC transporter related  45.76 
 
 
237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  40.37 
 
 
284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  43.95 
 
 
276 aa  199  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6134  ABC transporter related  45.38 
 
 
239 aa  199  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204704  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  39.92 
 
 
265 aa  199  3e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0824  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.91 
 
 
257 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381559  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  43.03 
 
 
260 aa  199  3e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3142  ABC transporter related  42.52 
 
 
257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168533  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  44.05 
 
 
255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  45.35 
 
 
270 aa  198  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3397  ABC transporter related  46.38 
 
 
249 aa  198  6e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0271922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  45.6 
 
 
271 aa  198  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>