More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3617 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_3617  ABC transporter related  100 
 
 
244 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.509048  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1850  ABC transporter related  97.54 
 
 
244 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1951  ABC transporter related  93.44 
 
 
244 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1662  ABC transporter related  88.93 
 
 
243 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2887  ABC transporter ATP-binding protein  84.94 
 
 
239 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1499  ABC transporter related  70.34 
 
 
244 aa  335  5e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.229827  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1101  ABC transporter related  65.4 
 
 
255 aa  297  9e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00497633  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2129  ABC transporter related  65.82 
 
 
244 aa  296  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.206631 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  51.67 
 
 
245 aa  242  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1709  ABC transporter related  47.52 
 
 
245 aa  238  9e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.995593  normal  0.0343274 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0311  ABC transporter related  48.07 
 
 
237 aa  235  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.382743  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0898  ABC transporter related  49.38 
 
 
245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  46.47 
 
 
241 aa  230  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2299  ABC transporter related  48.76 
 
 
242 aa  229  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1540  ABC transporter related  48.35 
 
 
242 aa  227  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.79 
 
 
248 aa  227  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0800  ABC transporter related  48.57 
 
 
253 aa  227  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2008  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.41 
 
 
239 aa  225  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.366522  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2333  ABC transporter related protein  48.74 
 
 
243 aa  224  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.552467  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2427  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  46.38 
 
 
239 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  48.39 
 
 
261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  47.79 
 
 
276 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  44.3 
 
 
240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1436  ABC transporter-related protein  47.01 
 
 
239 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  48.41 
 
 
271 aa  218  6e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  46.37 
 
 
271 aa  218  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1531  ABC transporter related  47.01 
 
 
239 aa  218  6e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  48 
 
 
280 aa  217  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  44.18 
 
 
251 aa  215  4e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2282  ABC transporter related  49.37 
 
 
239 aa  214  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0850  ATPase  46.67 
 
 
242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  44.98 
 
 
264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  45.97 
 
 
275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  45.97 
 
 
275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  45.97 
 
 
275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  42.76 
 
 
307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1452  ABC transporter related  45.11 
 
 
239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  46.03 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1827  ABC transporter related  47.26 
 
 
242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.017401  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  45.97 
 
 
283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  43.92 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0360  ABC transporter related  53.62 
 
 
243 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0144  ABC transporter related  44.35 
 
 
249 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  44 
 
 
250 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1930  ABC transporter related  50.21 
 
 
247 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211937  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  45.56 
 
 
254 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  46.37 
 
 
293 aa  211  9e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  46.59 
 
 
333 aa  209  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  44.58 
 
 
265 aa  209  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  42.42 
 
 
302 aa  209  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  43.2 
 
 
250 aa  208  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  43.2 
 
 
255 aa  208  6e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0330  ABC transporter related  43.75 
 
 
245 aa  208  8e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.813664 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0511  ABC transporter related  42.37 
 
 
238 aa  206  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0526817  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  43.48 
 
 
257 aa  206  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  44.98 
 
 
255 aa  206  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  45.42 
 
 
603 aa  206  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  46.59 
 
 
334 aa  206  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3397  ABC transporter related  46.28 
 
 
249 aa  206  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0271922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.88 
 
 
258 aa  206  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0795  ABC transporter related  47.48 
 
 
253 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.213138  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  44.31 
 
 
258 aa  205  6e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  44.58 
 
 
255 aa  204  9e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1678  ABC transporter-like protein  48.51 
 
 
238 aa  204  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.939026  normal  0.0800845 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  44.71 
 
 
255 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3648  ABC transporter related  45.42 
 
 
244 aa  204  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  44.94 
 
 
258 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1907  ABC transporter related  48.32 
 
 
253 aa  203  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  44.53 
 
 
258 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5639  ABC transporter related  45.27 
 
 
253 aa  203  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1599  ABC transporter related  42.98 
 
 
239 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86219  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2496  ABC transporter related  46.44 
 
 
243 aa  202  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0963402  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  46.59 
 
 
252 aa  202  6e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2143  ABC transporter related  44.08 
 
 
257 aa  201  7e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  42.86 
 
 
256 aa  201  8e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  46.84 
 
 
616 aa  201  8e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  43.03 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.13 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  43.55 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1098  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 
241 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.559592  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  44.53 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  44.53 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  44.53 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.18 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0273  ABC transporter related  44.05 
 
 
253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197534  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  45.38 
 
 
256 aa  199  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  43.55 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1137  ABC transporter related  43.64 
 
 
239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.195731 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4421  ABC transporter related  46 
 
 
259 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11811  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  43.55 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  43.31 
 
 
260 aa  199  3e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0355  ABC transporter related  42.51 
 
 
258 aa  199  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  42.35 
 
 
255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  43.98 
 
 
609 aa  199  5e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  44.13 
 
 
258 aa  199  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  42.57 
 
 
250 aa  199  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  43.82 
 
 
259 aa  198  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  42 
 
 
259 aa  197  9e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  42.63 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  43.15 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>