More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1101 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1101  ABC transporter related  100 
 
 		 255 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00497633  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2129  ABC transporter related  88.89 
 
 		 244 aa  397  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.206631 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1499  ABC transporter related  71.49 
 
 		 244 aa  350  8.999999999999999e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.229827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2887  ABC transporter ATP-binding protein  65.8 
 
 		 239 aa  309  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3617  ABC transporter related  65.4 
 
 		 244 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.509048  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1850  ABC transporter related  64.98 
 
 		 244 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1662  ABC transporter related  65.25 
 
 		 243 aa  304  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1951  ABC transporter related  64.02 
 
 		 244 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  50.42 
 
 		 241 aa  237  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  51.27 
 
 		 245 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1709  ABC transporter related  50.63 
 
 		 245 aa  235  7e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.995593  normal  0.0343274 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0898  ABC transporter related  50.21 
 
 		 245 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0311  ABC transporter related  50.89 
 
 		 237 aa  229  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.382743  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  47.98 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  48 
 
 		 283 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0800  ABC transporter related  49.79 
 
 		 253 aa  217  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2427  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  47.01 
 
 		 239 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2008  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.15 
 
 		 239 aa  216  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.366522  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  48.4 
 
 		 293 aa  215  7e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1452  ABC transporter related  46.38 
 
 		 239 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  46.54 
 
 		 334 aa  214  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.76 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1436  ABC transporter-related protein  46.58 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  43.28 
 
 		 240 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  46 
 
 		 333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2333  ABC transporter related protein  51.27 
 
 		 243 aa  210  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.552467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0845  ABC transporter related  51.67 
 
 		 241 aa  211  1e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.791281 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1531  ABC transporter related  46.15 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  44.66 
 
 		 263 aa  209  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  44.58 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  45.67 
 
 		 275 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1930  ABC transporter related  51.93 
 
 		 247 aa  209  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  45.67 
 
 		 275 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  47.2 
 
 		 294 aa  209  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  45.67 
 
 		 275 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3397  ABC transporter related  49.79 
 
 		 249 aa  209  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0271922 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  45.45 
 
 		 280 aa  209  5e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0262  ABC transporter related  44.62 
 
 		 254 aa  208  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0850  ATPase  44.96 
 
 		 242 aa  208  7e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  45.82 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3648  ABC transporter related  46.67 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  48.06 
 
 		 608 aa  207  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  47.39 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2282  ABC transporter related  50.86 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  45.42 
 
 		 257 aa  206  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  47.18 
 
 		 261 aa  206  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2299  ABC transporter related  47.86 
 
 		 242 aa  205  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1827  ABC transporter related  44.12 
 
 		 242 aa  205  6e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.017401  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  46.01 
 
 		 278 aa  205  7e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  46.83 
 
 		 276 aa  205  7e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 		 256 aa  204  8e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  45.38 
 
 		 256 aa  204  8e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  48.39 
 
 		 589 aa  204  9e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7437  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.66 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0330  ABC transporter related  44.17 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.813664 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0360  ABC transporter related  50 
 
 		 243 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5836  ABC transporter related  47.24 
 
 		 272 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  43.95 
 
 		 271 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1540  ABC transporter related  46.89 
 
 		 242 aa  202  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  47.2 
 
 		 256 aa  201  7e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  45.78 
 
 		 250 aa  201  8e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5693  ABC transporter related  49.2 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2168  ABC transporter related  46.4 
 
 		 274 aa  200  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  43.25 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1907  ABC transporter related  47.68 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  41.61 
 
 		 288 aa  199  5e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1519  ABC transporter related  45.98 
 
 		 597 aa  199  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1521  ABC transporter related  48.75 
 
 		 242 aa  198  6e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000012745  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.31 
 
 		 258 aa  198  7e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1085  ABC transporter related  46.77 
 
 		 277 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0894019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  43.87 
 
 		 259 aa  198  9e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  42.34 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.57 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.03 
 
 		 256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  45.6 
 
 		 616 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  44.18 
 
 		 255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3338  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.4 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1098  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.61 
 
 		 241 aa  196  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.559592  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  43.78 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  44.4 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  46.56 
 
 		 590 aa  196  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5639  ABC transporter related  44.17 
 
 		 253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0449  ABC transporter related  49.38 
 
 		 242 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  44.58 
 
 		 250 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1674  ABC transporter related  44.58 
 
 		 251 aa  195  6e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0144  ABC transporter related  43.7 
 
 		 249 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0795  ABC transporter related  45.76 
 
 		 253 aa  194  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.213138  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1678  ABC transporter-like protein  50.21 
 
 		 238 aa  194  9e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.939026  normal  0.0800845 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0546  ABC transporter related  48.75 
 
 		 242 aa  194  1e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0891266  hitchhiker  0.0003203 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3658  ABC transporter related  42.13 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3978  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  42.52 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1221  decreased coverage  0.00203887 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2496  ABC transporter related  46.38 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0963402  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6134  ABC transporter related  46.15 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204704  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1196  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.61 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  44.21 
 
 		 603 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  43.89 
 
 		 951 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  42.52 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1137  ABC transporter related  43.51 
 
 		 239 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.195731 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  42.46 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0355  ABC transporter related  44.18 
 
 		 258 aa  192  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>