More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0845 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0845  ABC transporter related  100 
 
 		 241 aa  475  1e-133  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.791281 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1521  ABC transporter related  81.67 
 
 		 242 aa  377  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000012745  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0449  ABC transporter related  80.83 
 
 		 242 aa  370  1e-102  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0546  ABC transporter related  75.83 
 
 		 242 aa  353  1e-96  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0891266  hitchhiker  0.0003203 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1101  ABC transporter related  51.67 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00497633  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0144  ABC transporter related  47.5 
 
 		 249 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0800  ABC transporter related  51.48 
 
 		 253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2129  ABC transporter related  51.67 
 
 		 244 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.206631 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1540  ABC transporter related  45 
 
 		 242 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2299  ABC transporter related  46.38 
 
 		 242 aa  209  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2887  ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2008  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 239 aa  208  7e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.366522  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2333  ABC transporter related protein  48.54 
 
 		 243 aa  208  7e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.552467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2364  ABC transporter related  45.61 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1499  ABC transporter related  46.47 
 
 		 244 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.229827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1951  ABC transporter related  45.76 
 
 		 244 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3648  ABC transporter related  47.7 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2143  ABC transporter related  47.19 
 
 		 257 aa  206  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2202  ABC transporter related  45.76 
 
 		 235 aa  205  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3617  ABC transporter related  45.34 
 
 		 244 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.509048  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  45.19 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1850  ABC transporter related  45.34 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0360  ABC transporter related  50 
 
 		 243 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6134  ABC transporter related  47.03 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204704  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5639  ABC transporter related  46.67 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  42.63 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  42.63 
 
 		 265 aa  202  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.8 
 
 		 248 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  44.22 
 
 		 259 aa  202  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0511  ABC transporter related  43.22 
 
 		 238 aa  202  4e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0526817  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0598  ABC transporter related  46.18 
 
 		 253 aa  202  5e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1709  ABC transporter related  44.35 
 
 		 245 aa  201  7e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.995593  normal  0.0343274 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1098  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 		 241 aa  201  8e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.559592  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0898  ABC transporter related  43.75 
 
 		 245 aa  201  8e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  46.84 
 
 		 241 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2586  ABC transporter related  45.38 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1678  ABC transporter-like protein  49.16 
 
 		 238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.939026  normal  0.0800845 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  42.13 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1806  ABC transporter related  44.86 
 
 		 246 aa  198  7e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.944964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0330  ABC transporter related  45.68 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.813664 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  42.86 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1907  ABC transporter related  44.21 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2849  ABC transporter related protein  43.62 
 
 		 247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485647  normal  0.511604 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1662  ABC transporter related  44.92 
 
 		 243 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1975  ABC transporter related  43.62 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0315  ABC transporter related  45.45 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1426  ABC transporter related protein  44.53 
 
 		 253 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.259365  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1196  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.42 
 
 		 244 aa  195  6e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  42.46 
 
 		 257 aa  195  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  41.27 
 
 		 258 aa  194  7e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0795  ABC transporter related  45.83 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.213138  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0824  ABC transporter related  44.26 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  42.06 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0677  ABC transporter related  41.83 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.888321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  44.18 
 
 		 589 aa  193  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  42.35 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  40.8 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1114  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.43 
 
 		 256 aa  191  6e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  42.4 
 
 		 250 aa  191  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  41.6 
 
 		 255 aa  191  8e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  42.06 
 
 		 256 aa  191  8e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  40.71 
 
 		 255 aa  191  9e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  41.1 
 
 		 240 aa  190  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1565  ABC transporter related  43.46 
 
 		 246 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  40 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0864  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.95 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303052  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  38.25 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1930  ABC transporter related  45.99 
 
 		 247 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.9 
 
 		 256 aa  189  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.65 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4552  ABC transporter related  41.43 
 
 		 260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  46.12 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  42.8 
 
 		 268 aa  189  4e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2282  ABC transporter related  41.6 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  41.6 
 
 		 250 aa  188  8e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  41.63 
 
 		 271 aa  187  9e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  39.44 
 
 		 270 aa  187  9e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  40.87 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4896  ABC transporter related protein  42 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  39.6 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2029  ABC transporter related  45.2 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  42.04 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5244  ABC transporter ATP-binding protein  42.8 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.104577 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  41.43 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  43.75 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0222  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.05 
 
 		 262 aa  186  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  46.18 
 
 		 590 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  40 
 
 		 259 aa  186  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  42.92 
 
 		 603 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1502  ABC transporter related  44.44 
 
 		 247 aa  186  2e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.202973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1827  ABC transporter related  42.44 
 
 		 242 aa  186  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.017401  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1039  ABC transporter related  41.04 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.418168 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  41.27 
 
 		 333 aa  186  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  44.62 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  41.2 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  41.27 
 
 		 256 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1452  ABC transporter related  43.64 
 
 		 239 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5693  ABC transporter related  42.86 
 
 		 271 aa  186  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  42.91 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3968  ABC transporter related protein  40.8 
 
 		 263 aa  185  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>