More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5639 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5639  ABC transporter related  100 
 
 		 253 aa  502  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2143  ABC transporter related  57.38 
 
 		 257 aa  261  4.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0144  ABC transporter related  51.6 
 
 		 249 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1540  ABC transporter related  52.32 
 
 		 242 aa  242  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2299  ABC transporter related  53.56 
 
 		 242 aa  238  9e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1137  ABC transporter related  49.37 
 
 		 239 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.195731 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  47.06 
 
 		 240 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1599  ABC transporter related  49.15 
 
 		 239 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86219  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0795  ABC transporter related  51.38 
 
 		 253 aa  222  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.213138  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3648  ABC transporter related  47.92 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1930  ABC transporter related  47.79 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2496  ABC transporter related  48.76 
 
 		 243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0963402  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0800  ABC transporter related  46.19 
 
 		 253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1951  ABC transporter related  46.31 
 
 		 244 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  44.63 
 
 		 245 aa  211  7.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2008  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.7 
 
 		 239 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.366522  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  45.83 
 
 		 241 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1850  ABC transporter related  46.31 
 
 		 244 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1827  ABC transporter related  44.44 
 
 		 242 aa  209  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.017401  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3617  ABC transporter related  46.31 
 
 		 244 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.509048  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.38 
 
 		 248 aa  208  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2129  ABC transporter related  47.33 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.206631 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1907  ABC transporter related  47.56 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  45.97 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  43.78 
 
 		 280 aa  207  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1662  ABC transporter related  44.77 
 
 		 243 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2427  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  47.48 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1452  ABC transporter related  47.9 
 
 		 239 aa  205  5e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1709  ABC transporter related  43.21 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.995593  normal  0.0343274 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2282  ABC transporter related  45.15 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1678  ABC transporter-like protein  47.23 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.939026  normal  0.0800845 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1098  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.3 
 
 		 241 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.559592  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1531  ABC transporter related  47.68 
 
 		 239 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1436  ABC transporter-related protein  47.48 
 
 		 239 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  44.62 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0850  ATPase  43.33 
 
 		 242 aa  200  9.999999999999999e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3397  ABC transporter related  44.53 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0271922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2887  ABC transporter ATP-binding protein  44.68 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  42.8 
 
 		 294 aa  199  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  45.53 
 
 		 603 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.76 
 
 		 255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1196  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.72 
 
 		 244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0845  ABC transporter related  46.67 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.791281 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1521  ABC transporter related  48.33 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000012745  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3256  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.37 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  45.6 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0898  ABC transporter related  41.15 
 
 		 245 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1101  ABC transporter related  43.75 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00497633  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  43.2 
 
 		 283 aa  196  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 		 256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 		 258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0864  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.95 
 
 		 241 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303052  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0311  ABC transporter related  42.67 
 
 		 237 aa  194  9e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.382743  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  40.96 
 
 		 255 aa  194  9e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1499  ABC transporter related  42.74 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.229827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  40.98 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  41.73 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7437  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.37 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  38.96 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  40.87 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  43.2 
 
 		 275 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1048  ABC transporter related  43.65 
 
 		 549 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  43.2 
 
 		 275 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  43.2 
 
 		 275 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0330  ABC transporter related  41.67 
 
 		 245 aa  192  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.813664 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  40.53 
 
 		 270 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  40.53 
 
 		 270 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  39.36 
 
 		 265 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  39.36 
 
 		 265 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  41.27 
 
 		 256 aa  192  6e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  43.15 
 
 		 609 aa  191  9e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  42.8 
 
 		 293 aa  191  9e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1565  ABC transporter related  43.09 
 
 		 246 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  40.78 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2014  ABC transporter related  41.38 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.94 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  41.13 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4552  ABC transporter related  42.25 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  40.32 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  38.15 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  40.48 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  40.31 
 
 		 269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  40.08 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4334  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  38.58 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231493  normal  0.133886 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  39.45 
 
 		 259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0273  ABC transporter related  41.67 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197534  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  39.36 
 
 		 259 aa  189  4e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  40.32 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  41.6 
 
 		 260 aa  189  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0546  ABC transporter related  46.25 
 
 		 242 aa  189  5e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0891266  hitchhiker  0.0003203 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0732  ABC transporter related  44.13 
 
 		 256 aa  189  5e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  37.6 
 
 		 252 aa  189  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  41.6 
 
 		 260 aa  189  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2333  ABC transporter related protein  42.98 
 
 		 243 aa  188  5.999999999999999e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.552467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  40.32 
 
 		 255 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  41.04 
 
 		 260 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  41.83 
 
 		 271 aa  188  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2586  ABC transporter related  42.15 
 
 		 237 aa  188  7e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  41.04 
 
 		 257 aa  188  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  40.08 
 
 		 258 aa  187  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>