More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2423 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  100 
 
 
269 aa  547  1e-155  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  84.59 
 
 
269 aa  468  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  82.71 
 
 
270 aa  456  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1598  ABC transporter related protein  69.11 
 
 
260 aa  343  1e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5007  ABC transporter related  61.35 
 
 
261 aa  330  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  60.84 
 
 
274 aa  329  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0953  ABC transporter related  62.15 
 
 
274 aa  329  4e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.513158  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2278  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  62.15 
 
 
279 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0375  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livG  60.08 
 
 
273 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529081  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3541  ABC transporter related  60.56 
 
 
260 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0603  ABC transporter related  60.56 
 
 
260 aa  327  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15363  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5038  ABC transporter related  64.71 
 
 
286 aa  326  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3608  ABC transporter related  60.16 
 
 
261 aa  325  4.0000000000000003e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  62.55 
 
 
269 aa  324  7e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0215  ABC transporter-related protein  62.15 
 
 
313 aa  323  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  59.29 
 
 
282 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3364  ABC transporter related  57.72 
 
 
274 aa  322  6e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4010  ABC transporter related  61.35 
 
 
272 aa  321  7e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  58.89 
 
 
296 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3435  ABC transporter-related protein  59.76 
 
 
264 aa  320  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000808082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1158  ABC transporter related  57.95 
 
 
261 aa  320  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  58.5 
 
 
275 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  59.77 
 
 
294 aa  318  6e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0261  ABC transporter related  60.56 
 
 
306 aa  317  9e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  60.32 
 
 
277 aa  317  9e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  59.07 
 
 
289 aa  316  3e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1831  ABC transporter related  58.96 
 
 
269 aa  315  7e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0460  ABC transporter related  58.96 
 
 
261 aa  313  9.999999999999999e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0469  ABC transporter related  58.96 
 
 
261 aa  313  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.304191 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000404  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  57.87 
 
 
266 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.428911  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3510  ABC transporter component  57.79 
 
 
274 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2724  ABC transporter related  57.63 
 
 
277 aa  313  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.407856 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  57.87 
 
 
276 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_809  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  55.39 
 
 
276 aa  311  9e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3137  ABC transporter-related protein  58.17 
 
 
265 aa  311  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  57.09 
 
 
280 aa  309  4e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0822  ABC transporter related  55.64 
 
 
276 aa  308  5e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0296  ABC transporter related  58.66 
 
 
269 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0250  ABC transporter related  58.96 
 
 
260 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5714  putative high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.77 
 
 
273 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  0.906173 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0786  ABC transporter-related protein  58.17 
 
 
263 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0938  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.43 
 
 
270 aa  306  3e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0956002  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2360  ABC transporter related  61.02 
 
 
278 aa  305  5.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.547386 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2611  ABC transporter-related protein  57.37 
 
 
265 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2309  ABC transporter related  57.48 
 
 
269 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0078002 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3417  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.78 
 
 
269 aa  302  3.0000000000000004e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0114  ABC transporter related  62.15 
 
 
272 aa  301  8.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.95101  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0569  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  63.35 
 
 
255 aa  300  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.383942  normal  0.0445823 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1542  ABC transporter related protein  57.71 
 
 
255 aa  296  2e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000371483  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0135  ABC transporter-like protein  57.09 
 
 
255 aa  292  5e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3842  ABC transporter related  58.2 
 
 
289 aa  291  6e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000140209  normal  0.918006 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0549  ABC transporter related  55.34 
 
 
265 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3008  ABC transporter-related protein  53.94 
 
 
275 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00336682  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43540  ABC transporter, ATP binding component  55.34 
 
 
260 aa  280  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0288454  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2990  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.05 
 
 
264 aa  279  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00578117  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.2 
 
 
277 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0300535  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2281  ABC transporter related  54.3 
 
 
264 aa  277  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2987  ABC transporter related  55.6 
 
 
277 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5286  ABC transporter related  49.61 
 
 
283 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43780  ABC transporter, LivG family  52.11 
 
 
262 aa  256  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.430374  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3832  ABC transporter related protein  50.4 
 
 
285 aa  253  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3163  ABC transporter related protein  48.21 
 
 
292 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5146  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  48.25 
 
 
296 aa  252  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0759  ABC transporter related protein  48.59 
 
 
268 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.27 
 
 
255 aa  246  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1465  ABC transporter-like protein  48 
 
 
291 aa  246  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3256  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.27 
 
 
255 aa  246  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  47.76 
 
 
255 aa  246  4e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3030  ABC transporter related protein  48 
 
 
274 aa  245  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4938  ABC transporter related  48.39 
 
 
275 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.584937  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2376  ABC transporter-like protein  49.4 
 
 
251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4097  ABC transporter related  47.24 
 
 
292 aa  242  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  50 
 
 
271 aa  242  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2748  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.19 
 
 
266 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.916728  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3799  ABC transporter related  46.25 
 
 
256 aa  239  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.718599 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3491  ABC transporter related  45.45 
 
 
256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.411905  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1425  ABC transporter related  46.37 
 
 
253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715565  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3005  ABC transporter related  51.79 
 
 
256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2442  ABC transporter related protein  47.81 
 
 
250 aa  239  4e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2544  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.04 
 
 
256 aa  238  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.234113 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  45.85 
 
 
258 aa  238  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  44.92 
 
 
259 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0356  ABC transporter related  44.49 
 
 
290 aa  238  5.999999999999999e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  43.63 
 
 
261 aa  238  9e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4552  ABC transporter related  44.84 
 
 
260 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  47.2 
 
 
273 aa  237  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  44.62 
 
 
261 aa  236  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3501  ABC transporter related  47.58 
 
 
282 aa  236  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.111605  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2316  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.29 
 
 
261 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  44.11 
 
 
262 aa  235  6e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4818  ABC transporter related  46.43 
 
 
274 aa  235  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177699  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  47.1 
 
 
261 aa  234  9e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  46.4 
 
 
261 aa  234  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0865  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.8 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154557  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2141  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.8 
 
 
257 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0558111  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1836  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44 
 
 
257 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0775  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.8 
 
 
257 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  43.65 
 
 
270 aa  233  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4298  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 
305 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  hitchhiker  0.00350718 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3626  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.48 
 
 
257 aa  231  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>