More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4062 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  100 
 
 		 289 aa  585  1e-166  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  83.33 
 
 		 294 aa  474  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  76.36 
 
 		 277 aa  443  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2360  ABC transporter related  76.01 
 
 		 278 aa  410  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.547386 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3842  ABC transporter related  72.89 
 
 		 289 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000140209  normal  0.918006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  60.85 
 
 		 270 aa  319  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  59.07 
 
 		 269 aa  316  3e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  58.53 
 
 		 269 aa  308  6.999999999999999e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  53.85 
 
 		 280 aa  301  8.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000404  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  56.64 
 
 		 266 aa  300  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.428911  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1598  ABC transporter related protein  59.6 
 
 		 260 aa  299  5e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5714  putative high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.92 
 
 		 273 aa  296  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  0.906173 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1831  ABC transporter related  57.09 
 
 		 269 aa  296  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3510  ABC transporter component  57.2 
 
 		 274 aa  295  6e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  56.75 
 
 		 296 aa  292  5e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  56.75 
 
 		 282 aa  292  6e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3417  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.69 
 
 		 269 aa  291  7e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5038  ABC transporter related  56.64 
 
 		 286 aa  291  7e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  53.76 
 
 		 274 aa  291  9e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  56.92 
 
 		 275 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0375  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livG  54.05 
 
 		 273 aa  290  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3137  ABC transporter-related protein  55.78 
 
 		 265 aa  290  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2724  ABC transporter related  53.18 
 
 		 277 aa  288  6e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.407856 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  55.34 
 
 		 276 aa  288  8e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3364  ABC transporter related  52.78 
 
 		 274 aa  288  9e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2278  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  53.26 
 
 		 279 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2611  ABC transporter-related protein  54.72 
 
 		 265 aa  287  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0953  ABC transporter related  54.4 
 
 		 274 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.513158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0603  ABC transporter related  54 
 
 		 260 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  54.26 
 
 		 269 aa  285  8e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2281  ABC transporter related  56.25 
 
 		 264 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0215  ABC transporter-related protein  53.78 
 
 		 313 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4010  ABC transporter related  53.88 
 
 		 272 aa  283  3.0000000000000004e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2309  ABC transporter related  56.13 
 
 		 269 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0078002 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0261  ABC transporter related  52.19 
 
 		 306 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0296  ABC transporter related  54.94 
 
 		 269 aa  280  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3435  ABC transporter-related protein  52.19 
 
 		 264 aa  280  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000808082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1158  ABC transporter related  52.78 
 
 		 261 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0786  ABC transporter-related protein  53.17 
 
 		 263 aa  280  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0250  ABC transporter related  51.19 
 
 		 260 aa  280  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0469  ABC transporter related  52.59 
 
 		 261 aa  279  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.304191 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0460  ABC transporter related  52.59 
 
 		 261 aa  279  4e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3541  ABC transporter related  51.98 
 
 		 260 aa  278  5e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3608  ABC transporter related  51.39 
 
 		 261 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5007  ABC transporter related  52.8 
 
 		 261 aa  276  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0549  ABC transporter related  51.75 
 
 		 265 aa  275  7e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_809  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  49.24 
 
 		 276 aa  266  2e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2990  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.62 
 
 		 264 aa  265  7e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00578117  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0114  ABC transporter related  52.12 
 
 		 272 aa  265  7e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.95101  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0938  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.62 
 
 		 270 aa  265  8.999999999999999e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0956002  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0569  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  54.11 
 
 		 255 aa  262  4e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.383942  normal  0.0445823 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3163  ABC transporter related protein  53.41 
 
 		 292 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0822  ABC transporter related  47.71 
 
 		 276 aa  261  8e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.41 
 
 		 277 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0300535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2987  ABC transporter related  49.8 
 
 		 277 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2376  ABC transporter-like protein  53.2 
 
 		 251 aa  257  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0759  ABC transporter related protein  53.01 
 
 		 268 aa  256  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7076  high-affinity branched-chain amino acid transport protein  47.47 
 
 		 265 aa  256  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2442  ABC transporter related protein  50.79 
 
 		 250 aa  255  6e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43540  ABC transporter, ATP binding component  49.8 
 
 		 260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0288454  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  47.08 
 
 		 265 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3832  ABC transporter related protein  51.75 
 
 		 285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0135  ABC transporter-like protein  52.61 
 
 		 255 aa  252  6e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3555  ABC transporter related  46.88 
 
 		 265 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.520716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4818  ABC transporter related  50.59 
 
 		 274 aa  249  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0356  ABC transporter related  47.24 
 
 		 290 aa  246  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5146  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  47.64 
 
 		 296 aa  246  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4240  ABC transporter related  46.46 
 
 		 266 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1465  ABC transporter-like protein  51.75 
 
 		 291 aa  246  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1542  ABC transporter related protein  50.6 
 
 		 255 aa  244  8e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000371483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  48.61 
 
 		 273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3501  ABC transporter related  49.81 
 
 		 282 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.111605  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  43.58 
 
 		 263 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3030  ABC transporter related protein  48.52 
 
 		 274 aa  239  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1425  ABC transporter related  45.06 
 
 		 253 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715565  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4097  ABC transporter related  46.59 
 
 		 292 aa  239  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5286  ABC transporter related  45.04 
 
 		 283 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  45.49 
 
 		 254 aa  236  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3005  ABC transporter related  49.01 
 
 		 256 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2748  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.01 
 
 		 266 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.916728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  42.29 
 
 		 256 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43780  ABC transporter, LivG family  47.84 
 
 		 262 aa  234  9e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.430374  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3008  ABC transporter-related protein  46.44 
 
 		 275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00336682  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1001  ABC transporter related  48.47 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  44.66 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2544  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 256 aa  232  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.234113 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  42.41 
 
 		 259 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4938  ABC transporter related  45.35 
 
 		 275 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.584937  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.08 
 
 		 255 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3799  ABC transporter related  44.66 
 
 		 256 aa  230  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.718599 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  46.22 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3256  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.69 
 
 		 255 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  46.43 
 
 		 259 aa  229  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  46.4 
 
 		 250 aa  229  5e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4298  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.65 
 
 		 305 aa  229  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  hitchhiker  0.00350718 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4056  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.46 
 
 		 256 aa  228  6e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  44.76 
 
 		 268 aa  228  6e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  46.4 
 
 		 250 aa  228  7e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  46.4 
 
 		 251 aa  228  9e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0107  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.46 
 
 		 256 aa  228  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>