More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2544 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2544  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 256 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.234113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3799  ABC transporter related  75 
 
 		 256 aa  383  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.718599 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3491  ABC transporter related  74.22 
 
 		 256 aa  378  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.411905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3873  ABC transporter related  74.22 
 
 		 256 aa  358  4e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0725392 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43780  ABC transporter, LivG family  65.88 
 
 		 262 aa  325  4.0000000000000003e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.430374  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6107  ABC transporter related  61.42 
 
 		 261 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.319085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7156  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  60 
 
 		 264 aa  318  3.9999999999999996e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2748  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  64.68 
 
 		 266 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.916728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3005  ABC transporter related  63.89 
 
 		 256 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0549  ABC transporter related  60.87 
 
 		 265 aa  310  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2987  ABC transporter related  61.35 
 
 		 277 aa  304  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  60.96 
 
 		 277 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0300535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43540  ABC transporter, ATP binding component  60.47 
 
 		 260 aa  303  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0288454  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2990  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 264 aa  299  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00578117  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0261  ABC transporter related  55.51 
 
 		 306 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0215  ABC transporter-related protein  54.76 
 
 		 313 aa  278  8e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0250  ABC transporter related  53.57 
 
 		 260 aa  276  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0375  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livG  49.6 
 
 		 273 aa  270  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5038  ABC transporter related  53.17 
 
 		 286 aa  269  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  51.19 
 
 		 269 aa  269  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4010  ABC transporter related  51.19 
 
 		 272 aa  264  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3364  ABC transporter related  51.57 
 
 		 274 aa  263  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0469  ABC transporter related  51.59 
 
 		 261 aa  262  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.304191 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3608  ABC transporter related  51.76 
 
 		 261 aa  261  6.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0460  ABC transporter related  51.59 
 
 		 261 aa  261  8e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  50 
 
 		 274 aa  261  8e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1158  ABC transporter related  51.76 
 
 		 261 aa  261  8e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0603  ABC transporter related  50.79 
 
 		 260 aa  260  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3435  ABC transporter-related protein  50.79 
 
 		 264 aa  261  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000808082 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5007  ABC transporter related  51.19 
 
 		 261 aa  259  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3541  ABC transporter related  50 
 
 		 260 aa  259  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5146  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  53.63 
 
 		 296 aa  258  9e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0114  ABC transporter related  50.79 
 
 		 272 aa  258  9e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.95101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0953  ABC transporter related  49.21 
 
 		 274 aa  257  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.513158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2724  ABC transporter related  51.59 
 
 		 277 aa  257  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.407856 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2278  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  49.21 
 
 		 279 aa  257  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0786  ABC transporter-related protein  50.79 
 
 		 263 aa  254  7e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3417  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.61 
 
 		 269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3137  ABC transporter-related protein  49.61 
 
 		 265 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1831  ABC transporter related  48.83 
 
 		 269 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2611  ABC transporter-related protein  49.61 
 
 		 265 aa  248  9e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  50.2 
 
 		 269 aa  247  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  49.01 
 
 		 270 aa  245  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2309  ABC transporter related  50.2 
 
 		 269 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0078002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  48.22 
 
 		 280 aa  242  3.9999999999999997e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4298  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.78 
 
 		 305 aa  241  9e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  hitchhiker  0.00350718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0296  ABC transporter related  49.8 
 
 		 269 aa  241  9e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  49.4 
 
 		 276 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  48.61 
 
 		 282 aa  238  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  47.04 
 
 		 269 aa  238  5e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  48.61 
 
 		 275 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000404  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  46.64 
 
 		 266 aa  237  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.428911  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  48.4 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  48.03 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3510  ABC transporter component  47.41 
 
 		 274 aa  234  8e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  46.43 
 
 		 277 aa  234  8e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0759  ABC transporter related protein  48.43 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  47.01 
 
 		 294 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  44.44 
 
 		 289 aa  232  5e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1598  ABC transporter related protein  47.83 
 
 		 260 aa  232  6e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3030  ABC transporter related protein  48.02 
 
 		 274 aa  231  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0569  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  51.57 
 
 		 255 aa  231  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.383942  normal  0.0445823 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2442  ABC transporter related protein  47.81 
 
 		 250 aa  229  4e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2360  ABC transporter related  45.31 
 
 		 278 aa  228  6e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.547386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5714  putative high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.21 
 
 		 273 aa  228  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  0.906173 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  47.04 
 
 		 276 aa  225  6e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3163  ABC transporter related protein  47.98 
 
 		 292 aa  224  8e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  48 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  49 
 
 		 273 aa  224  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2376  ABC transporter-like protein  45.88 
 
 		 251 aa  223  3e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1481  ABC transporter related  50.2 
 
 		 259 aa  221  7e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3842  ABC transporter related  45.02 
 
 		 289 aa  220  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000140209  normal  0.918006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5999  ABC transporter related protein  48.8 
 
 		 255 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.0205889 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  43.37 
 
 		 264 aa  219  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  45.28 
 
 		 271 aa  219  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1465  ABC transporter-like protein  46.4 
 
 		 291 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_809  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  42.16 
 
 		 276 aa  218  8.999999999999998e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3555  ABC transporter related  44.49 
 
 		 265 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.520716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  43.87 
 
 		 256 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5286  ABC transporter related  42.35 
 
 		 283 aa  217  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  44.58 
 
 		 271 aa  216  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2281  ABC transporter related  48.24 
 
 		 264 aa  217  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4240  ABC transporter related  41.83 
 
 		 266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  43.31 
 
 		 265 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  42.57 
 
 		 265 aa  214  7e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0822  ABC transporter related  41.38 
 
 		 276 aa  214  8e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7076  high-affinity branched-chain amino acid transport protein  44.31 
 
 		 265 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  46.06 
 
 		 612 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2014  ABC transporter related  43.75 
 
 		 263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  45.24 
 
 		 261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  43.08 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0938  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.04 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0956002  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1001  ABC transporter related  44.18 
 
 		 268 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  44.79 
 
 		 256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  45.42 
 
 		 293 aa  211  5.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  42.58 
 
 		 262 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  41.77 
 
 		 259 aa  211  7e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1085  ABC transporter related  46.54 
 
 		 277 aa  211  7e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0894019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  44.58 
 
 		 261 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.25 
 
 		 256 aa  211  9e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>