More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3608 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3608  ABC transporter related  100 
 
 		 261 aa  533  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0460  ABC transporter related  91.95 
 
 		 261 aa  493  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0469  ABC transporter related  91.95 
 
 		 261 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.304191 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1158  ABC transporter related  90.8 
 
 		 261 aa  491  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3541  ABC transporter related  87.98 
 
 		 260 aa  478  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0786  ABC transporter-related protein  89.53 
 
 		 263 aa  479  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3435  ABC transporter-related protein  89.15 
 
 		 264 aa  474  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000808082 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0603  ABC transporter related  87.6 
 
 		 260 aa  472  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5007  ABC transporter related  86.59 
 
 		 261 aa  470  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3364  ABC transporter related  79.07 
 
 		 274 aa  432  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0569  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  86.03 
 
 		 255 aa  412  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.383942  normal  0.0445823 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0215  ABC transporter-related protein  75.19 
 
 		 313 aa  407  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0261  ABC transporter related  76.08 
 
 		 306 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0250  ABC transporter related  75.97 
 
 		 260 aa  403  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2724  ABC transporter related  72.09 
 
 		 277 aa  388  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.407856 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  70.93 
 
 		 269 aa  385  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2278  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  68.73 
 
 		 279 aa  381  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0953  ABC transporter related  68.73 
 
 		 274 aa  380  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.513158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  69.26 
 
 		 274 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0375  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livG  68.99 
 
 		 273 aa  374  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4010  ABC transporter related  69.77 
 
 		 272 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0114  ABC transporter related  69.38 
 
 		 272 aa  355  5e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.95101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5038  ABC transporter related  65.46 
 
 		 286 aa  345  3e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0549  ABC transporter related  66.27 
 
 		 265 aa  344  8.999999999999999e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  61.75 
 
 		 269 aa  331  9e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  60.16 
 
 		 269 aa  325  4.0000000000000003e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  59.52 
 
 		 270 aa  323  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43540  ABC transporter, ATP binding component  60.94 
 
 		 260 aa  323  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0288454  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  62.8 
 
 		 277 aa  321  7e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0300535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2987  ABC transporter related  63.2 
 
 		 277 aa  321  7e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2990  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.75 
 
 		 264 aa  318  7e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00578117  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000404  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  62 
 
 		 266 aa  317  9e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.428911  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  58.96 
 
 		 280 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  57.92 
 
 		 296 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  58.3 
 
 		 282 aa  308  4e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_809  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  54.55 
 
 		 276 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  58.87 
 
 		 275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0822  ABC transporter related  54.79 
 
 		 276 aa  306  3e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5714  putative high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 		 273 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  0.906173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0296  ABC transporter related  58.63 
 
 		 269 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0938  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.41 
 
 		 270 aa  302  5.000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0956002  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3137  ABC transporter-related protein  59.13 
 
 		 265 aa  300  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2611  ABC transporter-related protein  59.13 
 
 		 265 aa  300  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3417  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.8 
 
 		 269 aa  299  3e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2309  ABC transporter related  58.63 
 
 		 269 aa  298  5e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0078002 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1598  ABC transporter related protein  60.24 
 
 		 260 aa  296  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  56.35 
 
 		 276 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1831  ABC transporter related  58.8 
 
 		 269 aa  293  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43780  ABC transporter, LivG family  57.81 
 
 		 262 aa  285  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.430374  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  53.78 
 
 		 277 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3510  ABC transporter component  54 
 
 		 274 aa  277  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  51.39 
 
 		 289 aa  276  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2748  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.12 
 
 		 266 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.916728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3842  ABC transporter related  53.94 
 
 		 289 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000140209  normal  0.918006 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0135  ABC transporter-like protein  55.38 
 
 		 255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3005  ABC transporter related  54.72 
 
 		 256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5146  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  52 
 
 		 296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3491  ABC transporter related  51.37 
 
 		 256 aa  273  3e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.411905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3799  ABC transporter related  51.37 
 
 		 256 aa  270  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.718599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  51 
 
 		 294 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2360  ABC transporter related  53.49 
 
 		 278 aa  269  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.547386 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6107  ABC transporter related  48.62 
 
 		 261 aa  268  5e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.319085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2281  ABC transporter related  53.82 
 
 		 264 aa  267  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1542  ABC transporter related protein  52.19 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000371483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2544  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.76 
 
 		 256 aa  261  6.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.234113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4298  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.81 
 
 		 305 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  hitchhiker  0.00350718 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7156  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  48.61 
 
 		 264 aa  260  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5286  ABC transporter related  50 
 
 		 283 aa  257  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3873  ABC transporter related  50.59 
 
 		 256 aa  249  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0725392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1425  ABC transporter related  43.9 
 
 		 253 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715565  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3008  ABC transporter-related protein  50.99 
 
 		 275 aa  248  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00336682  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3163  ABC transporter related protein  46.77 
 
 		 292 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  49.2 
 
 		 273 aa  246  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2376  ABC transporter-like protein  45.42 
 
 		 251 aa  246  3e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3030  ABC transporter related protein  46.4 
 
 		 274 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3832  ABC transporter related protein  48.19 
 
 		 285 aa  243  3e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1438  ABC transporter related  50.2 
 
 		 310 aa  241  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409389  hitchhiker  0.00000418659 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0759  ABC transporter related protein  45.6 
 
 		 268 aa  240  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2442  ABC transporter related protein  44.22 
 
 		 250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1465  ABC transporter-like protein  45.2 
 
 		 291 aa  234  9e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1001  ABC transporter related  46.61 
 
 		 268 aa  234  9e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4818  ABC transporter related  44.4 
 
 		 274 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4097  ABC transporter related  43.92 
 
 		 292 aa  231  7.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  42.91 
 
 		 612 aa  231  7.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  44.49 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  43.37 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  43.58 
 
 		 271 aa  229  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  44.62 
 
 		 258 aa  229  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5999  ABC transporter related protein  46.4 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.0205889 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4938  ABC transporter related  40.61 
 
 		 275 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.584937  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  42.4 
 
 		 259 aa  226  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  42.35 
 
 		 265 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  43.7 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3555  ABC transporter related  43.2 
 
 		 265 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.520716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  42.13 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  43.37 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3501  ABC transporter related  40.94 
 
 		 282 aa  223  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.111605  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3256  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.84 
 
 		 255 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.84 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4240  ABC transporter related  42.8 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>