More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5714 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5714  putative high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 273 aa  555  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  0.906173 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  87.68 
 
 		 276 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  86.89 
 
 		 282 aa  474  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  86.09 
 
 		 296 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  87.69 
 
 		 275 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0296  ABC transporter related  84.05 
 
 		 269 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2309  ABC transporter related  83.27 
 
 		 269 aa  434  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0078002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  80.95 
 
 		 280 aa  429  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1831  ABC transporter related  74.31 
 
 		 269 aa  394  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3510  ABC transporter component  73.91 
 
 		 274 aa  392  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2611  ABC transporter-related protein  73.83 
 
 		 265 aa  387  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3137  ABC transporter-related protein  74.61 
 
 		 265 aa  388  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3417  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  73.91 
 
 		 269 aa  386  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000404  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  71.71 
 
 		 266 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.428911  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  60.56 
 
 		 269 aa  315  7e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0261  ABC transporter related  59.84 
 
 		 306 aa  314  9e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2724  ABC transporter related  58.57 
 
 		 277 aa  312  2.9999999999999996e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.407856 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1598  ABC transporter related protein  62.5 
 
 		 260 aa  311  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0786  ABC transporter-related protein  60.32 
 
 		 263 aa  309  4e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0469  ABC transporter related  59.92 
 
 		 261 aa  309  4e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.304191 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3364  ABC transporter related  58.33 
 
 		 274 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0215  ABC transporter-related protein  58.33 
 
 		 313 aa  308  9e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  57.77 
 
 		 269 aa  307  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0460  ABC transporter related  59.52 
 
 		 261 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  57.14 
 
 		 269 aa  306  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  58.63 
 
 		 274 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3608  ABC transporter related  58.33 
 
 		 261 aa  305  4.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0250  ABC transporter related  58.33 
 
 		 260 aa  305  5.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1158  ABC transporter related  58.73 
 
 		 261 aa  305  6e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5007  ABC transporter related  58.66 
 
 		 261 aa  304  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  58.96 
 
 		 270 aa  303  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0953  ABC transporter related  58.23 
 
 		 274 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.513158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2278  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  58.23 
 
 		 279 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0603  ABC transporter related  57.48 
 
 		 260 aa  302  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3435  ABC transporter-related protein  58.33 
 
 		 264 aa  302  3.0000000000000004e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000808082 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0375  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livG  58.23 
 
 		 273 aa  302  4.0000000000000003e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3541  ABC transporter related  58.33 
 
 		 260 aa  300  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5038  ABC transporter related  59.04 
 
 		 286 aa  300  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4010  ABC transporter related  57.03 
 
 		 272 aa  298  7e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  56.92 
 
 		 289 aa  296  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  57.71 
 
 		 294 aa  292  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  57.2 
 
 		 277 aa  290  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_809  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  52.24 
 
 		 276 aa  285  8e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0822  ABC transporter related  52.31 
 
 		 276 aa  280  2e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0938  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.94 
 
 		 270 aa  276  3e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0956002  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0569  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  57.39 
 
 		 255 aa  271  7e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.383942  normal  0.0445823 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2360  ABC transporter related  55.56 
 
 		 278 aa  271  8.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.547386 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2281  ABC transporter related  56.3 
 
 		 264 aa  270  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0114  ABC transporter related  55.2 
 
 		 272 aa  270  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.95101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3842  ABC transporter related  54 
 
 		 289 aa  267  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000140209  normal  0.918006 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5286  ABC transporter related  52.38 
 
 		 283 aa  265  7e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0549  ABC transporter related  54.22 
 
 		 265 aa  265  8e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2987  ABC transporter related  53.82 
 
 		 277 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.41 
 
 		 277 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0300535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43540  ABC transporter, ATP binding component  53.41 
 
 		 260 aa  257  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0288454  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0135  ABC transporter-like protein  55.42 
 
 		 255 aa  256  3e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3008  ABC transporter-related protein  51 
 
 		 275 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00336682  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1542  ABC transporter related protein  52.19 
 
 		 255 aa  252  6e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000371483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3163  ABC transporter related protein  49.4 
 
 		 292 aa  248  7e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0759  ABC transporter related protein  50.6 
 
 		 268 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3005  ABC transporter related  51.78 
 
 		 256 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2748  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.78 
 
 		 266 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.916728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5146  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  51.6 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2376  ABC transporter-like protein  48.59 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  49.43 
 
 		 273 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4097  ABC transporter related  48.64 
 
 		 292 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3501  ABC transporter related  49.22 
 
 		 282 aa  243  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.111605  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3832  ABC transporter related protein  49.07 
 
 		 285 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2442  ABC transporter related protein  47.43 
 
 		 250 aa  241  9e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2990  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.82 
 
 		 264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00578117  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4938  ABC transporter related  46.95 
 
 		 275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.584937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3030  ABC transporter related protein  47.83 
 
 		 274 aa  237  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7076  high-affinity branched-chain amino acid transport protein  46.88 
 
 		 265 aa  236  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6107  ABC transporter related  46.83 
 
 		 261 aa  235  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.319085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43780  ABC transporter, LivG family  51.41 
 
 		 262 aa  234  8e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.430374  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  49 
 
 		 255 aa  234  9e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1465  ABC transporter-like protein  48.77 
 
 		 291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4240  ABC transporter related  45.88 
 
 		 266 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3626  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.82 
 
 		 257 aa  229  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  48 
 
 		 264 aa  229  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2544  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.21 
 
 		 256 aa  228  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.234113 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4429  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.61 
 
 		 257 aa  228  7e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108866 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0654  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.22 
 
 		 257 aa  227  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  44.36 
 
 		 284 aa  228  1e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  44.71 
 
 		 265 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  47.6 
 
 		 265 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  48.8 
 
 		 276 aa  227  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0865  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.42 
 
 		 257 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154557  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4944  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.22 
 
 		 257 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.956348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0775  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.42 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2141  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.42 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0558111  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5271  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.82 
 
 		 257 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.878512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  45.02 
 
 		 268 aa  226  4e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3351  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.82 
 
 		 257 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5016  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.82 
 
 		 257 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.836649 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1425  ABC transporter related  46.53 
 
 		 253 aa  225  7e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715565  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1836  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.62 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3256  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.27 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  46.4 
 
 		 271 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  42.31 
 
 		 262 aa  223  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>