More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4097 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4097  ABC transporter related  100 
 
 		 292 aa  594  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3501  ABC transporter related  77.49 
 
 		 282 aa  426  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.111605  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4938  ABC transporter related  74.52 
 
 		 275 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.584937  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1425  ABC transporter related  61.02 
 
 		 253 aa  315  8e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715565  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  50.37 
 
 		 274 aa  272  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0953  ABC transporter related  50 
 
 		 274 aa  267  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.513158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2278  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  49.24 
 
 		 279 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3008  ABC transporter-related protein  49.62 
 
 		 275 aa  261  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00336682  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0296  ABC transporter related  49.44 
 
 		 269 aa  259  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  48.25 
 
 		 269 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2309  ABC transporter related  48.31 
 
 		 269 aa  255  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0078002 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  49.61 
 
 		 282 aa  254  8e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  49.61 
 
 		 275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  47.45 
 
 		 280 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  50 
 
 		 296 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0375  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livG  46.9 
 
 		 273 aa  252  5.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000404  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  48.44 
 
 		 266 aa  252  5.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.428911  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  48.66 
 
 		 277 aa  250  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  49.81 
 
 		 276 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  49.8 
 
 		 270 aa  247  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0215  ABC transporter-related protein  49.22 
 
 		 313 aa  247  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4010  ABC transporter related  47.45 
 
 		 272 aa  247  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  47.37 
 
 		 269 aa  246  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2360  ABC transporter related  49.82 
 
 		 278 aa  246  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.547386 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3364  ABC transporter related  45.86 
 
 		 274 aa  246  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1598  ABC transporter related protein  50.39 
 
 		 260 aa  244  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0250  ABC transporter related  46.67 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2724  ABC transporter related  48.05 
 
 		 277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.407856 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5714  putative high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.64 
 
 		 273 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  0.906173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  47.24 
 
 		 269 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5038  ABC transporter related  46.36 
 
 		 286 aa  242  3.9999999999999997e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0261  ABC transporter related  47.08 
 
 		 306 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  48.03 
 
 		 294 aa  239  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  46.59 
 
 		 289 aa  239  5e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0786  ABC transporter-related protein  46.82 
 
 		 263 aa  239  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1831  ABC transporter related  45.42 
 
 		 269 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0114  ABC transporter related  46.88 
 
 		 272 aa  238  9e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.95101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3137  ABC transporter-related protein  47.45 
 
 		 265 aa  238  9e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0356  ABC transporter related  47.86 
 
 		 290 aa  238  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  44.14 
 
 		 268 aa  237  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  47.47 
 
 		 265 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1001  ABC transporter related  47.97 
 
 		 268 aa  235  7e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3541  ABC transporter related  45.88 
 
 		 260 aa  235  7e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  43.24 
 
 		 264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2611  ABC transporter-related protein  46.12 
 
 		 265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3555  ABC transporter related  47.86 
 
 		 265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.520716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0469  ABC transporter related  46.27 
 
 		 261 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.304191 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  43.8 
 
 		 270 aa  233  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1158  ABC transporter related  44.71 
 
 		 261 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3842  ABC transporter related  48.84 
 
 		 289 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000140209  normal  0.918006 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  40.47 
 
 		 256 aa  232  5e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2990  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.47 
 
 		 264 aa  232  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00578117  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3608  ABC transporter related  43.92 
 
 		 261 aa  231  8.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  42.86 
 
 		 265 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4240  ABC transporter related  47.08 
 
 		 266 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1542  ABC transporter related protein  49.01 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000371483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0460  ABC transporter related  45.88 
 
 		 261 aa  231  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3417  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.96 
 
 		 269 aa  229  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5007  ABC transporter related  46.27 
 
 		 261 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0603  ABC transporter related  44.31 
 
 		 260 aa  229  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  42.52 
 
 		 262 aa  230  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3435  ABC transporter-related protein  45.88 
 
 		 264 aa  229  5e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000808082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7076  high-affinity branched-chain amino acid transport protein  46.3 
 
 		 265 aa  229  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  45.31 
 
 		 271 aa  227  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0549  ABC transporter related  45.32 
 
 		 265 aa  227  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  46.07 
 
 		 271 aa  226  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  44.92 
 
 		 254 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0759  ABC transporter related protein  46.07 
 
 		 268 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  42.86 
 
 		 256 aa  225  6e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  43.08 
 
 		 261 aa  224  9e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1465  ABC transporter-like protein  46.95 
 
 		 291 aa  224  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  41.25 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3510  ABC transporter component  43.01 
 
 		 274 aa  223  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3256  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.04 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.04 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  41.73 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2737  ABC transporter related  43.02 
 
 		 268 aa  223  3e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.15 
 
 		 256 aa  222  4e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2987  ABC transporter related  44.94 
 
 		 277 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3832  ABC transporter related protein  45.14 
 
 		 285 aa  222  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43540  ABC transporter, ATP binding component  47.24 
 
 		 260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0288454  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.57 
 
 		 277 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0300535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0135  ABC transporter-like protein  48.62 
 
 		 255 aa  222  6e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0890  ABC transporter related  46.06 
 
 		 262 aa  222  6e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  43.43 
 
 		 270 aa  222  7e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  43.43 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  46.27 
 
 		 273 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5286  ABC transporter related  44.53 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  43.07 
 
 		 270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  44.06 
 
 		 270 aa  219  5e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  42.75 
 
 		 255 aa  218  7e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1836  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.28 
 
 		 257 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  42.69 
 
 		 262 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2281  ABC transporter related  47.71 
 
 		 264 aa  218  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0732  ABC transporter related  46.51 
 
 		 256 aa  218  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0775  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.28 
 
 		 257 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2141  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.28 
 
 		 257 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0558111  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3163  ABC transporter related protein  44.27 
 
 		 292 aa  217  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1034  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41 
 
 		 256 aa  217  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.634603  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3030  ABC transporter related protein  45.28 
 
 		 274 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>