More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1425 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1425  ABC transporter related  100 
 
 		 253 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715565  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3501  ABC transporter related  61.85 
 
 		 282 aa  315  3e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.111605  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4097  ABC transporter related  61.02 
 
 		 292 aa  315  6e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4938  ABC transporter related  60.48 
 
 		 275 aa  298  5e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.584937  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3008  ABC transporter-related protein  50.99 
 
 		 275 aa  260  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00336682  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0375  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livG  48.56 
 
 		 273 aa  258  6e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0603  ABC transporter related  45.12 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  47.33 
 
 		 269 aa  251  6e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4010  ABC transporter related  47.33 
 
 		 272 aa  250  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0953  ABC transporter related  45.42 
 
 		 274 aa  249  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.513158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  46.91 
 
 		 274 aa  249  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0215  ABC transporter-related protein  45.78 
 
 		 313 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3364  ABC transporter related  45.6 
 
 		 274 aa  249  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2278  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.42 
 
 		 279 aa  249  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3608  ABC transporter related  43.9 
 
 		 261 aa  249  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1158  ABC transporter related  44.31 
 
 		 261 aa  248  6e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0469  ABC transporter related  44.72 
 
 		 261 aa  248  8e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.304191 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0460  ABC transporter related  44.72 
 
 		 261 aa  248  9e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3435  ABC transporter-related protein  44.31 
 
 		 264 aa  246  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000808082 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0261  ABC transporter related  45.38 
 
 		 306 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3541  ABC transporter related  44.31 
 
 		 260 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000404  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  46.25 
 
 		 266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.428911  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5038  ABC transporter related  44.62 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0296  ABC transporter related  46.46 
 
 		 269 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4818  ABC transporter related  46.4 
 
 		 274 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2724  ABC transporter related  44.4 
 
 		 277 aa  240  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.407856 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  46.77 
 
 		 269 aa  240  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  46.37 
 
 		 269 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  45.06 
 
 		 289 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0786  ABC transporter-related protein  43.2 
 
 		 263 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5007  ABC transporter related  43.9 
 
 		 261 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0250  ABC transporter related  43.85 
 
 		 260 aa  238  5e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2309  ABC transporter related  46.64 
 
 		 269 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0078002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  45.63 
 
 		 280 aa  237  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3137  ABC transporter-related protein  47.22 
 
 		 265 aa  237  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  46.25 
 
 		 277 aa  237  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1465  ABC transporter-like protein  48.78 
 
 		 291 aa  236  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3417  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.63 
 
 		 269 aa  236  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  46.64 
 
 		 294 aa  235  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1831  ABC transporter related  45.24 
 
 		 269 aa  234  8e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  44.22 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3555  ABC transporter related  46.03 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.520716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3163  ABC transporter related protein  46.77 
 
 		 292 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  45.24 
 
 		 275 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  45.67 
 
 		 276 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0759  ABC transporter related protein  47.39 
 
 		 268 aa  231  9e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0114  ABC transporter related  44.76 
 
 		 272 aa  230  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.95101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  45.24 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  43.87 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0549  ABC transporter related  44.58 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2987  ABC transporter related  43.7 
 
 		 277 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.78 
 
 		 277 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0300535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2611  ABC transporter-related protein  45.63 
 
 		 265 aa  228  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  44.44 
 
 		 261 aa  228  9e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  45.16 
 
 		 282 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  45.16 
 
 		 296 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43540  ABC transporter, ATP binding component  44.62 
 
 		 260 aa  226  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0288454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3030  ABC transporter related protein  46.18 
 
 		 274 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4552  ABC transporter related  45.2 
 
 		 260 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3832  ABC transporter related protein  45.56 
 
 		 285 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5714  putative high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.53 
 
 		 273 aa  225  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  0.906173 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0569  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  44.93 
 
 		 255 aa  224  7e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.383942  normal  0.0445823 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  43.82 
 
 		 259 aa  224  8e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2990  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.78 
 
 		 264 aa  224  9e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00578117  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  42.63 
 
 		 261 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  43.78 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3819  ABC transporter related  45.78 
 
 		 262 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0171499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1598  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4240  ABC transporter related  44 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2014  ABC transporter related  43.43 
 
 		 263 aa  222  6e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  43.6 
 
 		 254 aa  221  6e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  45.2 
 
 		 273 aa  221  6e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  40.89 
 
 		 256 aa  221  8e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 		 254 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7076  high-affinity branched-chain amino acid transport protein  45.6 
 
 		 265 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  42.97 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1001  ABC transporter related  45.6 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  43.78 
 
 		 265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2360  ABC transporter related  45.45 
 
 		 278 aa  218  5e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.547386 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6107  ABC transporter related  40.64 
 
 		 261 aa  218  7e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.319085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0135  ABC transporter-like protein  45.56 
 
 		 255 aa  218  8.999999999999998e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  44.27 
 
 		 258 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0365  ABC transporter related  43.87 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000174953  unclonable  0.0000000581692 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  42.8 
 
 		 252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3842  ABC transporter related  43.7 
 
 		 289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000140209  normal  0.918006 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  42.97 
 
 		 252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  41.57 
 
 		 284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3256  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.64 
 
 		 255 aa  216  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.64 
 
 		 255 aa  216  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  41.13 
 
 		 259 aa  215  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  42.57 
 
 		 270 aa  215  5e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2281  ABC transporter related  46.61 
 
 		 264 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  43.82 
 
 		 271 aa  214  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  44.17 
 
 		 250 aa  214  9e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0890  ABC transporter related  44.4 
 
 		 262 aa  214  9e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.22 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_809  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  39.92 
 
 		 276 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0677  ABC transporter related  42.8 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.888321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  40.56 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>