More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2281 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2281  ABC transporter related  100 
 
 		 264 aa  541  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  56.25 
 
 		 289 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3510  ABC transporter component  56.49 
 
 		 274 aa  300  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  58.43 
 
 		 294 aa  300  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  56.23 
 
 		 269 aa  300  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  56.59 
 
 		 270 aa  300  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1598  ABC transporter related protein  60.32 
 
 		 260 aa  300  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2309  ABC transporter related  57.54 
 
 		 269 aa  297  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0078002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  54.47 
 
 		 280 aa  295  4e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  54.3 
 
 		 269 aa  295  5e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0296  ABC transporter related  58.33 
 
 		 269 aa  295  7e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  56.13 
 
 		 277 aa  292  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  57.14 
 
 		 276 aa  292  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3541  ABC transporter related  53.41 
 
 		 260 aa  291  6e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2360  ABC transporter related  56.98 
 
 		 278 aa  288  6e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.547386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5714  putative high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.3 
 
 		 273 aa  288  7e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  0.906173 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0603  ABC transporter related  53.82 
 
 		 260 aa  288  8e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2724  ABC transporter related  54.62 
 
 		 277 aa  288  9e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.407856 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  56.18 
 
 		 282 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  56.18 
 
 		 296 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3608  ABC transporter related  53.82 
 
 		 261 aa  287  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  55.78 
 
 		 275 aa  285  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2611  ABC transporter-related protein  55.64 
 
 		 265 aa  285  5e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3417  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55 
 
 		 269 aa  285  5.999999999999999e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000404  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  53.88 
 
 		 266 aa  284  9e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.428911  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0786  ABC transporter-related protein  54.22 
 
 		 263 aa  283  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1158  ABC transporter related  53.01 
 
 		 261 aa  283  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3842  ABC transporter related  58.8 
 
 		 289 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000140209  normal  0.918006 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5007  ABC transporter related  53.41 
 
 		 261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1831  ABC transporter related  55.6 
 
 		 269 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0215  ABC transporter-related protein  53.82 
 
 		 313 aa  282  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0469  ABC transporter related  52.61 
 
 		 261 aa  281  6.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.304191 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5038  ABC transporter related  54.26 
 
 		 286 aa  281  7.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0261  ABC transporter related  53.15 
 
 		 306 aa  280  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0460  ABC transporter related  52.61 
 
 		 261 aa  280  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3435  ABC transporter-related protein  51.41 
 
 		 264 aa  280  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000808082 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3137  ABC transporter-related protein  54.15 
 
 		 265 aa  280  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  52.61 
 
 		 274 aa  278  7e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43540  ABC transporter, ATP binding component  53.97 
 
 		 260 aa  278  8e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0288454  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0953  ABC transporter related  53.01 
 
 		 274 aa  278  9e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.513158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2987  ABC transporter related  51.94 
 
 		 277 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0250  ABC transporter related  52.21 
 
 		 260 aa  277  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2278  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  53.01 
 
 		 279 aa  277  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  53.01 
 
 		 269 aa  277  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.55 
 
 		 277 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0300535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0375  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livG  52.76 
 
 		 273 aa  276  3e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0549  ABC transporter related  52.4 
 
 		 265 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3364  ABC transporter related  51.81 
 
 		 274 aa  274  8e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4010  ABC transporter related  52.21 
 
 		 272 aa  274  9e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2990  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.01 
 
 		 264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00578117  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1542  ABC transporter related protein  56.35 
 
 		 255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000371483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0135  ABC transporter-like protein  56.13 
 
 		 255 aa  268  5e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_809  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  49.82 
 
 		 276 aa  268  8e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0569  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  54.11 
 
 		 255 aa  264  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.383942  normal  0.0445823 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0822  ABC transporter related  48.71 
 
 		 276 aa  264  1e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5146  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  52.36 
 
 		 296 aa  260  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3163  ABC transporter related protein  52 
 
 		 292 aa  260  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0938  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.52 
 
 		 270 aa  259  4e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0956002  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0114  ABC transporter related  51.81 
 
 		 272 aa  259  4e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.95101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0759  ABC transporter related protein  53.63 
 
 		 268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3555  ABC transporter related  48.24 
 
 		 265 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.520716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  48.24 
 
 		 265 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3030  ABC transporter related protein  49.8 
 
 		 274 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  44.44 
 
 		 256 aa  244  8e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2376  ABC transporter-like protein  49.6 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1465  ABC transporter-like protein  50.8 
 
 		 291 aa  243  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  46.67 
 
 		 265 aa  242  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2442  ABC transporter related protein  49 
 
 		 250 aa  243  3e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3799  ABC transporter related  49.61 
 
 		 256 aa  242  5e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.718599 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  44.62 
 
 		 261 aa  242  6e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7076  high-affinity branched-chain amino acid transport protein  47.06 
 
 		 265 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5286  ABC transporter related  44.57 
 
 		 283 aa  240  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3491  ABC transporter related  48.82 
 
 		 256 aa  238  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.411905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  45.88 
 
 		 264 aa  238  6.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4240  ABC transporter related  46.25 
 
 		 266 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4097  ABC transporter related  47.71 
 
 		 292 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4298  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.6 
 
 		 305 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  hitchhiker  0.00350718 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  46.61 
 
 		 250 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  46.67 
 
 		 612 aa  235  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  46.43 
 
 		 270 aa  235  6e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3873  ABC transporter related  49.61 
 
 		 256 aa  235  7e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0725392 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43780  ABC transporter, LivG family  49.61 
 
 		 262 aa  234  9e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.430374  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2544  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.24 
 
 		 256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.234113 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3832  ABC transporter related protein  48.22 
 
 		 285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  44.14 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.6 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1425  ABC transporter related  46.61 
 
 		 253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715565  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3501  ABC transporter related  47.27 
 
 		 282 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.111605  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4938  ABC transporter related  45.42 
 
 		 275 aa  232  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.584937  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2748  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.59 
 
 		 266 aa  231  6e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.916728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3005  ABC transporter related  50.6 
 
 		 256 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7156  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  46.48 
 
 		 264 aa  231  7.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6107  ABC transporter related  46.09 
 
 		 261 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.319085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  43.97 
 
 		 261 aa  231  9e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0356  ABC transporter related  46.06 
 
 		 290 aa  230  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  46.03 
 
 		 258 aa  229  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  45.14 
 
 		 255 aa  228  8e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3008  ABC transporter-related protein  47.08 
 
 		 275 aa  226  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00336682  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1438  ABC transporter related  48.43 
 
 		 310 aa  226  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409389  hitchhiker  0.00000418659 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  45.7 
 
 		 261 aa  226  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>