More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2990 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2990  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 264 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00578117  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0549  ABC transporter related  81.54 
 
 		 265 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  79.3 
 
 		 277 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0300535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2987  ABC transporter related  79.69 
 
 		 277 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43540  ABC transporter, ATP binding component  75.7 
 
 		 260 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0288454  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0261  ABC transporter related  66 
 
 		 306 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3435  ABC transporter-related protein  62.8 
 
 		 264 aa  329  3e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000808082 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3005  ABC transporter related  66.93 
 
 		 256 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0603  ABC transporter related  62.95 
 
 		 260 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43780  ABC transporter, LivG family  66.27 
 
 		 262 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.430374  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2748  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  66.53 
 
 		 266 aa  324  9e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.916728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3541  ABC transporter related  62.55 
 
 		 260 aa  323  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0215  ABC transporter-related protein  65.2 
 
 		 313 aa  323  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0250  ABC transporter related  63.35 
 
 		 260 aa  320  9.999999999999999e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0786  ABC transporter-related protein  63.86 
 
 		 263 aa  319  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3364  ABC transporter related  62.15 
 
 		 274 aa  318  5e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3608  ABC transporter related  61.75 
 
 		 261 aa  318  7e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5007  ABC transporter related  63.35 
 
 		 261 aa  318  7.999999999999999e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0469  ABC transporter related  62.55 
 
 		 261 aa  315  4e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.304191 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0460  ABC transporter related  62.55 
 
 		 261 aa  315  6e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2724  ABC transporter related  62 
 
 		 277 aa  312  3.9999999999999997e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.407856 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0375  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livG  61.04 
 
 		 273 aa  311  5.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4010  ABC transporter related  62.3 
 
 		 272 aa  311  6.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1158  ABC transporter related  60.56 
 
 		 261 aa  310  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  61.9 
 
 		 269 aa  310  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2278  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  60.56 
 
 		 279 aa  309  4e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0953  ABC transporter related  60.56 
 
 		 274 aa  309  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.513158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  60.56 
 
 		 274 aa  308  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5038  ABC transporter related  61.04 
 
 		 286 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0569  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  65.35 
 
 		 255 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.383942  normal  0.0445823 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3799  ABC transporter related  59.06 
 
 		 256 aa  300  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.718599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2544  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 256 aa  299  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.234113 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6107  ABC transporter related  57.6 
 
 		 261 aa  295  6e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.319085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3491  ABC transporter related  57.87 
 
 		 256 aa  294  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.411905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0114  ABC transporter related  60 
 
 		 272 aa  291  8e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.95101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3873  ABC transporter related  59.45 
 
 		 256 aa  289  3e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0725392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  56.32 
 
 		 269 aa  284  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5146  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  56.63 
 
 		 296 aa  282  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7156  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  54.47 
 
 		 264 aa  280  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  54.05 
 
 		 269 aa  279  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  53.64 
 
 		 270 aa  272  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  49.62 
 
 		 289 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  50.58 
 
 		 277 aa  265  7e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1598  ABC transporter related protein  57.43 
 
 		 260 aa  263  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  51.33 
 
 		 294 aa  262  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3842  ABC transporter related  51.54 
 
 		 289 aa  261  8.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000140209  normal  0.918006 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000404  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  51.76 
 
 		 266 aa  260  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.428911  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0822  ABC transporter related  48.72 
 
 		 276 aa  259  2e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3417  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.85 
 
 		 269 aa  259  4e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_809  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  48.15 
 
 		 276 aa  258  7e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1831  ABC transporter related  51.39 
 
 		 269 aa  258  7e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  51.79 
 
 		 280 aa  258  8e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2360  ABC transporter related  51.55 
 
 		 278 aa  257  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.547386 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2611  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 265 aa  257  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3832  ABC transporter related protein  51.95 
 
 		 285 aa  255  5e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3137  ABC transporter-related protein  48.85 
 
 		 265 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  50.81 
 
 		 275 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  50.81 
 
 		 282 aa  251  6e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2281  ABC transporter related  53.01 
 
 		 264 aa  251  7e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0938  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.92 
 
 		 270 aa  250  2e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0956002  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2309  ABC transporter related  49.24 
 
 		 269 aa  250  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  50.81 
 
 		 296 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  49.81 
 
 		 276 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0296  ABC transporter related  51 
 
 		 269 aa  246  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0759  ABC transporter related protein  49.21 
 
 		 268 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0135  ABC transporter-like protein  51.41 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3510  ABC transporter component  50 
 
 		 274 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3163  ABC transporter related protein  48.79 
 
 		 292 aa  240  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5714  putative high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.82 
 
 		 273 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  0.906173 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2376  ABC transporter-like protein  48.59 
 
 		 251 aa  237  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4298  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.61 
 
 		 305 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  hitchhiker  0.00350718 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1001  ABC transporter related  48.4 
 
 		 268 aa  237  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1438  ABC transporter related  52.8 
 
 		 310 aa  235  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409389  hitchhiker  0.00000418659 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1465  ABC transporter-like protein  47.18 
 
 		 291 aa  233  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4097  ABC transporter related  46.47 
 
 		 292 aa  232  5e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3030  ABC transporter related protein  48.44 
 
 		 274 aa  232  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1542  ABC transporter related protein  48.03 
 
 		 255 aa  231  9e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000371483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.18 
 
 		 254 aa  228  6e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2442  ABC transporter related protein  46.59 
 
 		 250 aa  228  9e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  46.06 
 
 		 259 aa  227  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  45.28 
 
 		 271 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  45.56 
 
 		 270 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  46.25 
 
 		 265 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  44.18 
 
 		 255 aa  227  2e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  42 
 
 		 254 aa  227  2e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  48.64 
 
 		 256 aa  227  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  46.99 
 
 		 256 aa  226  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  45.56 
 
 		 270 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  45.42 
 
 		 294 aa  226  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  44.4 
 
 		 264 aa  224  8e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0365  ABC transporter related  44.4 
 
 		 253 aa  224  9e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000174953  unclonable  0.0000000581692 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2168  ABC transporter related  45.67 
 
 		 274 aa  224  9e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1425  ABC transporter related  43.78 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715565  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  44.4 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  45.38 
 
 		 283 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  46.18 
 
 		 280 aa  223  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 		 256 aa  223  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  47.39 
 
 		 273 aa  223  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  46 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1085  ABC transporter related  44.53 
 
 		 277 aa  223  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0894019  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>