More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1542 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1542  ABC transporter related protein  100 
 
 		 255 aa  517  1e-146  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000371483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0135  ABC transporter-like protein  83.4 
 
 		 255 aa  421  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  58.89 
 
 		 269 aa  318  5e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  57.71 
 
 		 269 aa  315  6e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  56.75 
 
 		 270 aa  303  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1598  ABC transporter related protein  61.69 
 
 		 260 aa  298  5e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0215  ABC transporter-related protein  54.98 
 
 		 313 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0603  ABC transporter related  54.58 
 
 		 260 aa  293  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0261  ABC transporter related  54.98 
 
 		 306 aa  291  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  54.58 
 
 		 274 aa  291  7e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0822  ABC transporter related  52.47 
 
 		 276 aa  290  2e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5038  ABC transporter related  54.84 
 
 		 286 aa  288  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0375  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livG  54.18 
 
 		 273 aa  289  4e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2278  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  53.78 
 
 		 279 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0953  ABC transporter related  53.78 
 
 		 274 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.513158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  53.78 
 
 		 269 aa  288  5.0000000000000004e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  56.18 
 
 		 280 aa  288  8e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5007  ABC transporter related  54.18 
 
 		 261 aa  287  9e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000404  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  54.98 
 
 		 266 aa  287  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.428911  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4010  ABC transporter related  53.78 
 
 		 272 aa  286  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2724  ABC transporter related  54.58 
 
 		 277 aa  285  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.407856 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1158  ABC transporter related  52.59 
 
 		 261 aa  285  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_809  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  51.91 
 
 		 276 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0786  ABC transporter-related protein  53.39 
 
 		 263 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0938  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.52 
 
 		 270 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0956002  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0296  ABC transporter related  54.18 
 
 		 269 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3541  ABC transporter related  51.39 
 
 		 260 aa  280  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3364  ABC transporter related  51.79 
 
 		 274 aa  280  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2309  ABC transporter related  53.78 
 
 		 269 aa  280  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0078002 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3608  ABC transporter related  52.19 
 
 		 261 aa  280  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0460  ABC transporter related  52.19 
 
 		 261 aa  279  4e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0469  ABC transporter related  52.19 
 
 		 261 aa  278  6e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.304191 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  53.6 
 
 		 275 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0250  ABC transporter related  51.79 
 
 		 260 aa  277  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  53.6 
 
 		 282 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  53.2 
 
 		 296 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3137  ABC transporter-related protein  51.79 
 
 		 265 aa  275  5e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3435  ABC transporter-related protein  51.79 
 
 		 264 aa  275  6e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000808082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  53.41 
 
 		 294 aa  275  7e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0114  ABC transporter related  54.98 
 
 		 272 aa  274  8e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.95101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  54.22 
 
 		 277 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2281  ABC transporter related  56.35 
 
 		 264 aa  272  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3417  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.73 
 
 		 269 aa  271  6e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1831  ABC transporter related  51.56 
 
 		 269 aa  271  6e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2360  ABC transporter related  54.62 
 
 		 278 aa  270  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.547386 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  52.19 
 
 		 276 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2611  ABC transporter-related protein  51.39 
 
 		 265 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3510  ABC transporter component  52.61 
 
 		 274 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3842  ABC transporter related  54.22 
 
 		 289 aa  267  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000140209  normal  0.918006 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5714  putative high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.19 
 
 		 273 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  0.906173 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0549  ABC transporter related  50.6 
 
 		 265 aa  260  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  50.6 
 
 		 289 aa  259  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0569  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  52.63 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.383942  normal  0.0445823 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2990  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.03 
 
 		 264 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00578117  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5286  ABC transporter related  48.56 
 
 		 283 aa  246  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.02 
 
 		 277 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0300535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2987  ABC transporter related  48.41 
 
 		 277 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4097  ABC transporter related  49.01 
 
 		 292 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  46.77 
 
 		 256 aa  245  4e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3008  ABC transporter-related protein  48.82 
 
 		 275 aa  244  9e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00336682  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2442  ABC transporter related protein  50.4 
 
 		 250 aa  243  3e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43540  ABC transporter, ATP binding component  47.41 
 
 		 260 aa  241  6e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0288454  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2376  ABC transporter-like protein  50.79 
 
 		 251 aa  241  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3501  ABC transporter related  47.62 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.111605  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5146  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  46.99 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4938  ABC transporter related  44.66 
 
 		 275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.584937  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  44.83 
 
 		 261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  46.88 
 
 		 264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  43.58 
 
 		 261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  45.59 
 
 		 262 aa  233  3e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  46.88 
 
 		 265 aa  232  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  43.49 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  45.2 
 
 		 259 aa  228  6e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  45.63 
 
 		 258 aa  227  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  43.12 
 
 		 284 aa  228  1e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  43.38 
 
 		 288 aa  226  2e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  43.08 
 
 		 255 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3799  ABC transporter related  47.08 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.718599 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1425  ABC transporter related  43.9 
 
 		 253 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715565  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  44.66 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  47.01 
 
 		 273 aa  225  7e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0759  ABC transporter related protein  47.2 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1001  ABC transporter related  45.97 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2737  ABC transporter related  43.25 
 
 		 268 aa  223  3e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  44.27 
 
 		 256 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  44.76 
 
 		 255 aa  222  4e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  45.24 
 
 		 268 aa  222  4e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3491  ABC transporter related  46.3 
 
 		 256 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.411905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  43.55 
 
 		 270 aa  222  4.9999999999999996e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  44.62 
 
 		 271 aa  221  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.63 
 
 		 254 aa  221  7e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3102  ABC transporter related  44.27 
 
 		 258 aa  221  8e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4298  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 305 aa  221  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  hitchhiker  0.00350718 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  45.24 
 
 		 258 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3256  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.94 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.94 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  43.02 
 
 		 270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  44.44 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5999  ABC transporter related protein  45.85 
 
 		 255 aa  219  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.0205889 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43780  ABC transporter, LivG family  44.66 
 
 		 262 aa  219  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.430374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>