More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1598 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1598  ABC transporter related protein  100 
 
 
260 aa  522  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  68.55 
 
 
269 aa  362  2e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  69.11 
 
 
269 aa  362  3e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  68.67 
 
 
270 aa  362  4e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  65.6 
 
 
280 aa  353  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1831  ABC transporter related  62.84 
 
 
269 aa  342  4e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3510  ABC transporter component  65.2 
 
 
274 aa  342  5e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  63.18 
 
 
282 aa  338  4e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  63.18 
 
 
275 aa  338  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  62.79 
 
 
296 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0296  ABC transporter related  63.57 
 
 
269 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3417  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.39 
 
 
269 aa  335  5e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0215  ABC transporter-related protein  64.26 
 
 
313 aa  333  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3137  ABC transporter-related protein  62.6 
 
 
265 aa  333  2e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000404  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  61.33 
 
 
266 aa  332  5e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.428911  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0261  ABC transporter related  64.26 
 
 
306 aa  331  7.000000000000001e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2309  ABC transporter related  64.06 
 
 
269 aa  330  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0078002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5714  putative high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 
273 aa  329  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  0.906173 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  62.11 
 
 
276 aa  329  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2611  ABC transporter-related protein  61.42 
 
 
265 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  62.55 
 
 
274 aa  326  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0953  ABC transporter related  62.55 
 
 
274 aa  324  8.000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.513158  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2278  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  62.55 
 
 
279 aa  323  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0375  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livG  62.25 
 
 
273 aa  324  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529081  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5038  ABC transporter related  63.45 
 
 
286 aa  322  4e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1158  ABC transporter related  61.04 
 
 
261 aa  322  5e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3364  ABC transporter related  60.24 
 
 
274 aa  322  5e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0250  ABC transporter related  60.8 
 
 
260 aa  320  9.999999999999999e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0822  ABC transporter related  60.62 
 
 
276 aa  320  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0603  ABC transporter related  60.24 
 
 
260 aa  319  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15363  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_809  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  60.23 
 
 
276 aa  319  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5007  ABC transporter related  61.04 
 
 
261 aa  319  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  62.25 
 
 
269 aa  318  7e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2724  ABC transporter related  61.45 
 
 
277 aa  317  9e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.407856 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  60.94 
 
 
277 aa  317  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3541  ABC transporter related  60.24 
 
 
260 aa  316  2e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3608  ABC transporter related  60.24 
 
 
261 aa  315  4e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  59.6 
 
 
289 aa  315  6e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  61.2 
 
 
294 aa  314  8e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4010  ABC transporter related  59.84 
 
 
272 aa  314  9.999999999999999e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0469  ABC transporter related  60.24 
 
 
261 aa  313  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.304191 
 
 
-
 
NC_002936  DET0938  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.62 
 
 
270 aa  312  2.9999999999999996e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0956002  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0460  ABC transporter related  60.24 
 
 
261 aa  312  2.9999999999999996e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0786  ABC transporter-related protein  60 
 
 
263 aa  310  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3435  ABC transporter-related protein  58.63 
 
 
264 aa  307  9e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000808082 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2360  ABC transporter related  59.23 
 
 
278 aa  305  5.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.547386 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3842  ABC transporter related  61.35 
 
 
289 aa  302  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000140209  normal  0.918006 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2281  ABC transporter related  60.32 
 
 
264 aa  298  6e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1542  ABC transporter related protein  61.69 
 
 
255 aa  298  8e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000371483  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0549  ABC transporter related  59.44 
 
 
265 aa  297  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0135  ABC transporter-like protein  61.29 
 
 
255 aa  292  3e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0114  ABC transporter related  59.84 
 
 
272 aa  289  4e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.95101  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0569  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  60.36 
 
 
255 aa  286  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.383942  normal  0.0445823 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5286  ABC transporter related  51.78 
 
 
283 aa  284  9e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2990  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.43 
 
 
264 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00578117  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.63 
 
 
277 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0300535  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2987  ABC transporter related  57.03 
 
 
277 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43540  ABC transporter, ATP binding component  54.76 
 
 
260 aa  277  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0288454  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3163  ABC transporter related protein  51.57 
 
 
292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5146  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  54.12 
 
 
296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3008  ABC transporter-related protein  54.37 
 
 
275 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00336682  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4097  ABC transporter related  50.39 
 
 
292 aa  261  6e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2376  ABC transporter-like protein  51.37 
 
 
251 aa  259  4e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1465  ABC transporter-like protein  50.6 
 
 
291 aa  257  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  49.4 
 
 
255 aa  257  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0759  ABC transporter related protein  50.4 
 
 
268 aa  256  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  49.4 
 
 
264 aa  255  6e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43780  ABC transporter, LivG family  53.78 
 
 
262 aa  255  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.430374  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  49.4 
 
 
265 aa  254  8e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3005  ABC transporter related  52.8 
 
 
256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2748  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.01 
 
 
266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.916728  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2442  ABC transporter related protein  51.79 
 
 
250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4938  ABC transporter related  48.43 
 
 
275 aa  250  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.584937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3030  ABC transporter related protein  50 
 
 
274 aa  250  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  48.21 
 
 
265 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  49.8 
 
 
273 aa  249  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  47.22 
 
 
268 aa  249  3e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4298  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.22 
 
 
305 aa  248  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  hitchhiker  0.00350718 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3501  ABC transporter related  47.64 
 
 
282 aa  247  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.111605  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  46.46 
 
 
261 aa  247  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7076  high-affinity branched-chain amino acid transport protein  45.42 
 
 
265 aa  246  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2544  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 
256 aa  245  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.234113 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3555  ABC transporter related  47.81 
 
 
265 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.520716  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3799  ABC transporter related  48.22 
 
 
256 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.718599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  46.06 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4240  ABC transporter related  46.22 
 
 
266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3491  ABC transporter related  47.43 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.411905  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  48.59 
 
 
250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2029  ABC transporter related  51 
 
 
261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0273  ABC transporter related  48.43 
 
 
253 aa  241  9e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197534  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6107  ABC transporter related  45.91 
 
 
261 aa  240  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.319085  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  44.98 
 
 
256 aa  239  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  47.41 
 
 
271 aa  240  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4818  ABC transporter related  45.74 
 
 
274 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177699  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1425  ABC transporter related  46.15 
 
 
253 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715565  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  48.03 
 
 
261 aa  239  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3832  ABC transporter related protein  48.37 
 
 
285 aa  240  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  46.99 
 
 
250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  45.85 
 
 
258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  46.22 
 
 
254 aa  239  4e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>