More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3364 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3364  ABC transporter related  100 
 
 
274 aa  564  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0250  ABC transporter related  82.95 
 
 
260 aa  454  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3435  ABC transporter-related protein  82.75 
 
 
264 aa  441  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000808082 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0215  ABC transporter-related protein  79.09 
 
 
313 aa  437  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0469  ABC transporter related  80.77 
 
 
261 aa  437  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.304191 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0460  ABC transporter related  80.38 
 
 
261 aa  435  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0261  ABC transporter related  76.75 
 
 
306 aa  434  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3608  ABC transporter related  79.07 
 
 
261 aa  432  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3541  ABC transporter related  79.07 
 
 
260 aa  429  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0603  ABC transporter related  79.07 
 
 
260 aa  428  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15363  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0786  ABC transporter-related protein  78.71 
 
 
263 aa  429  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2724  ABC transporter related  73.99 
 
 
277 aa  422  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.407856 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5007  ABC transporter related  80.38 
 
 
261 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1158  ABC transporter related  77.91 
 
 
261 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0375  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livG  72.43 
 
 
273 aa  416  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529081  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2278  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  72 
 
 
279 aa  410  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0953  ABC transporter related  74.14 
 
 
274 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.513158  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4010  ABC transporter related  73.95 
 
 
272 aa  408  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  71.9 
 
 
274 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  73.03 
 
 
269 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0114  ABC transporter related  71.7 
 
 
272 aa  382  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.95101  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0569  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  79.39 
 
 
255 aa  373  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.383942  normal  0.0445823 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5038  ABC transporter related  66.53 
 
 
286 aa  358  5e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0549  ABC transporter related  67.06 
 
 
265 aa  344  8e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2987  ABC transporter related  64.66 
 
 
277 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  64.26 
 
 
277 aa  332  4e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0300535  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  59.56 
 
 
269 aa  330  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  58.09 
 
 
270 aa  324  8.000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  57.72 
 
 
269 aa  322  6e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43540  ABC transporter, ATP binding component  61.9 
 
 
260 aa  318  5e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0288454  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2990  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.15 
 
 
264 aa  318  6e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00578117  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  58.57 
 
 
280 aa  314  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  57.58 
 
 
296 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5714  putative high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 
273 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  0.906173 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  57.94 
 
 
282 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  57.94 
 
 
275 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000404  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  58 
 
 
266 aa  303  1.0000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.428911  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3137  ABC transporter-related protein  59.13 
 
 
265 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1598  ABC transporter related protein  60.24 
 
 
260 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1831  ABC transporter related  58.8 
 
 
269 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2611  ABC transporter-related protein  58.33 
 
 
265 aa  300  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_809  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  53.76 
 
 
276 aa  301  1e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0822  ABC transporter related  54.41 
 
 
276 aa  300  2e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3417  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.54 
 
 
269 aa  299  4e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0938  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.01 
 
 
270 aa  298  6e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0956002  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0296  ABC transporter related  56.22 
 
 
269 aa  297  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  54.37 
 
 
277 aa  296  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  55.82 
 
 
276 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2309  ABC transporter related  56.22 
 
 
269 aa  294  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0078002 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43780  ABC transporter, LivG family  55.76 
 
 
262 aa  288  6e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.430374  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  52.78 
 
 
289 aa  288  8e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2748  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.54 
 
 
266 aa  285  7e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.916728  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3842  ABC transporter related  54.72 
 
 
289 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000140209  normal  0.918006 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3005  ABC transporter related  56.3 
 
 
256 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5146  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  51.11 
 
 
296 aa  278  5e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  52.38 
 
 
294 aa  278  9e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3491  ABC transporter related  53.17 
 
 
256 aa  277  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.411905  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2360  ABC transporter related  53.97 
 
 
278 aa  276  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.547386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3799  ABC transporter related  52.78 
 
 
256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.718599 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3510  ABC transporter component  52.8 
 
 
274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6107  ABC transporter related  49.6 
 
 
261 aa  271  7e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.319085  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7156  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  47.91 
 
 
264 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1542  ABC transporter related protein  51.79 
 
 
255 aa  264  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000371483  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0135  ABC transporter-like protein  53.78 
 
 
255 aa  264  1e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2544  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.57 
 
 
256 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.234113 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3008  ABC transporter-related protein  54.55 
 
 
275 aa  263  3e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00336682  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5286  ABC transporter related  48.12 
 
 
283 aa  263  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3873  ABC transporter related  53.97 
 
 
256 aa  260  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0725392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3832  ABC transporter related protein  49.6 
 
 
285 aa  256  4e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2281  ABC transporter related  51.81 
 
 
264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4298  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.41 
 
 
305 aa  251  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  hitchhiker  0.00350718 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1425  ABC transporter related  45.6 
 
 
253 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715565  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4097  ABC transporter related  45.86 
 
 
292 aa  246  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3163  ABC transporter related protein  47.58 
 
 
292 aa  246  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3030  ABC transporter related protein  45.8 
 
 
274 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0759  ABC transporter related protein  46.99 
 
 
268 aa  246  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2376  ABC transporter-like protein  46.22 
 
 
251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  46.62 
 
 
271 aa  242  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  44.91 
 
 
276 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4938  ABC transporter related  42.86 
 
 
275 aa  238  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.584937  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1465  ABC transporter-like protein  46.37 
 
 
291 aa  238  8e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  48 
 
 
273 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2442  ABC transporter related protein  44.98 
 
 
250 aa  236  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3501  ABC transporter related  44.88 
 
 
282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.111605  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1438  ABC transporter related  48.24 
 
 
310 aa  233  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409389  hitchhiker  0.00000418659 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  46.43 
 
 
257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4818  ABC transporter related  45.2 
 
 
274 aa  232  6e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177699  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  41.63 
 
 
263 aa  231  9e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  48.19 
 
 
261 aa  229  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  46.99 
 
 
258 aa  229  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  43.65 
 
 
264 aa  228  6e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  43.31 
 
 
259 aa  228  7e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  42.8 
 
 
265 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1114  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 
256 aa  228  8e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1001  ABC transporter related  46.18 
 
 
268 aa  227  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  44.84 
 
 
256 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  42.97 
 
 
261 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4240  ABC transporter related  44.22 
 
 
266 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  43.78 
 
 
261 aa  226  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  45.63 
 
 
257 aa  226  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>