More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1860 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  100 
 
 		 280 aa  569  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  80.16 
 
 		 276 aa  434  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  78.24 
 
 		 296 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  78.24 
 
 		 282 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0296  ABC transporter related  76.32 
 
 		 269 aa  427  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5714  putative high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  80.95 
 
 		 273 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  0.906173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2309  ABC transporter related  77.44 
 
 		 269 aa  428  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0078002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  80.16 
 
 		 275 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1831  ABC transporter related  76.06 
 
 		 269 aa  424  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000404  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  75.19 
 
 		 266 aa  417  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.428911  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3417  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  73.78 
 
 		 269 aa  414  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3137  ABC transporter-related protein  77.87 
 
 		 265 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3510  ABC transporter component  72.56 
 
 		 274 aa  410  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2611  ABC transporter-related protein  77.25 
 
 		 265 aa  410  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1598  ABC transporter related protein  65.6 
 
 		 260 aa  333  1e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  59.33 
 
 		 274 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5038  ABC transporter related  60.08 
 
 		 286 aa  318  9e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0261  ABC transporter related  59.53 
 
 		 306 aa  317  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0953  ABC transporter related  60.71 
 
 		 274 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.513158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2278  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  60.71 
 
 		 279 aa  316  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0250  ABC transporter related  60.96 
 
 		 260 aa  315  4e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  59.23 
 
 		 269 aa  315  4e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2724  ABC transporter related  57.09 
 
 		 277 aa  315  4e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.407856 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  58.78 
 
 		 270 aa  315  7e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0469  ABC transporter related  60.56 
 
 		 261 aa  313  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.304191 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3364  ABC transporter related  58.57 
 
 		 274 aa  314  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0375  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livG  60.32 
 
 		 273 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0460  ABC transporter related  60.16 
 
 		 261 aa  311  5.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0215  ABC transporter-related protein  59.6 
 
 		 313 aa  310  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3608  ABC transporter related  58.96 
 
 		 261 aa  310  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  58.96 
 
 		 269 aa  309  2.9999999999999997e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  57.09 
 
 		 269 aa  309  4e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0603  ABC transporter related  58.17 
 
 		 260 aa  308  5.9999999999999995e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1158  ABC transporter related  58.96 
 
 		 261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_809  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  53.31 
 
 		 276 aa  306  3e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3435  ABC transporter-related protein  58.8 
 
 		 264 aa  305  7e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000808082 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0822  ABC transporter related  52.94 
 
 		 276 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  55.6 
 
 		 294 aa  303  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5007  ABC transporter related  58.17 
 
 		 261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  55.13 
 
 		 277 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  53.85 
 
 		 289 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3541  ABC transporter related  57.77 
 
 		 260 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0786  ABC transporter-related protein  56.02 
 
 		 263 aa  300  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4010  ABC transporter related  57.6 
 
 		 272 aa  298  7e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0938  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.03 
 
 		 270 aa  294  1e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0956002  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3842  ABC transporter related  53.91 
 
 		 289 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000140209  normal  0.918006 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0549  ABC transporter related  54.65 
 
 		 265 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2360  ABC transporter related  53.12 
 
 		 278 aa  280  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.547386 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2281  ABC transporter related  54.47 
 
 		 264 aa  278  9e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0114  ABC transporter related  58 
 
 		 272 aa  276  3e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.95101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0135  ABC transporter-like protein  56.97 
 
 		 255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1542  ABC transporter related protein  56.18 
 
 		 255 aa  271  8.000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000371483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3008  ABC transporter-related protein  52.06 
 
 		 275 aa  271  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00336682  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2987  ABC transporter related  55.2 
 
 		 277 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0569  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  56.36 
 
 		 255 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.383942  normal  0.0445823 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.8 
 
 		 277 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0300535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43540  ABC transporter, ATP binding component  52.94 
 
 		 260 aa  267  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0288454  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5286  ABC transporter related  50.59 
 
 		 283 aa  261  6.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2990  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.79 
 
 		 264 aa  258  9e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00578117  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4097  ABC transporter related  47.45 
 
 		 292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3832  ABC transporter related protein  48.46 
 
 		 285 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2748  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.18 
 
 		 266 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.916728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3005  ABC transporter related  51.19 
 
 		 256 aa  248  6e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3163  ABC transporter related protein  46.67 
 
 		 292 aa  246  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5146  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  49.4 
 
 		 296 aa  246  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43780  ABC transporter, LivG family  50.6 
 
 		 262 aa  244  9e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.430374  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2442  ABC transporter related protein  49.6 
 
 		 250 aa  244  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6107  ABC transporter related  46.97 
 
 		 261 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.319085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3501  ABC transporter related  49.03 
 
 		 282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.111605  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2544  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.22 
 
 		 256 aa  242  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.234113 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  47.15 
 
 		 273 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2376  ABC transporter-like protein  47.83 
 
 		 251 aa  241  7.999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4938  ABC transporter related  46.9 
 
 		 275 aa  241  9e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.584937  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7156  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  46.74 
 
 		 264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1465  ABC transporter-like protein  47.79 
 
 		 291 aa  239  4e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1425  ABC transporter related  45.63 
 
 		 253 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715565  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0759  ABC transporter related protein  46.59 
 
 		 268 aa  236  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  42.6 
 
 		 284 aa  236  3e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  47.43 
 
 		 271 aa  236  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1001  ABC transporter related  46.56 
 
 		 268 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  45.63 
 
 		 264 aa  233  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  41.88 
 
 		 284 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  45.63 
 
 		 265 aa  232  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  47.2 
 
 		 255 aa  231  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2737  ABC transporter related  42.75 
 
 		 268 aa  230  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4818  ABC transporter related  46.43 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3030  ABC transporter related protein  44.79 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4240  ABC transporter related  43.92 
 
 		 266 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  44.76 
 
 		 268 aa  229  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7076  high-affinity branched-chain amino acid transport protein  43.89 
 
 		 265 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  42.8 
 
 		 265 aa  228  9e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  43.58 
 
 		 262 aa  227  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  45.45 
 
 		 271 aa  226  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0677  ABC transporter related  46.77 
 
 		 260 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.888321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  43.92 
 
 		 256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  44.8 
 
 		 270 aa  225  7e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2029  ABC transporter related  48.83 
 
 		 261 aa  225  7e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  43.82 
 
 		 261 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  42.69 
 
 		 263 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3799  ABC transporter related  46.36 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.718599 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>