More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0759 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0759  ABC transporter related protein  100 
 
 
268 aa  531  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3030  ABC transporter related protein  80.84 
 
 
274 aa  421  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1465  ABC transporter-like protein  80.08 
 
 
291 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3163  ABC transporter related protein  79.6 
 
 
292 aa  402  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3832  ABC transporter related protein  67.19 
 
 
285 aa  337  9e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  51.39 
 
 
269 aa  263  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  53.01 
 
 
289 aa  256  4e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3842  ABC transporter related  53.67 
 
 
289 aa  256  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000140209  normal  0.918006 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  52.31 
 
 
277 aa  256  4e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  49.21 
 
 
274 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  54.62 
 
 
294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  49.2 
 
 
269 aa  253  3e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3555  ABC transporter related  51 
 
 
265 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.520716  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  50 
 
 
282 aa  251  6e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  49.6 
 
 
270 aa  251  7e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  48.59 
 
 
269 aa  251  9.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  49.6 
 
 
296 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0953  ABC transporter related  48.41 
 
 
274 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.513158  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2278  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.41 
 
 
279 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7076  high-affinity branched-chain amino acid transport protein  51.81 
 
 
265 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  50.39 
 
 
265 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4240  ABC transporter related  49.8 
 
 
266 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  49.6 
 
 
275 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1001  ABC transporter related  52.57 
 
 
268 aa  249  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3435  ABC transporter-related protein  47.6 
 
 
264 aa  248  6e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000808082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1158  ABC transporter related  47.39 
 
 
261 aa  248  7e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2309  ABC transporter related  51.41 
 
 
269 aa  248  9e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0078002 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  50.79 
 
 
276 aa  247  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3541  ABC transporter related  46.99 
 
 
260 aa  247  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0469  ABC transporter related  46.8 
 
 
261 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.304191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5714  putative high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.6 
 
 
273 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  0.906173 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0603  ABC transporter related  47.18 
 
 
260 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15363  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0460  ABC transporter related  46.8 
 
 
261 aa  246  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2724  ABC transporter related  48 
 
 
277 aa  245  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.407856 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3364  ABC transporter related  46.99 
 
 
274 aa  246  4e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5007  ABC transporter related  47.58 
 
 
261 aa  245  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2990  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.21 
 
 
264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00578117  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0375  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livG  46.43 
 
 
273 aa  245  6.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529081  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0250  ABC transporter related  46.99 
 
 
260 aa  244  8e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4010  ABC transporter related  47.06 
 
 
272 aa  244  8e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  49.4 
 
 
276 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0261  ABC transporter related  48.4 
 
 
306 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6107  ABC transporter related  48.8 
 
 
261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.319085  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  50 
 
 
273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43540  ABC transporter, ATP binding component  49.03 
 
 
260 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0288454  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0296  ABC transporter related  50.2 
 
 
269 aa  242  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4818  ABC transporter related  51.81 
 
 
274 aa  242  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177699  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  49.2 
 
 
255 aa  242  6e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0786  ABC transporter-related protein  46.74 
 
 
263 aa  241  7e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3608  ABC transporter related  45.6 
 
 
261 aa  240  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  50.98 
 
 
275 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  50.98 
 
 
275 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  50.98 
 
 
275 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0549  ABC transporter related  49.19 
 
 
265 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  49.01 
 
 
283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2987  ABC transporter related  46.85 
 
 
277 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0215  ABC transporter-related protein  48.4 
 
 
313 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.46 
 
 
277 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0300535  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  47.58 
 
 
256 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43780  ABC transporter, LivG family  51.78 
 
 
262 aa  239  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.430374  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  49.41 
 
 
293 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  48.19 
 
 
258 aa  238  8e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  47.86 
 
 
271 aa  238  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2748  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.59 
 
 
266 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.916728  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2360  ABC transporter related  50.8 
 
 
278 aa  237  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.547386 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2268  ABC transporter related  53.05 
 
 
262 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.434627  decreased coverage  0.00162775 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1598  ABC transporter related protein  50.4 
 
 
260 aa  237  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0356  ABC transporter related  50 
 
 
290 aa  238  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3799  ABC transporter related  50 
 
 
256 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.718599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  49.22 
 
 
258 aa  237  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3005  ABC transporter related  52.19 
 
 
256 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  46.59 
 
 
280 aa  236  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5146  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  49.8 
 
 
296 aa  236  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4938  ABC transporter related  46.13 
 
 
275 aa  235  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.584937  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2281  ABC transporter related  53.63 
 
 
264 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5038  ABC transporter related  48.21 
 
 
286 aa  234  8e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  45.34 
 
 
268 aa  234  9e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  44.94 
 
 
270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0114  ABC transporter related  46.83 
 
 
272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.95101  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  47.83 
 
 
261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  48.25 
 
 
261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1831  ABC transporter related  44.87 
 
 
269 aa  233  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2544  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.43 
 
 
256 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.234113 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  45.25 
 
 
265 aa  232  6e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3510  ABC transporter component  46.88 
 
 
274 aa  231  6e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3491  ABC transporter related  48.79 
 
 
256 aa  232  6e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.411905  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1481  ABC transporter related  48.82 
 
 
259 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1425  ABC transporter related  47.39 
 
 
253 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715565  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.81 
 
 
256 aa  230  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  47.39 
 
 
258 aa  230  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  48.06 
 
 
294 aa  229  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0365  ABC transporter related  45.2 
 
 
253 aa  229  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000174953  unclonable  0.0000000581692 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000404  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  46.18 
 
 
266 aa  229  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.428911  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  44.1 
 
 
302 aa  228  6e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  48.99 
 
 
271 aa  228  6e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  46.37 
 
 
255 aa  228  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  46.83 
 
 
256 aa  228  6e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  43.4 
 
 
307 aa  228  9e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  46.4 
 
 
264 aa  228  9e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3501  ABC transporter related  46.42 
 
 
282 aa  228  9e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.111605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>