More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3510 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3510  ABC transporter component  100 
 
 		 274 aa  558  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  72.56 
 
 		 280 aa  410  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  75.1 
 
 		 276 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0296  ABC transporter related  75.77 
 
 		 269 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2309  ABC transporter related  75 
 
 		 269 aa  394  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0078002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  75.49 
 
 		 275 aa  394  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5714  putative high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  73.91 
 
 		 273 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  0.906173 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  75.1 
 
 		 282 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  71.59 
 
 		 296 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000404  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  71.6 
 
 		 266 aa  385  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.428911  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3417  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  70.19 
 
 		 269 aa  382  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1831  ABC transporter related  70.16 
 
 		 269 aa  383  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2611  ABC transporter-related protein  70.27 
 
 		 265 aa  371  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3137  ABC transporter-related protein  70.59 
 
 		 265 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1598  ABC transporter related protein  65.2 
 
 		 260 aa  325  5e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  57.79 
 
 		 269 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  60 
 
 		 269 aa  310  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  58.73 
 
 		 270 aa  308  5e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  58.59 
 
 		 294 aa  297  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  57.2 
 
 		 289 aa  295  6e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0215  ABC transporter-related protein  56.8 
 
 		 313 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  56.59 
 
 		 277 aa  292  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0261  ABC transporter related  55.6 
 
 		 306 aa  290  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  56.69 
 
 		 274 aa  289  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2724  ABC transporter related  54.37 
 
 		 277 aa  287  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.407856 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0953  ABC transporter related  56.3 
 
 		 274 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.513158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2278  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  56.3 
 
 		 279 aa  285  5e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5007  ABC transporter related  56.4 
 
 		 261 aa  285  7e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5038  ABC transporter related  56.75 
 
 		 286 aa  285  8e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2281  ABC transporter related  56.49 
 
 		 264 aa  283  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0786  ABC transporter-related protein  56.8 
 
 		 263 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2360  ABC transporter related  56.08 
 
 		 278 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.547386 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0603  ABC transporter related  55.6 
 
 		 260 aa  282  4.0000000000000003e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3842  ABC transporter related  55.08 
 
 		 289 aa  282  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000140209  normal  0.918006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1158  ABC transporter related  54.8 
 
 		 261 aa  281  7.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4010  ABC transporter related  53.94 
 
 		 272 aa  281  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0250  ABC transporter related  54.4 
 
 		 260 aa  278  6e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3608  ABC transporter related  54 
 
 		 261 aa  277  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  54.4 
 
 		 269 aa  276  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0460  ABC transporter related  54 
 
 		 261 aa  276  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0469  ABC transporter related  54 
 
 		 261 aa  275  4e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.304191 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3541  ABC transporter related  54.4 
 
 		 260 aa  275  5e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3435  ABC transporter-related protein  54.8 
 
 		 264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000808082 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0822  ABC transporter related  48 
 
 		 276 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3364  ABC transporter related  52.8 
 
 		 274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_809  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  48.2 
 
 		 276 aa  273  3e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0375  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livG  54 
 
 		 273 aa  272  4.0000000000000004e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529081  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0938  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.78 
 
 		 270 aa  268  8.999999999999999e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0956002  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0135  ABC transporter-like protein  54.72 
 
 		 255 aa  255  4e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0569  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  54.35 
 
 		 255 aa  256  4e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.383942  normal  0.0445823 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5286  ABC transporter related  49.8 
 
 		 283 aa  256  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0549  ABC transporter related  51 
 
 		 265 aa  255  5e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2987  ABC transporter related  50 
 
 		 277 aa  254  8e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.62 
 
 		 277 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0300535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43540  ABC transporter, ATP binding component  51.16 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0288454  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1542  ABC transporter related protein  52.61 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000371483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0114  ABC transporter related  53.15 
 
 		 272 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.95101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3008  ABC transporter-related protein  48.63 
 
 		 275 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00336682  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2376  ABC transporter-like protein  48.06 
 
 		 251 aa  243  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2990  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 264 aa  241  9e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00578117  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2442  ABC transporter related protein  47.24 
 
 		 250 aa  241  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3163  ABC transporter related protein  48.21 
 
 		 292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3030  ABC transporter related protein  46.24 
 
 		 274 aa  239  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43780  ABC transporter, LivG family  48.83 
 
 		 262 aa  236  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.430374  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2544  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.41 
 
 		 256 aa  234  9e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.234113 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3832  ABC transporter related protein  44.78 
 
 		 285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4818  ABC transporter related  45.82 
 
 		 274 aa  232  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3005  ABC transporter related  48.81 
 
 		 256 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0759  ABC transporter related protein  46.88 
 
 		 268 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5146  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  49.03 
 
 		 296 aa  231  8.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2748  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.81 
 
 		 266 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.916728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3799  ABC transporter related  48.02 
 
 		 256 aa  230  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.718599 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1465  ABC transporter-like protein  45.86 
 
 		 291 aa  230  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  45.88 
 
 		 273 aa  228  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3491  ABC transporter related  46.83 
 
 		 256 aa  227  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.411905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  45.02 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  45.42 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4097  ABC transporter related  43.01 
 
 		 292 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  41.92 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  43.14 
 
 		 265 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6107  ABC transporter related  44.8 
 
 		 261 aa  223  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.319085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4298  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.96 
 
 		 305 aa  221  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  hitchhiker  0.00350718 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4240  ABC transporter related  42.41 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  43.41 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3873  ABC transporter related  48.02 
 
 		 256 aa  218  6e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0725392 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  44 
 
 		 255 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7076  high-affinity branched-chain amino acid transport protein  42.91 
 
 		 265 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  43.15 
 
 		 268 aa  217  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1001  ABC transporter related  44.14 
 
 		 268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2029  ABC transporter related  48.8 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  42.8 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  44.02 
 
 		 270 aa  215  5e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3555  ABC transporter related  42.35 
 
 		 265 aa  214  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.520716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  44.14 
 
 		 258 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1481  ABC transporter related  46.06 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  39.69 
 
 		 259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  39.08 
 
 		 263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  40.86 
 
 		 261 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  45.42 
 
 		 250 aa  211  7e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  40.37 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>