More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2724 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2724  ABC transporter related  100 
 
 		 277 aa  572  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.407856 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0261  ABC transporter related  80.36 
 
 		 306 aa  460  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0215  ABC transporter-related protein  78.47 
 
 		 313 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0250  ABC transporter related  78.76 
 
 		 260 aa  430  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3364  ABC transporter related  73.99 
 
 		 274 aa  422  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  69.68 
 
 		 274 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2278  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  70.94 
 
 		 279 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0953  ABC transporter related  72.09 
 
 		 274 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.513158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5007  ABC transporter related  75.19 
 
 		 261 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0375  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livG  71.65 
 
 		 273 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3435  ABC transporter-related protein  73.26 
 
 		 264 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000808082 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4010  ABC transporter related  71.43 
 
 		 272 aa  391  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0603  ABC transporter related  72.48 
 
 		 260 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0469  ABC transporter related  72.97 
 
 		 261 aa  392  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.304191 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3541  ABC transporter related  71.81 
 
 		 260 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0460  ABC transporter related  72.59 
 
 		 261 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  70.3 
 
 		 269 aa  388  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0786  ABC transporter-related protein  71.92 
 
 		 263 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3608  ABC transporter related  72.09 
 
 		 261 aa  388  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1158  ABC transporter related  70.54 
 
 		 261 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0114  ABC transporter related  69.35 
 
 		 272 aa  360  1e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.95101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0569  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  75.55 
 
 		 255 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.383942  normal  0.0445823 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5038  ABC transporter related  67.07 
 
 		 286 aa  344  8e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0549  ABC transporter related  64.29 
 
 		 265 aa  330  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  62.95 
 
 		 269 aa  328  6e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2987  ABC transporter related  64.26 
 
 		 277 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  63.86 
 
 		 277 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0300535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  57.09 
 
 		 280 aa  315  4e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  60.71 
 
 		 270 aa  315  4e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  57.63 
 
 		 269 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5714  putative high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.57 
 
 		 273 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  0.906173 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2990  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62 
 
 		 264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00578117  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  58.06 
 
 		 282 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43540  ABC transporter, ATP binding component  61.11 
 
 		 260 aa  311  7.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0288454  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  57.2 
 
 		 275 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  57.66 
 
 		 296 aa  308  5e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000404  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  59.6 
 
 		 266 aa  307  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.428911  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  56.18 
 
 		 276 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3417  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.2 
 
 		 269 aa  301  8.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2611  ABC transporter-related protein  58.57 
 
 		 265 aa  300  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1598  ABC transporter related protein  61.45 
 
 		 260 aa  299  3e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  57.37 
 
 		 277 aa  299  4e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1831  ABC transporter related  57.94 
 
 		 269 aa  298  6e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3137  ABC transporter-related protein  58 
 
 		 265 aa  297  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0296  ABC transporter related  55.78 
 
 		 269 aa  295  6e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_809  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  53.09 
 
 		 276 aa  293  2e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2309  ABC transporter related  56.18 
 
 		 269 aa  293  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0078002 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43780  ABC transporter, LivG family  58.73 
 
 		 262 aa  289  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.430374  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  53.18 
 
 		 289 aa  288  6e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3510  ABC transporter component  54.37 
 
 		 274 aa  287  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0822  ABC transporter related  51.89 
 
 		 276 aa  285  7e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0938  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.09 
 
 		 270 aa  285  8e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0956002  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2748  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  57.14 
 
 		 266 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.916728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3842  ABC transporter related  56.3 
 
 		 289 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000140209  normal  0.918006 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5146  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  54.84 
 
 		 296 aa  282  3.0000000000000004e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3005  ABC transporter related  56.75 
 
 		 256 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  54.76 
 
 		 294 aa  281  6.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1542  ABC transporter related protein  54.58 
 
 		 255 aa  270  1e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000371483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2360  ABC transporter related  54.98 
 
 		 278 aa  269  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.547386 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3491  ABC transporter related  51.59 
 
 		 256 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.411905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0135  ABC transporter-like protein  54.58 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3799  ABC transporter related  51.59 
 
 		 256 aa  267  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.718599 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5286  ABC transporter related  50.4 
 
 		 283 aa  265  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2281  ABC transporter related  54.62 
 
 		 264 aa  264  8.999999999999999e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6107  ABC transporter related  48.61 
 
 		 261 aa  263  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.319085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2544  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.59 
 
 		 256 aa  257  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.234113 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2376  ABC transporter-like protein  48.43 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3008  ABC transporter-related protein  52.53 
 
 		 275 aa  256  3e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00336682  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3873  ABC transporter related  53.17 
 
 		 256 aa  256  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0725392 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7156  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  48.21 
 
 		 264 aa  255  7e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4298  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.21 
 
 		 305 aa  254  9e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  hitchhiker  0.00350718 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3832  ABC transporter related protein  49.8 
 
 		 285 aa  251  6e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2442  ABC transporter related protein  47.43 
 
 		 250 aa  251  9.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0759  ABC transporter related protein  48 
 
 		 268 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3163  ABC transporter related protein  49.19 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4097  ABC transporter related  48.05 
 
 		 292 aa  243  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1425  ABC transporter related  44.4 
 
 		 253 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715565  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3030  ABC transporter related protein  45.2 
 
 		 274 aa  238  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1465  ABC transporter-like protein  46 
 
 		 291 aa  237  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1001  ABC transporter related  48.61 
 
 		 268 aa  236  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  44.66 
 
 		 255 aa  236  4e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  47.37 
 
 		 268 aa  236  4e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  47.41 
 
 		 273 aa  234  8e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  43.02 
 
 		 261 aa  234  8e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4818  ABC transporter related  46.4 
 
 		 274 aa  232  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  46.8 
 
 		 271 aa  232  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4938  ABC transporter related  43.75 
 
 		 275 aa  231  8.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.584937  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  44.96 
 
 		 276 aa  230  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  44.98 
 
 		 259 aa  229  5e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3256  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.23 
 
 		 255 aa  228  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.23 
 
 		 255 aa  228  6e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1438  ABC transporter related  46.64 
 
 		 310 aa  228  9e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409389  hitchhiker  0.00000418659 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  44.19 
 
 		 261 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3501  ABC transporter related  44.88 
 
 		 282 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.111605  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  42 
 
 		 263 aa  227  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  49.19 
 
 		 271 aa  227  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  47.39 
 
 		 261 aa  227  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  44.22 
 
 		 264 aa  227  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46 
 
 		 254 aa  227  2e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  42.44 
 
 		 612 aa  226  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>