More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5286 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5286  ABC transporter related  100 
 
 		 283 aa  581  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  52.34 
 
 		 269 aa  279  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  51.56 
 
 		 270 aa  276  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  52.78 
 
 		 274 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  53.97 
 
 		 276 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4010  ABC transporter related  51.59 
 
 		 272 aa  275  9e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0375  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livG  51.59 
 
 		 273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  49.26 
 
 		 296 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2278  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50.56 
 
 		 279 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0953  ABC transporter related  51.98 
 
 		 274 aa  271  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.513158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  50.94 
 
 		 269 aa  271  7e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0250  ABC transporter related  51.57 
 
 		 260 aa  271  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1598  ABC transporter related protein  51.78 
 
 		 260 aa  271  1e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  53.23 
 
 		 282 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  52.82 
 
 		 275 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  49.61 
 
 		 269 aa  267  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2724  ABC transporter related  50.4 
 
 		 277 aa  265  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.407856 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5714  putative high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.38 
 
 		 273 aa  265  8e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  0.906173 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0215  ABC transporter-related protein  48.2 
 
 		 313 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3364  ABC transporter related  48.12 
 
 		 274 aa  263  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5007  ABC transporter related  50 
 
 		 261 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  50.59 
 
 		 280 aa  261  6.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0261  ABC transporter related  49.24 
 
 		 306 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3435  ABC transporter-related protein  50.39 
 
 		 264 aa  259  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000808082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1158  ABC transporter related  50 
 
 		 261 aa  259  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3608  ABC transporter related  50 
 
 		 261 aa  257  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0469  ABC transporter related  50 
 
 		 261 aa  256  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.304191 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0296  ABC transporter related  51.81 
 
 		 269 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0786  ABC transporter-related protein  49.06 
 
 		 263 aa  256  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3510  ABC transporter component  49.8 
 
 		 274 aa  256  4e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0603  ABC transporter related  49.61 
 
 		 260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  49.61 
 
 		 277 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0460  ABC transporter related  49.61 
 
 		 261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3541  ABC transporter related  49.61 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2309  ABC transporter related  51.41 
 
 		 269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0078002 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0114  ABC transporter related  51.97 
 
 		 272 aa  252  6e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.95101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2611  ABC transporter-related protein  49.21 
 
 		 265 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000404  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  47.24 
 
 		 266 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.428911  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3137  ABC transporter-related protein  48.62 
 
 		 265 aa  248  6e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1831  ABC transporter related  48.22 
 
 		 269 aa  248  9e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5038  ABC transporter related  48.85 
 
 		 286 aa  246  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3417  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.64 
 
 		 269 aa  245  6.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2360  ABC transporter related  48.62 
 
 		 278 aa  244  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.547386 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0569  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  54.5 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.383942  normal  0.0445823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  47.31 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  45.04 
 
 		 289 aa  237  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3842  ABC transporter related  47.86 
 
 		 289 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000140209  normal  0.918006 
 
 
-
 
NC_002936  DET0938  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.7 
 
 		 270 aa  236  3e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0956002  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7076  high-affinity branched-chain amino acid transport protein  44.23 
 
 		 265 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1542  ABC transporter related protein  48.56 
 
 		 255 aa  236  5.0000000000000005e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000371483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0822  ABC transporter related  44.44 
 
 		 276 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_809  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  44.32 
 
 		 276 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4938  ABC transporter related  43.89 
 
 		 275 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.584937  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0135  ABC transporter-like protein  47.95 
 
 		 255 aa  232  7.000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0549  ABC transporter related  46.64 
 
 		 265 aa  232  7.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  45.02 
 
 		 271 aa  229  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5146  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  43.92 
 
 		 296 aa  229  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2987  ABC transporter related  46.4 
 
 		 277 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46 
 
 		 277 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0300535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  42.97 
 
 		 259 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43540  ABC transporter, ATP binding component  45.88 
 
 		 260 aa  226  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0288454  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0732  ABC transporter related  44.31 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  44 
 
 		 261 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  42.86 
 
 		 265 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3501  ABC transporter related  43.87 
 
 		 282 aa  223  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.111605  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2281  ABC transporter related  44.57 
 
 		 264 aa  223  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3008  ABC transporter-related protein  46.69 
 
 		 275 aa  223  4e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00336682  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4240  ABC transporter related  43.2 
 
 		 266 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  42.35 
 
 		 255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  41.96 
 
 		 255 aa  222  6e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  44.05 
 
 		 258 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  41.09 
 
 		 263 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3102  ABC transporter related  44.58 
 
 		 258 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  42.97 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  45.24 
 
 		 276 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4097  ABC transporter related  44.53 
 
 		 292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0356  ABC transporter related  42.91 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  43.37 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  44.31 
 
 		 261 aa  219  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3799  ABC transporter related  42.75 
 
 		 256 aa  219  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.718599 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  44.05 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  44.05 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3163  ABC transporter related protein  44.35 
 
 		 292 aa  219  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  44.05 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2990  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.86 
 
 		 264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00578117  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  43.65 
 
 		 258 aa  218  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.65 
 
 		 258 aa  218  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  42.29 
 
 		 264 aa  218  7e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  41.9 
 
 		 265 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  45.34 
 
 		 271 aa  218  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  42.58 
 
 		 257 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2544  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.35 
 
 		 256 aa  217  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.234113 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4818  ABC transporter related  42.06 
 
 		 274 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3555  ABC transporter related  40.93 
 
 		 265 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.520716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  41.96 
 
 		 258 aa  216  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  41.54 
 
 		 284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  42.29 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1114  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.94 
 
 		 256 aa  216  4e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1214  ABC transporter related  45.7 
 
 		 260 aa  216  4e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2309  ABC transporter related protein  42.13 
 
 		 271 aa  216  5e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.937555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>