More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0938 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0938  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 270 aa  547  1e-155  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0956002  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_809  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  93.7 
 
 		 276 aa  523  1e-147  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0822  ABC transporter related  93.33 
 
 		 276 aa  513  1e-144  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  57.3 
 
 		 269 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  56.93 
 
 		 270 aa  316  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  55.43 
 
 		 269 aa  306  3e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5007  ABC transporter related  53.76 
 
 		 261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3608  ABC transporter related  53.41 
 
 		 261 aa  302  5.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0603  ABC transporter related  53.38 
 
 		 260 aa  301  6.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0460  ABC transporter related  53.79 
 
 		 261 aa  300  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3541  ABC transporter related  52.65 
 
 		 260 aa  299  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0469  ABC transporter related  53.79 
 
 		 261 aa  299  4e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.304191 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3364  ABC transporter related  53.01 
 
 		 274 aa  298  6e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0786  ABC transporter-related protein  53.03 
 
 		 263 aa  296  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5038  ABC transporter related  55.94 
 
 		 286 aa  295  4e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1158  ABC transporter related  52.27 
 
 		 261 aa  294  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  53.03 
 
 		 280 aa  294  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1598  ABC transporter related protein  58.62 
 
 		 260 aa  293  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3435  ABC transporter-related protein  52.65 
 
 		 264 aa  292  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000808082 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0261  ABC transporter related  53.26 
 
 		 306 aa  291  6e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0215  ABC transporter-related protein  52.65 
 
 		 313 aa  290  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000404  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  52.27 
 
 		 266 aa  290  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.428911  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0250  ABC transporter related  53.79 
 
 		 260 aa  290  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  50.95 
 
 		 296 aa  285  5e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2309  ABC transporter related  51.89 
 
 		 269 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0078002 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  50.95 
 
 		 282 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  50.95 
 
 		 275 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2724  ABC transporter related  51.09 
 
 		 277 aa  285  8e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.407856 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3137  ABC transporter-related protein  51.31 
 
 		 265 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2611  ABC transporter-related protein  51.69 
 
 		 265 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0296  ABC transporter related  51.52 
 
 		 269 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4010  ABC transporter related  52.34 
 
 		 272 aa  283  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0375  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livG  52.11 
 
 		 273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  51.72 
 
 		 274 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  50.19 
 
 		 276 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  51.89 
 
 		 269 aa  281  7.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3417  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.81 
 
 		 269 aa  281  9e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0953  ABC transporter related  51.72 
 
 		 274 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.513158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2278  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.72 
 
 		 279 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0569  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  54.58 
 
 		 255 aa  279  3e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.383942  normal  0.0445823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5714  putative high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.94 
 
 		 273 aa  276  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  0.906173 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1831  ABC transporter related  50 
 
 		 269 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3510  ABC transporter component  47.78 
 
 		 274 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0135  ABC transporter-like protein  52.67 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1542  ABC transporter related protein  51.52 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000371483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  49.62 
 
 		 289 aa  265  8e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  49.81 
 
 		 277 aa  263  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0114  ABC transporter related  51.72 
 
 		 272 aa  260  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.95101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  47.37 
 
 		 294 aa  256  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3008  ABC transporter-related protein  51.12 
 
 		 275 aa  254  8e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00336682  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2360  ABC transporter related  47.96 
 
 		 278 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.547386 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2990  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.92 
 
 		 264 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00578117  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3842  ABC transporter related  49.43 
 
 		 289 aa  250  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000140209  normal  0.918006 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0549  ABC transporter related  47.51 
 
 		 265 aa  250  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43540  ABC transporter, ATP binding component  46.86 
 
 		 260 aa  242  6e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0288454  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2987  ABC transporter related  46.74 
 
 		 277 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.36 
 
 		 277 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0300535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2281  ABC transporter related  48.52 
 
 		 264 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5286  ABC transporter related  44.7 
 
 		 283 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3163  ABC transporter related protein  43.4 
 
 		 292 aa  225  6e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3799  ABC transporter related  45.32 
 
 		 256 aa  225  6e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.718599 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5146  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  44.06 
 
 		 296 aa  223  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3491  ABC transporter related  44.94 
 
 		 256 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.411905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6107  ABC transporter related  42.05 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.319085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43780  ABC transporter, LivG family  43.68 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.430374  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  41.51 
 
 		 273 aa  218  6e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  42.97 
 
 		 261 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3030  ABC transporter related protein  40.67 
 
 		 274 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  42.59 
 
 		 265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2544  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.04 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.234113 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3005  ABC transporter related  42.91 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2748  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.91 
 
 		 266 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.916728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3873  ABC transporter related  44.94 
 
 		 256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0725392 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  40.61 
 
 		 270 aa  212  4.9999999999999996e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1465  ABC transporter-like protein  41.22 
 
 		 291 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0759  ABC transporter related protein  40.67 
 
 		 268 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7076  high-affinity branched-chain amino acid transport protein  40.07 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3555  ABC transporter related  42.21 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.520716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  40.08 
 
 		 258 aa  208  8e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  39.92 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1425  ABC transporter related  38.02 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715565  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2376  ABC transporter-like protein  40.15 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3832  ABC transporter related protein  41.98 
 
 		 285 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5999  ABC transporter related protein  39.16 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.0205889 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4240  ABC transporter related  40.3 
 
 		 266 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4097  ABC transporter related  39.85 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  40.38 
 
 		 268 aa  206  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4298  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.38 
 
 		 305 aa  206  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  hitchhiker  0.00350718 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  40.53 
 
 		 259 aa  205  6e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0356  ABC transporter related  39.85 
 
 		 290 aa  205  6e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  41.92 
 
 		 259 aa  205  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2442  ABC transporter related protein  39.92 
 
 		 250 aa  204  9e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  39.85 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1001  ABC transporter related  41.44 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  44.53 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4938  ABC transporter related  38.83 
 
 		 275 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.584937  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0519  ABC transporter related  40.82 
 
 		 255 aa  204  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7156  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  40.68 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  42.8 
 
 		 256 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2477  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.85 
 
 		 255 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0920701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>