More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2376 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2376  ABC transporter-like protein  100 
 
 		 251 aa  501  1e-141  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2442  ABC transporter related protein  89.64 
 
 		 250 aa  447  1e-125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  52.4 
 
 		 277 aa  261  8e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0261  ABC transporter related  49.41 
 
 		 306 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  53.2 
 
 		 289 aa  257  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0215  ABC transporter-related protein  49.4 
 
 		 313 aa  256  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2724  ABC transporter related  48.43 
 
 		 277 aa  256  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.407856 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3842  ABC transporter related  52.59 
 
 		 289 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000140209  normal  0.918006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  52.4 
 
 		 294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2360  ABC transporter related  51.18 
 
 		 278 aa  252  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.547386 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5038  ABC transporter related  48.4 
 
 		 286 aa  249  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0549  ABC transporter related  51 
 
 		 265 aa  249  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000404  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  48 
 
 		 266 aa  248  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.428911  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  51.19 
 
 		 270 aa  248  9e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0603  ABC transporter related  46.64 
 
 		 260 aa  247  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3608  ABC transporter related  45.42 
 
 		 261 aa  246  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4010  ABC transporter related  48.41 
 
 		 272 aa  244  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5714  putative high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.59 
 
 		 273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  0.906173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  49.4 
 
 		 269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3510  ABC transporter component  48.06 
 
 		 274 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  47.39 
 
 		 276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3364  ABC transporter related  46.22 
 
 		 274 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0786  ABC transporter-related protein  46.43 
 
 		 263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1598  ABC transporter related protein  51.37 
 
 		 260 aa  243  3e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  48.8 
 
 		 274 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0375  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livG  47.01 
 
 		 273 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2987  ABC transporter related  47.88 
 
 		 277 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3541  ABC transporter related  46.3 
 
 		 260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.49 
 
 		 277 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0300535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3435  ABC transporter-related protein  44.75 
 
 		 264 aa  242  5e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000808082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  47.83 
 
 		 280 aa  241  6e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1158  ABC transporter related  45.06 
 
 		 261 aa  241  7e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0469  ABC transporter related  44.71 
 
 		 261 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.304191 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0460  ABC transporter related  44.71 
 
 		 261 aa  241  9e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0953  ABC transporter related  48 
 
 		 274 aa  240  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.513158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2278  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48 
 
 		 279 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5007  ABC transporter related  45.88 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3417  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.46 
 
 		 269 aa  239  4e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  47.39 
 
 		 282 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2309  ABC transporter related  48.59 
 
 		 269 aa  239  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0078002 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43540  ABC transporter, ATP binding component  48.41 
 
 		 260 aa  238  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0288454  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1831  ABC transporter related  46.85 
 
 		 269 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3137  ABC transporter-related protein  46.85 
 
 		 265 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  49.4 
 
 		 269 aa  238  8e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2990  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.59 
 
 		 264 aa  237  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00578117  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  46.99 
 
 		 275 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0296  ABC transporter related  47.39 
 
 		 269 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2611  ABC transporter-related protein  47.24 
 
 		 265 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0135  ABC transporter-like protein  51.6 
 
 		 255 aa  235  5.0000000000000005e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  45.59 
 
 		 269 aa  235  5.0000000000000005e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0250  ABC transporter related  43.53 
 
 		 260 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0114  ABC transporter related  46.51 
 
 		 272 aa  231  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.95101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  46.37 
 
 		 296 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43780  ABC transporter, LivG family  48.41 
 
 		 262 aa  230  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.430374  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3799  ABC transporter related  48.05 
 
 		 256 aa  230  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.718599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3005  ABC transporter related  48.63 
 
 		 256 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3491  ABC transporter related  47.27 
 
 		 256 aa  228  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.411905  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2748  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.61 
 
 		 266 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.916728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6107  ABC transporter related  47.06 
 
 		 261 aa  226  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.319085  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1542  ABC transporter related protein  50.79 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000371483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2281  ABC transporter related  49.6 
 
 		 264 aa  226  4e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2544  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.88 
 
 		 256 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.234113 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0569  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  46.29 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.383942  normal  0.0445823 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3873  ABC transporter related  48.44 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0725392 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7156  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  45.56 
 
 		 264 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0890  ABC transporter related  46 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  43.25 
 
 		 265 aa  212  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  47.01 
 
 		 261 aa  211  5.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  44.05 
 
 		 268 aa  211  7e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  44.31 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  43.25 
 
 		 264 aa  210  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5146  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  45.74 
 
 		 296 aa  209  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4298  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.83 
 
 		 305 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  hitchhiker  0.00350718 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3501  ABC transporter related  44.66 
 
 		 282 aa  208  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.111605  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  43.31 
 
 		 255 aa  208  8e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1425  ABC transporter related  42.63 
 
 		 253 aa  207  9e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715565  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  45.24 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_002936  DET0938  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.15 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0956002  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_809  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  39.77 
 
 		 276 aa  206  2e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0677  ABC transporter related  44.62 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.888321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5286  ABC transporter related  40.94 
 
 		 283 aa  206  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1518  ABC transporter related  43.53 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.121559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4552  ABC transporter related  44.62 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  42.06 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  41.96 
 
 		 270 aa  206  4e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  42.57 
 
 		 255 aa  205  5e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0822  ABC transporter related  39.54 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  44.98 
 
 		 252 aa  202  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  43.37 
 
 		 252 aa  202  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  41.77 
 
 		 259 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1114  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 		 256 aa  202  4e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.8 
 
 		 255 aa  202  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3256  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.8 
 
 		 255 aa  202  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4097  ABC transporter related  42.86 
 
 		 292 aa  201  9e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 		 254 aa  200  9.999999999999999e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3008  ABC transporter-related protein  42.35 
 
 		 275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00336682  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  42.35 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  40.94 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0483  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  39.77 
 
 		 261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  40.64 
 
 		 259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>