More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3435 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3435  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 264 aa  542  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000808082 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0460  ABC transporter related  91.09 
 
 		 261 aa  483  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0469  ABC transporter related  91.09 
 
 		 261 aa  484  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.304191 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3608  ABC transporter related  89.15 
 
 		 261 aa  474  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5007  ABC transporter related  88.08 
 
 		 261 aa  467  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3541  ABC transporter related  86.82 
 
 		 260 aa  467  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1158  ABC transporter related  86.82 
 
 		 261 aa  467  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0786  ABC transporter-related protein  86.59 
 
 		 263 aa  467  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0603  ABC transporter related  86.43 
 
 		 260 aa  464  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3364  ABC transporter related  82.75 
 
 		 274 aa  441  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0250  ABC transporter related  77.52 
 
 		 260 aa  412  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0569  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  86.03 
 
 		 255 aa  407  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.383942  normal  0.0445823 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0215  ABC transporter-related protein  76.86 
 
 		 313 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0261  ABC transporter related  76.08 
 
 		 306 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0953  ABC transporter related  71.1 
 
 		 274 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.513158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2724  ABC transporter related  73.26 
 
 		 277 aa  395  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.407856 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2278  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  71.65 
 
 		 279 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  72.87 
 
 		 269 aa  395  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  73.05 
 
 		 274 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4010  ABC transporter related  72.87 
 
 		 272 aa  387  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0375  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livG  70.54 
 
 		 273 aa  385  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0114  ABC transporter related  70.93 
 
 		 272 aa  368  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.95101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0549  ABC transporter related  65.48 
 
 		 265 aa  344  7e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5038  ABC transporter related  63.86 
 
 		 286 aa  339  2.9999999999999998e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2990  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.8 
 
 		 264 aa  329  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00578117  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  61.75 
 
 		 269 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  62 
 
 		 277 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0300535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2987  ABC transporter related  62.4 
 
 		 277 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43540  ABC transporter, ATP binding component  61.51 
 
 		 260 aa  322  5e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0288454  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  59.76 
 
 		 269 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  59.52 
 
 		 270 aa  318  7e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000404  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  60 
 
 		 266 aa  306  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.428911  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  59.27 
 
 		 296 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  58.87 
 
 		 275 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  58.8 
 
 		 280 aa  305  6e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  58.87 
 
 		 282 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5714  putative high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 		 273 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  0.906173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0296  ABC transporter related  58.23 
 
 		 269 aa  300  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2611  ABC transporter-related protein  59.52 
 
 		 265 aa  300  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3137  ABC transporter-related protein  59.52 
 
 		 265 aa  298  7e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  56.75 
 
 		 276 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3417  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58 
 
 		 269 aa  295  4e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2309  ABC transporter related  57.83 
 
 		 269 aa  295  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0078002 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1831  ABC transporter related  58.8 
 
 		 269 aa  295  4e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43780  ABC transporter, LivG family  58.82 
 
 		 262 aa  294  8e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.430374  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_809  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  53.41 
 
 		 276 aa  294  9e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0938  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.65 
 
 		 270 aa  292  3e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0956002  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0822  ABC transporter related  53.26 
 
 		 276 aa  292  3e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2748  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.69 
 
 		 266 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.916728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1598  ABC transporter related protein  58.63 
 
 		 260 aa  288  8e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3005  ABC transporter related  56.75 
 
 		 256 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  52.19 
 
 		 289 aa  280  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  53.39 
 
 		 277 aa  280  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5146  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  50.57 
 
 		 296 aa  278  7e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3510  ABC transporter component  54.8 
 
 		 274 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3842  ABC transporter related  54.15 
 
 		 289 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000140209  normal  0.918006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  51.79 
 
 		 294 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3799  ABC transporter related  51.17 
 
 		 256 aa  268  7e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.718599 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6107  ABC transporter related  48.63 
 
 		 261 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.319085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3491  ABC transporter related  50.39 
 
 		 256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.411905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0135  ABC transporter-like protein  54.18 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2360  ABC transporter related  51.76 
 
 		 278 aa  263  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.547386 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3008  ABC transporter-related protein  53.75 
 
 		 275 aa  263  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00336682  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7156  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  48.21 
 
 		 264 aa  262  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2544  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.79 
 
 		 256 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.234113 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2281  ABC transporter related  51.41 
 
 		 264 aa  259  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5286  ABC transporter related  50.39 
 
 		 283 aa  259  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1542  ABC transporter related protein  51.79 
 
 		 255 aa  258  5.0000000000000005e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000371483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4298  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.21 
 
 		 305 aa  257  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  hitchhiker  0.00350718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3873  ABC transporter related  51.56 
 
 		 256 aa  251  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0725392 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1438  ABC transporter related  51.35 
 
 		 310 aa  249  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409389  hitchhiker  0.00000418659 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0759  ABC transporter related protein  47.6 
 
 		 268 aa  248  6e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3832  ABC transporter related protein  48.59 
 
 		 285 aa  248  8e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1425  ABC transporter related  44.31 
 
 		 253 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715565  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4818  ABC transporter related  46.4 
 
 		 274 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2376  ABC transporter-like protein  44.75 
 
 		 251 aa  242  5e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3163  ABC transporter related protein  46.77 
 
 		 292 aa  242  6e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3030  ABC transporter related protein  46.8 
 
 		 274 aa  240  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1001  ABC transporter related  48.61 
 
 		 268 aa  240  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  47.2 
 
 		 273 aa  238  8e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4938  ABC transporter related  43.19 
 
 		 275 aa  235  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.584937  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1465  ABC transporter-like protein  46.37 
 
 		 291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  43.73 
 
 		 612 aa  232  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3555  ABC transporter related  42.8 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.520716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  42.91 
 
 		 271 aa  229  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2442  ABC transporter related protein  43.82 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4097  ABC transporter related  45.88 
 
 		 292 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  42.4 
 
 		 265 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4240  ABC transporter related  42.8 
 
 		 266 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  44.05 
 
 		 257 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7076  high-affinity branched-chain amino acid transport protein  40.87 
 
 		 265 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0365  ABC transporter related  42.8 
 
 		 253 aa  227  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000174953  unclonable  0.0000000581692 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0483  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  41.15 
 
 		 261 aa  226  3e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.43 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3256  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.43 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  43.65 
 
 		 257 aa  224  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4334  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.18 
 
 		 255 aa  224  9e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231493  normal  0.133886 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  41.34 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  40.96 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3501  ABC transporter related  42.13 
 
 		 282 aa  223  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.111605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>