More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5007 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5007  ABC transporter related  100 
 
 		 261 aa  536  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0460  ABC transporter related  89.66 
 
 		 261 aa  486  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0469  ABC transporter related  89.66 
 
 		 261 aa  486  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.304191 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1158  ABC transporter related  87.36 
 
 		 261 aa  479  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0603  ABC transporter related  89.19 
 
 		 260 aa  477  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3608  ABC transporter related  86.59 
 
 		 261 aa  470  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3435  ABC transporter-related protein  88.08 
 
 		 264 aa  467  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000808082 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3541  ABC transporter related  86.49 
 
 		 260 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0786  ABC transporter-related protein  86.87 
 
 		 263 aa  462  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3364  ABC transporter related  80.38 
 
 		 274 aa  424  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0215  ABC transporter-related protein  77.91 
 
 		 313 aa  413  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0261  ABC transporter related  76.74 
 
 		 306 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0569  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  86.4 
 
 		 255 aa  410  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.383942  normal  0.0445823 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0250  ABC transporter related  76.83 
 
 		 260 aa  403  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2724  ABC transporter related  75.19 
 
 		 277 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.407856 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0375  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livG  72.48 
 
 		 273 aa  388  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2278  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  71.71 
 
 		 279 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  71.6 
 
 		 274 aa  384  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4010  ABC transporter related  72.48 
 
 		 272 aa  384  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0953  ABC transporter related  71.71 
 
 		 274 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.513158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  72.48 
 
 		 269 aa  385  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0114  ABC transporter related  71.32 
 
 		 272 aa  357  9e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.95101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5038  ABC transporter related  66.67 
 
 		 286 aa  349  3e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0549  ABC transporter related  66.27 
 
 		 265 aa  338  5.9999999999999996e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  62.95 
 
 		 269 aa  336  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  61.35 
 
 		 269 aa  330  1e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  61.51 
 
 		 270 aa  329  3e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2987  ABC transporter related  64.8 
 
 		 277 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  64.4 
 
 		 277 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0300535  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2990  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.35 
 
 		 264 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00578117  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43540  ABC transporter, ATP binding component  61.51 
 
 		 260 aa  313  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0288454  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000404  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  59.52 
 
 		 266 aa  308  5e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.428911  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_809  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  54.92 
 
 		 276 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0822  ABC transporter related  54.79 
 
 		 276 aa  305  3e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3417  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.13 
 
 		 269 aa  306  3e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3137  ABC transporter-related protein  60.24 
 
 		 265 aa  305  6e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  57.47 
 
 		 296 aa  304  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2611  ABC transporter-related protein  60.24 
 
 		 265 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5714  putative high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.66 
 
 		 273 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  0.906173 
 
 
-
 
NC_002936  DET0938  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.76 
 
 		 270 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0956002  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  58 
 
 		 275 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  58.17 
 
 		 280 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  58 
 
 		 282 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0296  ABC transporter related  58.17 
 
 		 269 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1598  ABC transporter related protein  61.04 
 
 		 260 aa  300  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1831  ABC transporter related  59.13 
 
 		 269 aa  298  6e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2309  ABC transporter related  57.77 
 
 		 269 aa  295  5e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0078002 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  55.91 
 
 		 276 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43780  ABC transporter, LivG family  58.82 
 
 		 262 aa  288  5.0000000000000004e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.430374  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3510  ABC transporter component  56.4 
 
 		 274 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2748  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  57.09 
 
 		 266 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.916728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3005  ABC transporter related  56.69 
 
 		 256 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3842  ABC transporter related  55.78 
 
 		 289 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000140209  normal  0.918006 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  53.6 
 
 		 277 aa  278  7e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5146  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  53.41 
 
 		 296 aa  276  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  52.8 
 
 		 289 aa  276  4e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0135  ABC transporter-like protein  54.98 
 
 		 255 aa  272  4.0000000000000004e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1542  ABC transporter related protein  54.18 
 
 		 255 aa  271  6e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000371483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  52.19 
 
 		 294 aa  269  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2360  ABC transporter related  53.94 
 
 		 278 aa  268  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.547386 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3491  ABC transporter related  51.17 
 
 		 256 aa  268  7e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.411905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6107  ABC transporter related  49.01 
 
 		 261 aa  266  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.319085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3799  ABC transporter related  51.17 
 
 		 256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.718599 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7156  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  50.2 
 
 		 264 aa  265  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2281  ABC transporter related  53.41 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5286  ABC transporter related  50 
 
 		 283 aa  263  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3008  ABC transporter-related protein  53.75 
 
 		 275 aa  261  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00336682  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4298  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 305 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  hitchhiker  0.00350718 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2544  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.19 
 
 		 256 aa  259  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.234113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3873  ABC transporter related  51.95 
 
 		 256 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0725392 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1438  ABC transporter related  51.36 
 
 		 310 aa  249  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409389  hitchhiker  0.00000418659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3832  ABC transporter related protein  49.19 
 
 		 285 aa  248  8e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3163  ABC transporter related protein  47.98 
 
 		 292 aa  248  9e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3030  ABC transporter related protein  47.98 
 
 		 274 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0759  ABC transporter related protein  47.58 
 
 		 268 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1001  ABC transporter related  48.59 
 
 		 268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  48.8 
 
 		 273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2376  ABC transporter-like protein  45.88 
 
 		 251 aa  240  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  45.04 
 
 		 612 aa  239  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1425  ABC transporter related  43.9 
 
 		 253 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715565  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1465  ABC transporter-like protein  47.18 
 
 		 291 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4818  ABC transporter related  45.78 
 
 		 274 aa  235  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2442  ABC transporter related protein  45.38 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  43.78 
 
 		 270 aa  233  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  42.58 
 
 		 270 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  44 
 
 		 271 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4097  ABC transporter related  46.27 
 
 		 292 aa  229  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  44.4 
 
 		 258 aa  229  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.57 
 
 		 255 aa  229  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3256  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.57 
 
 		 255 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4938  ABC transporter related  42.19 
 
 		 275 aa  227  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.584937  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3555  ABC transporter related  42.97 
 
 		 265 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.520716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  42.97 
 
 		 265 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  43.02 
 
 		 262 aa  224  8e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5999  ABC transporter related protein  45.78 
 
 		 255 aa  224  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.0205889 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4240  ABC transporter related  42.57 
 
 		 266 aa  224  9e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  42.13 
 
 		 261 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3501  ABC transporter related  43.08 
 
 		 282 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.111605  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  42.8 
 
 		 265 aa  223  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  43.25 
 
 		 257 aa  222  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>