More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2586 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2586  ABC transporter related  100 
 
 		 237 aa  481  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1540  ABC transporter related  42.62 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  39.2 
 
 		 259 aa  192  5e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  47.66 
 
 		 241 aa  190  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2299  ABC transporter related  42.21 
 
 		 242 aa  190  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1850  ABC transporter related  43.51 
 
 		 244 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1951  ABC transporter related  43.1 
 
 		 244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1196  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.57 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1662  ABC transporter related  43.1 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2887  ABC transporter ATP-binding protein  41.18 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.42 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1098  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.57 
 
 		 241 aa  186  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.559592  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0144  ABC transporter related  42.74 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1499  ABC transporter related  39.92 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.229827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0732  ABC transporter related  40.16 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  38.89 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3617  ABC transporter related  42.26 
 
 		 244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.509048  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2143  ABC transporter related  41.6 
 
 		 257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4016  ABC transporter related  41.18 
 
 		 272 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  40.8 
 
 		 333 aa  181  8.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0845  ABC transporter related  45.38 
 
 		 241 aa  181  9.000000000000001e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.791281 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  38.8 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5639  ABC transporter related  41.25 
 
 		 253 aa  180  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2333  ABC transporter related protein  43.46 
 
 		 243 aa  180  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.552467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3397  ABC transporter related  40.59 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0271922 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  37.75 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3488  ABC transporter related protein  41.3 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3648  ABC transporter related  42.02 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6100  ABC transporter related  40 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0800  ABC transporter related  40.93 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3338  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  38.15 
 
 		 251 aa  176  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  39.04 
 
 		 259 aa  175  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7437  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.04 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1163  ABC transporter related  37.6 
 
 		 255 aa  174  9e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1930  ABC transporter related  42.02 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0463  ABC transporter related protein  35.6 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  40.4 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0511  ABC transporter related  39.66 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0526817  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1894  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  38.25 
 
 		 286 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0274473  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2202  ABC transporter related  40.43 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0565  ABC transporter related  37.55 
 
 		 255 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0274891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  37.05 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2129  ABC transporter related  41.6 
 
 		 244 aa  172  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.206631 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2014  ABC transporter related  38.58 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1521  ABC transporter related  44.35 
 
 		 242 aa  172  5e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000012745  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0546  ABC transporter related  43.46 
 
 		 242 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0891266  hitchhiker  0.0003203 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0360  ABC transporter related  43.15 
 
 		 243 aa  172  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1101  ABC transporter related  41.6 
 
 		 255 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00497633  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  39.2 
 
 		 265 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  39.2 
 
 		 265 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2941  ABC transporter related  42.17 
 
 		 604 aa  171  9e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147552  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3868  ABC transporter related  41.03 
 
 		 237 aa  171  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  37.05 
 
 		 265 aa  170  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  37.05 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  37.45 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0296  ABC transporter related  36.8 
 
 		 269 aa  169  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  37.2 
 
 		 250 aa  169  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  41.25 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0449  ABC transporter related  42.68 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  38.3 
 
 		 245 aa  169  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  39.2 
 
 		 261 aa  169  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  36.8 
 
 		 280 aa  169  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  37.65 
 
 		 264 aa  169  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  37.35 
 
 		 275 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  37.35 
 
 		 282 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0222  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  37.8 
 
 		 262 aa  168  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0519  ABC transporter related  36.4 
 
 		 255 aa  168  6e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  36.4 
 
 		 255 aa  168  7e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  37.75 
 
 		 257 aa  168  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1678  ABC transporter-like protein  41.35 
 
 		 238 aa  168  8e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.939026  normal  0.0800845 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0598  ABC transporter related  38.4 
 
 		 253 aa  168  8e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  37.2 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1114  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.01 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  39.04 
 
 		 270 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  37.6 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2008  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.08 
 
 		 239 aa  166  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.366522  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  36.47 
 
 		 265 aa  166  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  37.2 
 
 		 250 aa  166  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2496  ABC transporter related  39.92 
 
 		 243 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0963402  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  38.34 
 
 		 255 aa  166  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0311  ABC transporter related  40.44 
 
 		 237 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.382743  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  37.75 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  39.04 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  36.51 
 
 		 283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  38.65 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1599  ABC transporter related  39.41 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86219  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.71 
 
 		 594 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  38.71 
 
 		 594 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  38.71 
 
 		 594 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.71 
 
 		 594 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.71 
 
 		 594 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.71 
 
 		 594 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.71 
 
 		 594 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2309  ABC transporter related  36.65 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0078002 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0850  ATPase  38.24 
 
 		 242 aa  165  5e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1137  ABC transporter related  40.68 
 
 		 239 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.195731 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  36.9 
 
 		 293 aa  165  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  39.92 
 
 		 951 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  37.6 
 
 		 271 aa  165  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  38.49 
 
 		 240 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>