More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1662 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1662  ABC transporter related  100 
 
 		 243 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1850  ABC transporter related  89.75 
 
 		 244 aa  434  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3617  ABC transporter related  88.93 
 
 		 244 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.509048  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1951  ABC transporter related  87.5 
 
 		 244 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2887  ABC transporter ATP-binding protein  81.59 
 
 		 239 aa  400  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1499  ABC transporter related  68.64 
 
 		 244 aa  329  3e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.229827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2129  ABC transporter related  65.97 
 
 		 244 aa  298  8e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.206631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1101  ABC transporter related  65.25 
 
 		 255 aa  294  9e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00497633  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  51.68 
 
 		 245 aa  246  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  47.68 
 
 		 241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0311  ABC transporter related  47.21 
 
 		 237 aa  230  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.382743  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0898  ABC transporter related  48.52 
 
 		 245 aa  228  8e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2299  ABC transporter related  48.36 
 
 		 242 aa  226  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1709  ABC transporter related  47.48 
 
 		 245 aa  226  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.995593  normal  0.0343274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.79 
 
 		 248 aa  225  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1540  ABC transporter related  48.35 
 
 		 242 aa  224  9e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2333  ABC transporter related protein  49.79 
 
 		 243 aa  224  9e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.552467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1436  ABC transporter-related protein  49.36 
 
 		 239 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2427  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  48.51 
 
 		 239 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0800  ABC transporter related  49.36 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1531  ABC transporter related  49.36 
 
 		 239 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  44.54 
 
 		 240 aa  222  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2008  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.8 
 
 		 239 aa  221  8e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.366522  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0360  ABC transporter related  52.7 
 
 		 243 aa  217  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  47.58 
 
 		 261 aa  216  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1452  ABC transporter related  46.19 
 
 		 239 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  44.58 
 
 		 271 aa  214  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  45.97 
 
 		 275 aa  214  9e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  45.97 
 
 		 275 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  47.58 
 
 		 276 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  45.97 
 
 		 275 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1930  ABC transporter related  51.07 
 
 		 247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2282  ABC transporter related  49.16 
 
 		 239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  45.97 
 
 		 283 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  44.35 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  46.37 
 
 		 293 aa  210  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  47.58 
 
 		 280 aa  210  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  45.85 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0144  ABC transporter related  42.15 
 
 		 249 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  46.37 
 
 		 256 aa  209  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1678  ABC transporter-like protein  49.36 
 
 		 238 aa  209  5e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.939026  normal  0.0800845 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  46.37 
 
 		 333 aa  208  7e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1827  ABC transporter related  45.92 
 
 		 242 aa  208  7e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.017401  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  43.16 
 
 		 307 aa  208  7e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  43.2 
 
 		 258 aa  208  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0850  ATPase  45.76 
 
 		 242 aa  207  1e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  44.8 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  44.53 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0262  ABC transporter related  43.65 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3648  ABC transporter related  44.21 
 
 		 244 aa  206  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  43.43 
 
 		 255 aa  206  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  46.37 
 
 		 334 aa  206  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  42.57 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.2 
 
 		 256 aa  205  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  43.78 
 
 		 255 aa  205  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  44.13 
 
 		 258 aa  205  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  43.82 
 
 		 263 aa  205  6e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2143  ABC transporter related  44.9 
 
 		 257 aa  205  6e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1599  ABC transporter related  42.8 
 
 		 239 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86219  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  43.78 
 
 		 250 aa  204  8e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  44 
 
 		 265 aa  204  9e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  42.11 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3978  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  43.82 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1221  decreased coverage  0.00203887 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3397  ABC transporter related  45.64 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0271922 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  44.53 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  44 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  42.46 
 
 		 255 aa  202  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  42.35 
 
 		 259 aa  202  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  47.37 
 
 		 594 aa  202  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.32 
 
 		 258 aa  201  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  44 
 
 		 259 aa  201  6e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  42.19 
 
 		 257 aa  201  7e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  43.32 
 
 		 258 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  43.32 
 
 		 258 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  43.32 
 
 		 258 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  43.55 
 
 		 256 aa  200  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5973  ABC transporter related  42.86 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1098  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.03 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.559592  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  43.43 
 
 		 255 aa  200  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0795  ABC transporter related  46.38 
 
 		 253 aa  200  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.213138  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3142  ABC transporter related  43.72 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  49.16 
 
 		 594 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0694  inner-membrane translocator, ABC transporter related  48.99 
 
 		 583 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1114  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.29 
 
 		 256 aa  199  1.9999999999999998e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  45.45 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  42.8 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  43.2 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3658  ABC transporter related  42.63 
 
 		 254 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  43.78 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0355  ABC transporter related  44.94 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  46 
 
 		 278 aa  199  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0330  ABC transporter related  42.08 
 
 		 245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.813664 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  43.03 
 
 		 258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1137  ABC transporter related  43.4 
 
 		 239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.195731 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  48.32 
 
 		 594 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  48.32 
 
 		 594 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0824  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.72 
 
 		 257 aa  198  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2168  ABC transporter related  43.75 
 
 		 274 aa  198  6e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2496  ABC transporter related  45.96 
 
 		 243 aa  198  7e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0963402  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5639  ABC transporter related  44.35 
 
 		 253 aa  198  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>