More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2333 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2333  ABC transporter related protein  100 
 
 
243 aa  486  1e-136  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.552467  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1678  ABC transporter-like protein  74.68 
 
 
238 aa  340  1e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.939026  normal  0.0800845 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0800  ABC transporter related  63.45 
 
 
253 aa  287  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1951  ABC transporter related  49.16 
 
 
244 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1850  ABC transporter related  49.16 
 
 
244 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1662  ABC transporter related  49.79 
 
 
243 aa  224  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3617  ABC transporter related  48.74 
 
 
244 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.509048  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2887  ABC transporter ATP-binding protein  47.01 
 
 
239 aa  221  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1540  ABC transporter related  47.06 
 
 
242 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7437  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.51 
 
 
239 aa  219  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0144  ABC transporter related  47.03 
 
 
249 aa  218  5e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  47.48 
 
 
241 aa  218  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2299  ABC transporter related  47.06 
 
 
242 aa  216  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1499  ABC transporter related  46.47 
 
 
244 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.229827  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0311  ABC transporter related  45.99 
 
 
237 aa  208  7e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.382743  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6134  ABC transporter related  44.54 
 
 
239 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204704  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1101  ABC transporter related  50.64 
 
 
255 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00497633  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5538  ABC transporter related  48.09 
 
 
239 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0994391  hitchhiker  0.0000070517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.44 
 
 
248 aa  205  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1709  ABC transporter related  44.77 
 
 
245 aa  205  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.995593  normal  0.0343274 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0795  ABC transporter related  48.73 
 
 
253 aa  205  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.213138  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1907  ABC transporter related  48.95 
 
 
253 aa  202  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1098  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.86 
 
 
241 aa  202  5e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.559592  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0511  ABC transporter related  44.78 
 
 
238 aa  202  5e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0526817  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0330  ABC transporter related  43.04 
 
 
245 aa  201  9e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.813664 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1196  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.28 
 
 
244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2129  ABC transporter related  48.33 
 
 
244 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.206631 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  42.98 
 
 
240 aa  199  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  43.48 
 
 
256 aa  199  5e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  44.35 
 
 
245 aa  198  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 
256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1521  ABC transporter related  50 
 
 
242 aa  194  7e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000012745  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  44.77 
 
 
616 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  42.46 
 
 
264 aa  193  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  42.86 
 
 
265 aa  193  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  45.28 
 
 
256 aa  192  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0845  ABC transporter related  48.54 
 
 
241 aa  192  4e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.791281 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0546  ABC transporter related  50.42 
 
 
242 aa  191  7e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0891266  hitchhiker  0.0003203 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0898  ABC transporter related  43.28 
 
 
245 aa  191  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  42.17 
 
 
250 aa  191  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  40.51 
 
 
284 aa  191  8e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1930  ABC transporter related  46.64 
 
 
247 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211937  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  42.68 
 
 
603 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1599  ABC transporter related  43.22 
 
 
239 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86219  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  44.76 
 
 
608 aa  190  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  41.5 
 
 
257 aa  190  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  43.1 
 
 
609 aa  189  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2496  ABC transporter related  46.09 
 
 
243 aa  189  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0963402  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5244  ABC transporter ATP-binding protein  44.96 
 
 
243 aa  188  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.104577 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  40.15 
 
 
284 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  41.5 
 
 
257 aa  188  8e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  40 
 
 
271 aa  188  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  43.03 
 
 
268 aa  187  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1137  ABC transporter related  43.64 
 
 
239 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.195731 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.58 
 
 
257 aa  186  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  39.76 
 
 
256 aa  186  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4421  ABC transporter related  43.95 
 
 
259 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11811  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  41.9 
 
 
259 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4889  ABC transporter related  41.7 
 
 
250 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.782331 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  42.23 
 
 
256 aa  185  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2427  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  42.98 
 
 
239 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3648  ABC transporter related  43.04 
 
 
244 aa  186  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1452  ABC transporter related  42.37 
 
 
239 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4800  ABC transporter related  42.13 
 
 
251 aa  185  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.773333  normal  0.195705 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  42.35 
 
 
258 aa  185  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  42.35 
 
 
258 aa  185  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  44.62 
 
 
294 aa  185  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  41.25 
 
 
270 aa  184  8e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2282  ABC transporter related  40.68 
 
 
239 aa  184  8e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1519  ABC transporter related  44.94 
 
 
597 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0850  ATPase  40.85 
 
 
242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0449  ABC transporter related  47.28 
 
 
242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  44.66 
 
 
589 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2008  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.35 
 
 
239 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.366522  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.5 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.5 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1145  leucine/isoleucine/valine transport system ATP-binding protein  41.5 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00253052  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3094  ABC transporter related  41.6 
 
 
660 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0787  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.5 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0991  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.5 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  41.77 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3511  ABC transporter-related protein  42.8 
 
 
617 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0265  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.5 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000223083  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  41.77 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2029  ABC transporter related  43.37 
 
 
261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  40.96 
 
 
255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1827  ABC transporter related  40 
 
 
242 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.017401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  41.77 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  42.75 
 
 
254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5639  ABC transporter related  42.98 
 
 
253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0985  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.5 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000122559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  41.27 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0864  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.95 
 
 
241 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303052  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  39.76 
 
 
250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  42.63 
 
 
276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1436  ABC transporter-related protein  42.13 
 
 
239 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3397  ABC transporter related  44.49 
 
 
249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0271922 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3362  inner-membrane translocator:ABC transporter related  43.43 
 
 
613 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270874  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  42.86 
 
 
261 aa  181  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1531  ABC transporter related  42.13 
 
 
239 aa  181  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>