More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5244 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5244  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 243 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.104577 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6134  ABC transporter related  53.16 
 
 		 239 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204704  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7437  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.62 
 
 		 239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7088  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  47.64 
 
 		 253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5538  ABC transporter related  51.49 
 
 		 239 aa  204  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0994391  hitchhiker  0.0000070517 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2333  ABC transporter related protein  45.38 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.552467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4889  ABC transporter related  42.49 
 
 		 250 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.782331 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1678  ABC transporter-like protein  46.41 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.939026  normal  0.0800845 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4800  ABC transporter related  42.92 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.773333  normal  0.195705 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  43.04 
 
 		 241 aa  185  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1709  ABC transporter related  41.03 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.995593  normal  0.0343274 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0546  ABC transporter related  43.64 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0891266  hitchhiker  0.0003203 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0800  ABC transporter related  44.68 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1540  ABC transporter related  42.61 
 
 		 242 aa  182  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1521  ABC transporter related  43.64 
 
 		 242 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000012745  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0845  ABC transporter related  42.8 
 
 		 241 aa  181  7e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.791281 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  40.68 
 
 		 240 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0144  ABC transporter related  43.28 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5639  ABC transporter related  42.98 
 
 		 253 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0311  ABC transporter related  41.53 
 
 		 237 aa  178  7e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.382743  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2299  ABC transporter related  41.63 
 
 		 242 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  38.65 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  39.74 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0449  ABC transporter related  40.34 
 
 		 242 aa  172  5e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0850  ATPase  40.85 
 
 		 242 aa  171  6.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1565  ABC transporter related  41.08 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2887  ABC transporter ATP-binding protein  39.06 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1662  ABC transporter related  39.24 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  41.32 
 
 		 603 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3397  ABC transporter related  41.25 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0271922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1951  ABC transporter related  39.74 
 
 		 244 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1850  ABC transporter related  40.17 
 
 		 244 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1452  ABC transporter related  40.17 
 
 		 239 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  40.64 
 
 		 254 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2008  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.72 
 
 		 239 aa  168  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.366522  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2143  ABC transporter related  39.15 
 
 		 257 aa  168  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2427  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  38.89 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1384  ABC transporter related  38.96 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0904717 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  38.76 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3617  ABC transporter related  39.32 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.509048  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2364  ABC transporter related  40.43 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1098  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.09 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.559592  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1827  ABC transporter related  40.43 
 
 		 242 aa  166  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.017401  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0360  ABC transporter related  42.31 
 
 		 243 aa  165  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0898  ABC transporter related  38.46 
 
 		 245 aa  165  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  38.13 
 
 		 255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2496  ABC transporter related  40.17 
 
 		 243 aa  164  9e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0963402  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2282  ABC transporter related  37.55 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0330  ABC transporter related  40.34 
 
 		 245 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.813664 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0185  ABC transporter related  38.93 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3648  ABC transporter related  40.83 
 
 		 244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  36.61 
 
 		 275 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  36.61 
 
 		 275 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1938  ABC transporter related  38.11 
 
 		 494 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323376  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  36.61 
 
 		 275 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  37.5 
 
 		 261 aa  162  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  38.46 
 
 		 268 aa  163  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.95 
 
 		 254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1436  ABC transporter-related protein  38.03 
 
 		 239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1831  ABC transporter related  35.41 
 
 		 269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  37.21 
 
 		 264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1101  ABC transporter related  42.31 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00497633  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1531  ABC transporter related  38.03 
 
 		 239 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  38.34 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  38.71 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2314  ABC transporter related  37.3 
 
 		 249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  38.31 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1599  ABC transporter related  39.74 
 
 		 239 aa  161  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86219  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1930  ABC transporter related  41.84 
 
 		 247 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  37.7 
 
 		 271 aa  161  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1661  ABC transporter related  39.76 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0890  ABC transporter related  38 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0677  ABC transporter related  40.32 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.888321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  39.29 
 
 		 252 aa  161  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  38.34 
 
 		 254 aa  161  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4794  ABC transporter related  38.98 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.130359  normal  0.133792 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  37.15 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1196  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.09 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  36.47 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  37.7 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  36.82 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4217  ABC transporter related  42.28 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0795  ABC transporter related  39.74 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.213138  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4062  ABC transporter related  39.02 
 
 		 259 aa  159  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1137  ABC transporter related  39.74 
 
 		 239 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.195731 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1481  ABC transporter related  39.06 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3055  ABC transporter related  39.76 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.739746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  37.5 
 
 		 296 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  36.76 
 
 		 276 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  37.75 
 
 		 251 aa  158  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  37.15 
 
 		 261 aa  158  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  37.8 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2586  ABC transporter related  38.56 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  36.08 
 
 		 293 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  40.65 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1818  ABC transporter related  39.59 
 
 		 501 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.013948 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  37.55 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2129  ABC transporter related  41.45 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.206631 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2792  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.157718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>