More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7088 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7088  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  100 
 
 		 253 aa  513  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5244  ABC transporter ATP-binding protein  47.64 
 
 		 243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.104577 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4889  ABC transporter related  44.44 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.782331 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4800  ABC transporter related  44.07 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.773333  normal  0.195705 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7437  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.98 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6134  ABC transporter related  41.28 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204704  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0800  ABC transporter related  41 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2299  ABC transporter related  40.26 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1540  ABC transporter related  39.83 
 
 		 242 aa  166  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5538  ABC transporter related  42.13 
 
 		 239 aa  164  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0994391  hitchhiker  0.0000070517 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5639  ABC transporter related  39.57 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1098  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.76 
 
 		 241 aa  156  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.559592  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  36.6 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1599  ABC transporter related  37.61 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86219  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0144  ABC transporter related  36.97 
 
 		 249 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2333  ABC transporter related protein  37.71 
 
 		 243 aa  150  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.552467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1678  ABC transporter-like protein  40.43 
 
 		 238 aa  150  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.939026  normal  0.0800845 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.2 
 
 		 609 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1196  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.6 
 
 		 244 aa  148  7e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1137  ABC transporter related  37.18 
 
 		 239 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.195731 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0845  ABC transporter related  37.66 
 
 		 241 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.791281 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3055  ABC transporter related  34.66 
 
 		 270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.739746 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2496  ABC transporter related  35.71 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0963402  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0478  ABC transporter related  35.48 
 
 		 634 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3648  ABC transporter related  37.29 
 
 		 244 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2887  ABC transporter ATP-binding protein  36.68 
 
 		 239 aa  145  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2314  ABC transporter related  35.95 
 
 		 249 aa  144  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0330  ABC transporter related  35.44 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.813664 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  35.9 
 
 		 245 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0898  ABC transporter related  34.47 
 
 		 245 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1521  ABC transporter related  37.82 
 
 		 242 aa  144  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000012745  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  33.2 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  33.2 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  32.7 
 
 		 293 aa  142  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  37.66 
 
 		 603 aa  142  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3617  ABC transporter related  38.5 
 
 		 244 aa  141  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.509048  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  32.32 
 
 		 283 aa  141  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0546  ABC transporter related  37.82 
 
 		 242 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0891266  hitchhiker  0.0003203 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2309  ABC transporter related protein  34.36 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.937555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1930  ABC transporter related  37.97 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2364  ABC transporter related  35.32 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  33.2 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2586  ABC transporter related  35.17 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0449  ABC transporter related  35.59 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3142  ABC transporter related  32.67 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  32.79 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  33.47 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1653  ABC transporter related protein  32.31 
 
 		 610 aa  139  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487091  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1709  ABC transporter related  33.76 
 
 		 245 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.995593  normal  0.0343274 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1978  ABC transporter related  36.36 
 
 		 259 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.951957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  36.73 
 
 		 251 aa  139  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  34.14 
 
 		 256 aa  139  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  34.89 
 
 		 241 aa  139  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1951  ABC transporter related  38.5 
 
 		 244 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2143  ABC transporter related  36.36 
 
 		 257 aa  139  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1850  ABC transporter related  38.05 
 
 		 244 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4298  ABC transporter related  36.51 
 
 		 254 aa  138  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0360  ABC transporter related  37.18 
 
 		 243 aa  138  8.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0511  ABC transporter related  31.25 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0526817  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  31.94 
 
 		 275 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  33.07 
 
 		 333 aa  137  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1101  ABC transporter related  35.39 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00497633  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.55 
 
 		 258 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  34.38 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  31.5 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2282  ABC transporter related  33.05 
 
 		 239 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  32.8 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  32.03 
 
 		 275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  32.03 
 
 		 275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  32.39 
 
 		 258 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1662  ABC transporter related  37.17 
 
 		 243 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  32.39 
 
 		 258 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  32.39 
 
 		 258 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  32.41 
 
 		 258 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0659  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  33.6 
 
 		 269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  32.39 
 
 		 258 aa  135  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4328  ABC transporter related  34.92 
 
 		 269 aa  135  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  31.73 
 
 		 259 aa  135  9e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4217  ABC transporter related  33.73 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  30.4 
 
 		 258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  28.92 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  31.6 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0850  ATPase  32.05 
 
 		 242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0824  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  31.47 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  31.37 
 
 		 260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  35.44 
 
 		 272 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0006  ABC transporter related  31.73 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.112174 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4452  ABC transporter related  37.71 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133322  normal  0.130347 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0222  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  32.69 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  34.41 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  32.14 
 
 		 258 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  31.05 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1684  ABC transporter related  32.79 
 
 		 629 aa  133  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0459583  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4463  ABC transporter related  33.73 
 
 		 265 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.236919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2129  ABC transporter related  36.32 
 
 		 244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.206631 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  31.5 
 
 		 334 aa  132  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  31.2 
 
 		 257 aa  132  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2273  ABC transporter related  35.12 
 
 		 254 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.639311  normal  0.805195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  34.29 
 
 		 251 aa  132  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  31.85 
 
 		 255 aa  132  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>